RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 PNMA1Q8ND90 353 aa26.32■■□□□ 1.8
VSTM4-201ENST00000298454 TNMDQ9H2S6 317 aa26.32■■□□□ 1.8
VSTM4-201ENST00000298454 CLSTN2Q9H4D0 955 aa26.32■■□□□ 1.8
VSTM4-201ENST00000298454 CRKP46108 304 aa26.31■■□□□ 1.8
VSTM4-201ENST00000298454 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa26.31■■□□□ 1.8
VSTM4-201ENST00000298454 NOSTRINQ8IVI9 506 aa26.31■■□□□ 1.8
VSTM4-201ENST00000298454 VPS54Q9P1Q0 977 aa26.31■■□□□ 1.8
VSTM4-201ENST00000298454 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa26.31■■□□□ 1.8
VSTM4-201ENST00000298454 MYH1P12882 1939 aa26.31■■□□□ 1.8
VSTM4-201ENST00000298454 MAP3K11Q16584 847 aa26.31■■□□□ 1.8
VSTM4-201ENST00000298454 STX8Q9UNK0 236 aa26.31■■□□□ 1.8
VSTM4-201ENST00000298454 FOCADQ5VW36 1801 aa26.3■■□□□ 1.8
VSTM4-201ENST00000298454 KIAA2012Q0VF49 1180 aa26.3■■□□□ 1.8
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC178Q5BJE1 867 aa26.3■■□□□ 1.8
VSTM4-201ENST00000298454 ADALQ6DHV7 355 aa26.3■■□□□ 1.8
VSTM4-201ENST00000298454 CKAP2LQ8IYA6 745 aa26.3■■□□□ 1.8
VSTM4-201ENST00000298454 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa26.3■■□□□ 1.8
VSTM4-201ENST00000298454 SCN9AQ15858 1988 aa26.3■■□□□ 1.8
VSTM4-201ENST00000298454 NR5A1Q13285 461 aa26.3■■□□□ 1.8
VSTM4-201ENST00000298454 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa26.3■■□□□ 1.8
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VSTM4-201ENST00000298454 FSIP1Q8NA03 581 aa26.29■■□□□ 1.8
VSTM4-201ENST00000298454 OXER1Q8TDS5 423 aa26.29■■□□□ 1.8
VSTM4-201ENST00000298454 MAP3K14Q99558 947 aa26.29■■□□□ 1.8
VSTM4-201ENST00000298454 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
VSTM4-201ENST00000298454 SLC39A14Q15043 492 aa26.29■■□□□ 1.8
VSTM4-201ENST00000298454 NEDD1Q8NHV4 660 aa26.29■■□□□ 1.8
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM47Q9BQJ4 181 aa26.29■■□□□ 1.8
VSTM4-201ENST00000298454 KIF5BP33176 963 aa26.28■■□□□ 1.8
VSTM4-201ENST00000298454 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa26.28■■□□□ 1.8
VSTM4-201ENST00000298454 KLHL34Q8N239 644 aa26.28■■□□□ 1.8
VSTM4-201ENST00000298454 TTLL6Q8N841 843 aa26.28■■□□□ 1.8
VSTM4-201ENST00000298454 ENGASEQ8NFI3 743 aa26.28■■□□□ 1.8
VSTM4-201ENST00000298454 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
VSTM4-201ENST00000298454 STAG2Q8N3U4 1231 aa26.27■■□□□ 1.8
VSTM4-201ENST00000298454 ZDHHC15Q96MV8 337 aa26.27■■□□□ 1.8
VSTM4-201ENST00000298454 A0A1W2PQ27 194 aa26.27■■□□□ 1.8
VSTM4-201ENST00000298454 A0A1W2PQ64 194 aa26.27■■□□□ 1.8
VSTM4-201ENST00000298454 A0A1W2PQD8 194 aa26.27■■□□□ 1.8
VSTM4-201ENST00000298454 PPIP5K2O43314 1243 aa26.27■■□□□ 1.8
VSTM4-201ENST00000298454 XBP1P17861 261 aa26.27■■□□□ 1.8
VSTM4-201ENST00000298454 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
VSTM4-201ENST00000298454 GABPAQ06546 454 aa26.27■■□□□ 1.8
VSTM4-201ENST00000298454 NFIAQ12857 509 aa26.27■■□□□ 1.8
VSTM4-201ENST00000298454 PTPAQ15257 358 aa26.27■■□□□ 1.8
VSTM4-201ENST00000298454 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
VSTM4-201ENST00000298454 SLC16A10Q8TF71 515 aa26.27■■□□□ 1.8
VSTM4-201ENST00000298454 PIBF1Q8WXW3 757 aa26.27■■□□□ 1.8
VSTM4-201ENST00000298454 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
VSTM4-201ENST00000298454 PHF20Q9BVI0 1012 aa26.27■■□□□ 1.8
VSTM4-201ENST00000298454 MTMR7Q9Y216 660 aa26.27■■□□□ 1.8
VSTM4-201ENST00000298454 DPEP1P16444 411 aa26.26■■□□□ 1.79
VSTM4-201ENST00000298454 KCNA3P22001 575 aa26.26■■□□□ 1.79
VSTM4-201ENST00000298454 FAM160A1Q05DH4 1040 aa26.26■■□□□ 1.79
VSTM4-201ENST00000298454 SUPT20HQ8NEM7 779 aa26.26■■□□□ 1.79
VSTM4-201ENST00000298454 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
VSTM4-201ENST00000298454 MYH6P13533 1939 aa26.26■■□□□ 1.79
VSTM4-201ENST00000298454 A0A1B0GVL5 298 aa26.26■■□□□ 1.79
VSTM4-201ENST00000298454 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
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VSTM4-201ENST00000298454 MAD2L2Q9UI95 211 aa26.26■■□□□ 1.79
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC192P0DO97 292 aa26.25■■□□□ 1.79
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC173Q0VFZ6 552 aa26.25■■□□□ 1.79
VSTM4-201ENST00000298454 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
VSTM4-201ENST00000298454 CEP95Q96GE4 821 aa26.25■■□□□ 1.79
VSTM4-201ENST00000298454 YDJCA8MPS7 323 aa26.24■■□□□ 1.79
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VSTM4-201ENST00000298454 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP26.24■■□□□ 1.79
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VSTM4-201ENST00000298454 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
VSTM4-201ENST00000298454 NDUFA8P51970 172 aa26.24■■□□□ 1.79
VSTM4-201ENST00000298454 CACNB3P54284 484 aa26.24■■□□□ 1.79
VSTM4-201ENST00000298454 PPP1R9BQ96SB3 815 aa26.24■■□□□ 1.79
VSTM4-201ENST00000298454 RASGRP2Q7LDG7 609 aa26.23■■□□□ 1.79
VSTM4-201ENST00000298454 ZFPM1Q8IX07 1006 aa26.23■■□□□ 1.79
VSTM4-201ENST00000298454 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
VSTM4-201ENST00000298454 SCG2P13521 617 aa26.23■■□□□ 1.79
VSTM4-201ENST00000298454 TYRO3Q06418 890 aa26.23■■□□□ 1.79
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC93Q567U6 631 aa26.23■■□□□ 1.79
VSTM4-201ENST00000298454 SERPINB13Q9UIV8 391 aa26.23■■□□□ 1.79
VSTM4-201ENST00000298454 KINO60870 393 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
VSTM4-201ENST00000298454 PPP6R2O75170 966 aa26.22■■□□□ 1.79
VSTM4-201ENST00000298454 KRT2P35908 639 aa26.22■■□□□ 1.79
VSTM4-201ENST00000298454 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
VSTM4-201ENST00000298454 CABP5Q9NP86 173 aa26.22■■□□□ 1.79
VSTM4-201ENST00000298454 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
VSTM4-201ENST00000298454 RILPL1Q5EBL4 403 aa26.22■■□□□ 1.79
VSTM4-201ENST00000298454 MRVI1Q9Y6F6 885 aa26.22■■□□□ 1.79
VSTM4-201ENST00000298454 AKR1B1P15121 316 aa26.21■■□□□ 1.79
VSTM4-201ENST00000298454 NPY5RQ15761 445 aa26.21■■□□□ 1.79
VSTM4-201ENST00000298454 SLC35G1Q2M3R5 365 aa26.21■■□□□ 1.79
VSTM4-201ENST00000298454 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
VSTM4-201ENST00000298454 FAM205CA6NFA0 338 aa26.2■■□□□ 1.79
VSTM4-201ENST00000298454 ZBTB7AO95365 584 aa26.2■■□□□ 1.79
VSTM4-201ENST00000298454 GOLGA8HP0CJ92 632 aa26.2■■□□□ 1.79
VSTM4-201ENST00000298454 SLURP2P0DP57 97 aa26.2■■□□□ 1.79
VSTM4-201ENST00000298454 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.79
VSTM4-201ENST00000298454 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP26.2■■□□□ 1.78
VSTM4-201ENST00000298454 NOVP48745 357 aa26.2■■□□□ 1.78
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