RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265340.11

PITX1-201, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX1, Length 2,406 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-201ENST00000265340 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
PITX1-201ENST00000265340 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa24.8■■□□□ 1.56
PITX1-201ENST00000265340 PDE8AO60658 829 aa24.8■■□□□ 1.56
PITX1-201ENST00000265340 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
PITX1-201ENST00000265340 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
PITX1-201ENST00000265340 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa24.8■■□□□ 1.56
PITX1-201ENST00000265340 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
PITX1-201ENST00000265340 SCARF1Q14162 830 aa24.79■■□□□ 1.56
PITX1-201ENST00000265340 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
PITX1-201ENST00000265340 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
PITX1-201ENST00000265340 CFAP45Q9UL16 551 aa24.79■■□□□ 1.56
PITX1-201ENST00000265340 KINO60870 393 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
PITX1-201ENST00000265340 SKIDA1Q1XH10 827 aa24.78■■□□□ 1.56
PITX1-201ENST00000265340 USPL1Q5W0Q7 1092 aa24.78■■□□□ 1.56
PITX1-201ENST00000265340 CCDC26Q8TAB7 109 aa24.78■■□□□ 1.56
PITX1-201ENST00000265340 SHTN1A0MZ66 631 aa24.78■■□□□ 1.56
PITX1-201ENST00000265340 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa24.78■■□□□ 1.56
PITX1-201ENST00000265340 MYO1FO00160 1098 aa24.78■■□□□ 1.56
PITX1-201ENST00000265340 RWDD2BP57060 319 aa24.78■■□□□ 1.56
PITX1-201ENST00000265340 TUBB2AQ13885 445 aa24.78■■□□□ 1.56
PITX1-201ENST00000265340 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa24.78■■□□□ 1.56
PITX1-201ENST00000265340 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
PITX1-201ENST00000265340 TUBB2BQ9BVA1 445 aa24.78■■□□□ 1.56
PITX1-201ENST00000265340 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
PITX1-201ENST00000265340 IRAK1P51617 712 aa24.77■■□□□ 1.56
PITX1-201ENST00000265340 METTL24Q5JXM2 366 aa24.77■■□□□ 1.56
PITX1-201ENST00000265340 TCEANC2Q96MN5 208 aa24.77■■□□□ 1.56
PITX1-201ENST00000265340 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
PITX1-201ENST00000265340 SH3TC1Q8TE82 1336 aa24.77■■□□□ 1.56
PITX1-201ENST00000265340 A0A087WWV3 80 aa24.77■■□□□ 1.56
PITX1-201ENST00000265340 VSNL1P62760 191 aa24.77■■□□□ 1.56
PITX1-201ENST00000265340 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa24.77■■□□□ 1.56
PITX1-201ENST00000265340 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
PITX1-201ENST00000265340 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP24.76■■□□□ 1.55
PITX1-201ENST00000265340 TMEM139Q8IV31 216 aa24.76■■□□□ 1.55
PITX1-201ENST00000265340 IGSF22Q8N9C0 903 aa24.76■■□□□ 1.55
PITX1-201ENST00000265340 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
PITX1-201ENST00000265340 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa24.76■■□□□ 1.55
PITX1-201ENST00000265340 PI16Q6UXB8 463 aa24.76■■□□□ 1.55
PITX1-201ENST00000265340 VGLL2Q8N8G2 317 aa24.76■■□□□ 1.55
PITX1-201ENST00000265340 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa24.76■■□□□ 1.55
PITX1-201ENST00000265340 CNNM1Q9NRU3 951 aa24.76■■□□□ 1.55
PITX1-201ENST00000265340 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
PITX1-201ENST00000265340 ZNF827Q17R98 1081 aa24.75■■□□□ 1.55
PITX1-201ENST00000265340 TTC39AQ5SRH9 613 aa24.75■■□□□ 1.55
PITX1-201ENST00000265340 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
PITX1-201ENST00000265340 ENGASEQ8NFI3 743 aa24.75■■□□□ 1.55
PITX1-201ENST00000265340 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP24.75■■□□□ 1.55
PITX1-201ENST00000265340 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
PITX1-201ENST00000265340 CDC23Q9UJX2 597 aa24.75■■□□□ 1.55
PITX1-201ENST00000265340 TPCN1Q9ULQ1 816 aa24.75■■□□□ 1.55
PITX1-201ENST00000265340 TRAF1Q13077 416 aa24.75■■□□□ 1.55
PITX1-201ENST00000265340 RESTQ13127 1097 aa24.75■■□□□ 1.55
PITX1-201ENST00000265340 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa24.75■■□□□ 1.55
PITX1-201ENST00000265340 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa24.75■■□□□ 1.55
PITX1-201ENST00000265340 MYBL2P10244 700 aa24.74■■□□□ 1.55
PITX1-201ENST00000265340 FAM160A1Q05DH4 1040 aa24.74■■□□□ 1.55
PITX1-201ENST00000265340 KAT14Q9H8E8 782 aa24.74■■□□□ 1.55
PITX1-201ENST00000265340 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
PITX1-201ENST00000265340 FANCCQ00597 558 aa24.74■■□□□ 1.55
PITX1-201ENST00000265340 CAMKK2Q96RR4 588 aa24.74■■□□□ 1.55
PITX1-201ENST00000265340 TRAPPC3LQ5T215 181 aa24.73■■□□□ 1.55
PITX1-201ENST00000265340 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa24.73■■□□□ 1.55
PITX1-201ENST00000265340 BCAS4Q8TDM0 211 aa24.73■■□□□ 1.55
PITX1-201ENST00000265340 KLC4Q9NSK0 619 aa24.73■■□□□ 1.55
PITX1-201ENST00000265340 CYP21A2P08686 494 aa24.73■■□□□ 1.55
PITX1-201ENST00000265340 BICDL1Q6ZP65 573 aa24.73■■□□□ 1.55
PITX1-201ENST00000265340 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa24.73■■□□□ 1.55
PITX1-201ENST00000265340 HMG20BQ9P0W2 317 aa24.73■■□□□ 1.55
PITX1-201ENST00000265340 PSMA5P28066 241 aa24.72■■□□□ 1.55
PITX1-201ENST00000265340 RFC4P35249 363 aa24.72■■□□□ 1.55
PITX1-201ENST00000265340 ZAP70P43403 619 aa24.72■■□□□ 1.55
PITX1-201ENST00000265340 HELLSQ9NRZ9 838 aa24.72■■□□□ 1.55
PITX1-201ENST00000265340 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
PITX1-201ENST00000265340 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP24.72■■□□□ 1.55
PITX1-201ENST00000265340 SPEF2Q9C093 1822 aa24.72■■□□□ 1.55
PITX1-201ENST00000265340 MAST3O60307 1309 aa24.72■■□□□ 1.55
PITX1-201ENST00000265340 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
PITX1-201ENST00000265340 CBFA2T2O43439 604 aa24.72■■□□□ 1.55
PITX1-201ENST00000265340 ZPR1O75312 459 aa24.72■■□□□ 1.55
PITX1-201ENST00000265340 KIAA0754O94854 1291 aa24.72■■□□□ 1.55
PITX1-201ENST00000265340 RPS6KB1P23443 525 aa24.72■■□□□ 1.55
PITX1-201ENST00000265340 ARHGAP25P42331 645 aa24.72■■□□□ 1.55
PITX1-201ENST00000265340 SMTNP53814 917 aa24.72■■□□□ 1.55
PITX1-201ENST00000265340 WDR93Q6P2C0 686 aa24.72■■□□□ 1.55
PITX1-201ENST00000265340 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa24.72■■□□□ 1.55
PITX1-201ENST00000265340 FAM76AQ8TAV0 307 aa24.72■■□□□ 1.55
PITX1-201ENST00000265340 SEC31BQ9NQW1 1179 aa24.72■■□□□ 1.55
PITX1-201ENST00000265340 RCOR1Q9UKL0 485 aa24.72■■□□□ 1.55
PITX1-201ENST00000265340 PPFIA1Q13136 1202 aa24.71■■□□□ 1.55
PITX1-201ENST00000265340 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
PITX1-201ENST00000265340 A0A0G2JLW4 131 aa24.71■■□□□ 1.55
PITX1-201ENST00000265340 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP24.71■■□□□ 1.55
PITX1-201ENST00000265340 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
PITX1-201ENST00000265340 NTSR2O95665 410 aa24.71■■□□□ 1.55
PITX1-201ENST00000265340 NCAPHQ15003 741 aa24.71■■□□□ 1.55
PITX1-201ENST00000265340 MAGEC3Q8TD91 643 aa24.71■■□□□ 1.55
PITX1-201ENST00000265340 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
PITX1-201ENST00000265340 M0R2C6 588 aa24.7■■□□□ 1.54
PITX1-201ENST00000265340 PDE8BO95263 885 aa24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 891 ms