RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000277010.8

SIGMAR1-201, Transcript of sigma non-opioid intracellular receptor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SIGMAR1, Length 1,656 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIGMAR1-201ENST00000277010 STOX1Q6ZVD7 989 aa26.98■■□□□ 1.91
SIGMAR1-201ENST00000277010 KANSL2Q9H9L4 492 aa26.98■■□□□ 1.91
SIGMAR1-201ENST00000277010 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
SIGMAR1-201ENST00000277010 MTMR2Q13614 643 aa26.97■■□□□ 1.91
SIGMAR1-201ENST00000277010 SIAH1Q8IUQ4 282 aa26.97■■□□□ 1.91
SIGMAR1-201ENST00000277010 ESR2Q92731 530 aa26.97■■□□□ 1.91
SIGMAR1-201ENST00000277010 CNNM2Q9H8M5 875 aa26.97■■□□□ 1.91
SIGMAR1-201ENST00000277010 PLIN4Q96Q06 1357 aa26.96■■□□□ 1.91
SIGMAR1-201ENST00000277010 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa26.96■■□□□ 1.91
SIGMAR1-201ENST00000277010 NMT2O60551 498 aa26.96■■□□□ 1.91
SIGMAR1-201ENST00000277010 KDM4AO75164 1064 aa26.96■■□□□ 1.91
SIGMAR1-201ENST00000277010 SEC24BO95487 1268 aa26.96■■□□□ 1.91
SIGMAR1-201ENST00000277010 ATP2B2Q01814 1243 aa26.96■■□□□ 1.91
SIGMAR1-201ENST00000277010 DGKZQ13574 1117 aa26.96■■□□□ 1.91
SIGMAR1-201ENST00000277010 RNF20Q5VTR2 975 aa26.96■■□□□ 1.91
SIGMAR1-201ENST00000277010 CEP95Q96GE4 821 aa26.96■■□□□ 1.91
SIGMAR1-201ENST00000277010 USP26Q9BXU7 913 aa26.96■■□□□ 1.91
SIGMAR1-201ENST00000277010 PHIPQ8WWQ0 1821 aa26.96■■□□□ 1.91
SIGMAR1-201ENST00000277010 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa26.95■■□□□ 1.91
SIGMAR1-201ENST00000277010 A0A1W2PRG0 241 aa26.95■■□□□ 1.91
SIGMAR1-201ENST00000277010 USP17L10C9JJH3 530 aa26.95■■□□□ 1.91
SIGMAR1-201ENST00000277010 CCL15Q16663 113 aa26.95■■□□□ 1.91
SIGMAR1-201ENST00000277010 BRI3BPQ8WY22 251 aa26.95■■□□□ 1.91
SIGMAR1-201ENST00000277010 KRT23Q9C075 422 aa26.95■■□□□ 1.91
SIGMAR1-201ENST00000277010 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
SIGMAR1-201ENST00000277010 EEF2P13639 858 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
SIGMAR1-201ENST00000277010 BACE1P56817 501 aa26.95■■□□□ 1.9
SIGMAR1-201ENST00000277010 TRDNQ13061 729 aa26.95■■□□□ 1.9
SIGMAR1-201ENST00000277010 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
SIGMAR1-201ENST00000277010 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
SIGMAR1-201ENST00000277010 RASEFQ8IZ41 740 aa26.95■■□□□ 1.9
SIGMAR1-201ENST00000277010 FEZ1Q99689 392 aa26.95■■□□□ 1.9
SIGMAR1-201ENST00000277010 IL17RBQ9NRM6 502 aa26.95■■□□□ 1.9
SIGMAR1-201ENST00000277010 MTMR4Q9NYA4 1195 aa26.95■■□□□ 1.9
SIGMAR1-201ENST00000277010 CETPP11597 493 aa26.94■■□□□ 1.9
SIGMAR1-201ENST00000277010 HSPA4P34932 840 aa26.94■■□□□ 1.9
SIGMAR1-201ENST00000277010 HMGCS2P54868 508 aa26.94■■□□□ 1.9
SIGMAR1-201ENST00000277010 SREBF2Q12772 1141 aa26.94■■□□□ 1.9
SIGMAR1-201ENST00000277010 ZSWIM5Q9P217 1185 aa26.94■■□□□ 1.9
SIGMAR1-201ENST00000277010 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
SIGMAR1-201ENST00000277010 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa26.93■■□□□ 1.9
SIGMAR1-201ENST00000277010 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
SIGMAR1-201ENST00000277010 THSD7BQ9C0I4 1608 aa26.92■■□□□ 1.9
SIGMAR1-201ENST00000277010 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
SIGMAR1-201ENST00000277010 MOGSQ13724 837 aa26.92■■□□□ 1.9
SIGMAR1-201ENST00000277010 GADL1Q6ZQY3 521 aa26.92■■□□□ 1.9
SIGMAR1-201ENST00000277010 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
SIGMAR1-201ENST00000277010 NCOA7Q8NI08 942 aa26.92■■□□□ 1.9
SIGMAR1-201ENST00000277010 PTPN18Q99952 460 aa26.92■■□□□ 1.9
SIGMAR1-201ENST00000277010 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa26.92■■□□□ 1.9
SIGMAR1-201ENST00000277010 CLIP2Q9UDT6 1046 aa26.92■■□□□ 1.9
SIGMAR1-201ENST00000277010 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
SIGMAR1-201ENST00000277010 TM4SF4P48230 202 aa26.92■■□□□ 1.9
SIGMAR1-201ENST00000277010 INHBEP58166 350 aa26.92■■□□□ 1.9
SIGMAR1-201ENST00000277010 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa26.92■■□□□ 1.9
SIGMAR1-201ENST00000277010 NYAP2Q9P242 653 aa26.92■■□□□ 1.9
SIGMAR1-201ENST00000277010 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP26.91■■□□□ 1.91e-6■■■■■ 30.1
SIGMAR1-201ENST00000277010 SH3D19Q5HYK7 790 aa26.91■■□□□ 1.9
SIGMAR1-201ENST00000277010 CYB5R4Q7L1T6 521 aa26.91■■□□□ 1.9
SIGMAR1-201ENST00000277010 STX8Q9UNK0 236 aa26.91■■□□□ 1.9
SIGMAR1-201ENST00000277010 TMX2Q9Y320 296 aa26.91■■□□□ 1.9
SIGMAR1-201ENST00000277010 C19orf81C9J6K1 198 aa26.9■■□□□ 1.9
SIGMAR1-201ENST00000277010 TTLL1O95922 423 aa26.9■■□□□ 1.9
SIGMAR1-201ENST00000277010 NT5C2P49902 561 aa26.9■■□□□ 1.9
SIGMAR1-201ENST00000277010 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
SIGMAR1-201ENST00000277010 EMILIN3Q9NT22 766 aa26.9■■□□□ 1.9
SIGMAR1-201ENST00000277010 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa26.9■■□□□ 1.9
SIGMAR1-201ENST00000277010 BTBD19C9JJ37 291 aa26.89■■□□□ 1.9
SIGMAR1-201ENST00000277010 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
SIGMAR1-201ENST00000277010 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
SIGMAR1-201ENST00000277010 IQCA1Q86XH1 822 aa26.89■■□□□ 1.9
SIGMAR1-201ENST00000277010 IFNL1Q8IU54 200 aa26.89■■□□□ 1.9
SIGMAR1-201ENST00000277010 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
SIGMAR1-201ENST00000277010 KCNB2Q92953 911 aa26.89■■□□□ 1.9
SIGMAR1-201ENST00000277010 SH2D4AQ9H788 454 aa26.89■■□□□ 1.9
SIGMAR1-201ENST00000277010 TMOD4Q9NZQ9 345 aa26.89■■□□□ 1.9
SIGMAR1-201ENST00000277010 SNX14Q9Y5W7 946 aa26.89■■□□□ 1.9
SIGMAR1-201ENST00000277010 USP14P54578 494 aa26.89■■□□□ 1.89
SIGMAR1-201ENST00000277010 ADCK5Q3MIX3 580 aa26.89■■□□□ 1.89
SIGMAR1-201ENST00000277010 TSGA10IPQ3SY00 556 aa26.89■■□□□ 1.89
SIGMAR1-201ENST00000277010 USP17L2Q6R6M4 530 aa26.89■■□□□ 1.89
SIGMAR1-201ENST00000277010 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.89
SIGMAR1-201ENST00000277010 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.89
SIGMAR1-201ENST00000277010 FAM43AQ8N2R8 423 aa26.89■■□□□ 1.89
SIGMAR1-201ENST00000277010 TREML2Q5T2D2 321 aa26.88■■□□□ 1.89
SIGMAR1-201ENST00000277010 GPAT2Q6NUI2 795 aa26.88■■□□□ 1.89
SIGMAR1-201ENST00000277010 CHST3Q7LGC8 479 aa26.88■■□□□ 1.89
SIGMAR1-201ENST00000277010 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
SIGMAR1-201ENST00000277010 MCCP23508 829 aa26.87■■□□□ 1.89
SIGMAR1-201ENST00000277010 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa26.87■■□□□ 1.89
SIGMAR1-201ENST00000277010 JMYQ8N9B5 988 aa26.87■■□□□ 1.89
SIGMAR1-201ENST00000277010 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
SIGMAR1-201ENST00000277010 RAD21O60216 631 aa26.86■■□□□ 1.89
SIGMAR1-201ENST00000277010 NOVP48745 357 aa26.86■■□□□ 1.89
SIGMAR1-201ENST00000277010 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
SIGMAR1-201ENST00000277010 KRT32Q14532 448 aa26.86■■□□□ 1.89
SIGMAR1-201ENST00000277010 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa26.86■■□□□ 1.89
SIGMAR1-201ENST00000277010 SPICE1Q8N0Z3 855 aa26.86■■□□□ 1.89
SIGMAR1-201ENST00000277010 MKL1Q969V6 931 aa26.86■■□□□ 1.89
SIGMAR1-201ENST00000277010 UBAC1Q9BSL1 405 aa26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.4 ms