RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295314.8

TMOD4-201, Transcript of tropomodulin 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD4, Length 1,267 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD4-201ENST00000295314 SIPA1L1O43166 1804 aa14.22□□□□□ -0.13
TMOD4-201ENST00000295314 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa14.21□□□□□ -0.13
TMOD4-201ENST00000295314 USP17L15C9J2P7 530 aa14.21□□□□□ -0.13
TMOD4-201ENST00000295314 USP17L13C9JLJ4 530 aa14.21□□□□□ -0.13
TMOD4-201ENST00000295314 USP17L11C9JVI0 530 aa14.21□□□□□ -0.13
TMOD4-201ENST00000295314 USP17L18D6R9N7 530 aa14.21□□□□□ -0.13
TMOD4-201ENST00000295314 USP17L22D6RA61 530 aa14.21□□□□□ -0.13
TMOD4-201ENST00000295314 USP17L17D6RBQ6 530 aa14.21□□□□□ -0.13
TMOD4-201ENST00000295314 USP17L19D6RCP7 530 aa14.21□□□□□ -0.13
TMOD4-201ENST00000295314 USP17L20D6RJB6 530 aa14.21□□□□□ -0.13
TMOD4-201ENST00000295314 M0R2C6 588 aa14.21□□□□□ -0.13
TMOD4-201ENST00000295314 GUCY1A2P33402 732 aa14.21□□□□□ -0.13
TMOD4-201ENST00000295314 TDO2P48775 406 aa14.21□□□□□ -0.13
TMOD4-201ENST00000295314 SOX10P56693 466 aa14.21□□□□□ -0.13
TMOD4-201ENST00000295314 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP14.21□□□□□ -0.13
TMOD4-201ENST00000295314 EVX2Q03828 476 aa14.21□□□□□ -0.13
TMOD4-201ENST00000295314 USP17L24Q0WX57 530 aa14.21□□□□□ -0.13
TMOD4-201ENST00000295314 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP14.21□□□□□ -0.13
TMOD4-201ENST00000295314 SLC44A5Q8NCS7 719 aa14.21□□□□□ -0.13
TMOD4-201ENST00000295314 RAET1EQ8TD07 263 aa14.21□□□□□ -0.13
TMOD4-201ENST00000295314 ARMC5Q96C12 935 aa14.21□□□□□ -0.13
TMOD4-201ENST00000295314 SH2D4AQ9H788 454 aa14.21□□□□□ -0.13
TMOD4-201ENST00000295314 MYH1P12882 1939 aa14.21□□□□□ -0.14
TMOD4-201ENST00000295314 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa14.21□□□□□ -0.14
TMOD4-201ENST00000295314 MYPNQ86TC9 1320 aa14.2□□□□□ -0.14
TMOD4-201ENST00000295314 MINDY4BA8MYZ0 360 aa14.2□□□□□ -0.14
TMOD4-201ENST00000295314 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa14.2□□□□□ -0.14
TMOD4-201ENST00000295314 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP14.2□□□□□ -0.14
TMOD4-201ENST00000295314 CTGFP29279 349 aa14.2□□□□□ -0.14
TMOD4-201ENST00000295314 HERVK_113P62684 666 aa14.2□□□□□ -0.14
TMOD4-201ENST00000295314 IFNL3Q8IZI9 196 aa14.2□□□□□ -0.14
TMOD4-201ENST00000295314 ACER1Q8TDN7 264 aa14.2□□□□□ -0.14
TMOD4-201ENST00000295314 COA7Q96BR5 231 aa14.2□□□□□ -0.14
TMOD4-201ENST00000295314 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP14.2□□□□□ -0.14
TMOD4-201ENST00000295314 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP14.2□□□□□ -0.14
TMOD4-201ENST00000295314 OSBPL3Q9H4L5 887 aa14.2□□□□□ -0.14
TMOD4-201ENST00000295314 MKNK2Q9HBH9 465 aa14.2□□□□□ -0.14
TMOD4-201ENST00000295314 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa14.2□□□□□ -0.14
TMOD4-201ENST00000295314 AKR1B1P15121 316 aa14.19□□□□□ -0.14
TMOD4-201ENST00000295314 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP14.19□□□□□ -0.14
TMOD4-201ENST00000295314 TMEM106CQ9BVX2 250 aa14.19□□□□□ -0.14
TMOD4-201ENST00000295314 NAPBQ9H115 298 aa14.19□□□□□ -0.14
TMOD4-201ENST00000295314 KANSL2Q9H9L4 492 aa14.19□□□□□ -0.14
TMOD4-201ENST00000295314 HELLSQ9NRZ9 838 aa14.19□□□□□ -0.14
TMOD4-201ENST00000295314 MORF4L1Q9UBU8 362 aa14.19□□□□□ -0.14
TMOD4-201ENST00000295314 PHIPQ8WWQ0 1821 aa14.19□□□□□ -0.14
TMOD4-201ENST00000295314 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP14.18□□□□□ -0.14
TMOD4-201ENST00000295314 VCAM1P19320 739 aa14.18□□□□□ -0.14
TMOD4-201ENST00000295314 ICA1Q05084 483 aa14.18□□□□□ -0.14
TMOD4-201ENST00000295314 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa14.18□□□□□ -0.14
TMOD4-201ENST00000295314 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa14.18□□□□□ -0.14
TMOD4-201ENST00000295314 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP14.18□□□□□ -0.14
TMOD4-201ENST00000295314 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP14.18□□□□□ -0.14
TMOD4-201ENST00000295314 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa14.18□□□□□ -0.14
TMOD4-201ENST00000295314 RILPL2Q969X0 211 aa14.18□□□□□ -0.14
TMOD4-201ENST00000295314 ZNF333Q96JL9 665 aa14.18□□□□□ -0.14
TMOD4-201ENST00000295314 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP14.18□□□□□ -0.14
TMOD4-201ENST00000295314 A0A1W2PRG0 241 aa14.17□□□□□ -0.14
TMOD4-201ENST00000295314 SMIM22K7EJ46 135 aa14.17□□□□□ -0.14
TMOD4-201ENST00000295314 GRK4P32298 578 aa14.17□□□□□ -0.14
TMOD4-201ENST00000295314 PRKCZQ05513 592 aa14.17□□□□□ -0.14
TMOD4-201ENST00000295314 LPAR1Q92633 364 aa14.17□□□□□ -0.14
TMOD4-201ENST00000295314 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP14.17□□□□□ -0.14
TMOD4-201ENST00000295314 HOXC10Q9NYD6 342 aa14.17□□□□□ -0.14
TMOD4-201ENST00000295314 TMX2Q9Y320 296 aa14.17□□□□□ -0.14
TMOD4-201ENST00000295314 HTTP42858 3142 aa14.17□□□□□ -0.14
TMOD4-201ENST00000295314 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP14.17□□□□□ -0.14
TMOD4-201ENST00000295314 ATAD5Q96QE3 1844 aa14.17□□□□□ -0.14
TMOD4-201ENST00000295314 NAV1Q8NEY1 1877 aa14.16□□□□□ -0.14
TMOD4-201ENST00000295314 FLT3LGP49771 235 aa14.16□□□□□ -0.14
TMOD4-201ENST00000295314 CCNA1P78396 465 aa14.16□□□□□ -0.14
TMOD4-201ENST00000295314 PDE4BQ07343 736 aa14.16□□□□□ -0.14
TMOD4-201ENST00000295314 IRF5Q13568 498 aa14.16□□□□□ -0.14
TMOD4-201ENST00000295314 COG2Q14746 738 aa14.16□□□□□ -0.14
TMOD4-201ENST00000295314 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa14.16□□□□□ -0.14
TMOD4-201ENST00000295314 STK11IPQ8N1F8 1099 aa14.16□□□□□ -0.14
TMOD4-201ENST00000295314 SLAIN1Q8ND83 568 aa14.16□□□□□ -0.14
TMOD4-201ENST00000295314 SH3TC2Q8TF17 1288 aa14.16□□□□□ -0.14
TMOD4-201ENST00000295314 PAGR1Q9BTK6 254 aa14.16□□□□□ -0.14
TMOD4-201ENST00000295314 VCPKMTQ9H867 229 aa14.16□□□□□ -0.14
TMOD4-201ENST00000295314 RBPJLQ9UBG7 517 aa14.16□□□□□ -0.14
TMOD4-201ENST00000295314 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP14.16□□□□□ -0.14
TMOD4-201ENST00000295314 GABRQQ9UN88 632 aa14.16□□□□□ -0.14
TMOD4-201ENST00000295314 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa14.16□□□□□ -0.14
TMOD4-201ENST00000295314 ROBO3Q96MS0 1386 aa14.16□□□□□ -0.14
TMOD4-201ENST00000295314 EEF2P13639 858 aaKnown RBP14.15□□□□□ -0.14
TMOD4-201ENST00000295314 RASA1P20936 1047 aa14.15□□□□□ -0.14
TMOD4-201ENST00000295314 MAPK4P31152 587 aa14.15□□□□□ -0.14
TMOD4-201ENST00000295314 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP14.15□□□□□ -0.14
TMOD4-201ENST00000295314 ERVK-9P63128 1117 aa14.15□□□□□ -0.14
TMOD4-201ENST00000295314 ERVK-24P63145 666 aa14.15□□□□□ -0.14
TMOD4-201ENST00000295314 UBXN2AP68543 259 aa14.15□□□□□ -0.14
TMOD4-201ENST00000295314 ATP2B2Q01814 1243 aa14.15□□□□□ -0.14
TMOD4-201ENST00000295314 LBX2Q6XYB7 198 aa14.15□□□□□ -0.14
TMOD4-201ENST00000295314 SIAH1Q8IUQ4 282 aa14.15□□□□□ -0.14
TMOD4-201ENST00000295314 PXYLP1Q8TE99 480 aa14.15□□□□□ -0.14
TMOD4-201ENST00000295314 GOPCQ9HD26 462 aa14.15□□□□□ -0.14
TMOD4-201ENST00000295314 PTPRFP10586 1907 aa14.15□□□□□ -0.14
TMOD4-201ENST00000295314 LOC285556D6RIA3 1793 aa14.14□□□□□ -0.15
TMOD4-201ENST00000295314 HIP1O00291 1037 aa14.14□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.7 ms