RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258341.4

LAMC1-201, Transcript of laminin subunit gamma 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LAMC1, Length 7,889 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1-201ENST00000258341 STK38LQ9Y2H1 464 aa18.17■□□□□ 0.5
LAMC1-201ENST00000258341 ITGA6P23229 1130 aa18.16■□□□□ 0.5
LAMC1-201ENST00000258341 NLRX1Q86UT6 975 aa18.16■□□□□ 0.5
LAMC1-201ENST00000258341 SNX29Q8TEQ0 813 aa18.16■□□□□ 0.5
LAMC1-201ENST00000258341 TRPC6Q9Y210 931 aa18.16■□□□□ 0.5
LAMC1-201ENST00000258341 RUFY4Q6ZNE9 571 aa18.16■□□□□ 0.5
LAMC1-201ENST00000258341 TEKT1Q969V4 418 aa18.16■□□□□ 0.5
LAMC1-201ENST00000258341 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa18.16■□□□□ 0.5
LAMC1-201ENST00000258341 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa18.16■□□□□ 0.5
LAMC1-201ENST00000258341 FLOT1O75955 427 aa18.16■□□□□ 0.5
LAMC1-201ENST00000258341 KLHL7Q8IXQ5 586 aa18.16■□□□□ 0.5
LAMC1-201ENST00000258341 POMGNT1Q8WZA1 660 aa18.16■□□□□ 0.5
LAMC1-201ENST00000258341 BAG5Q9UL15 447 aa18.16■□□□□ 0.5
LAMC1-201ENST00000258341 CEP104O60308 925 aa18.16■□□□□ 0.5
LAMC1-201ENST00000258341 FAM89AQ96GI7 184 aa18.16■□□□□ 0.5
LAMC1-201ENST00000258341 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
LAMC1-201ENST00000258341 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP18.16■□□□□ 0.52e-9■■□□□ 12.5
LAMC1-201ENST00000258341 KIF22Q14807 665 aa18.15■□□□□ 0.5
LAMC1-201ENST00000258341 NIM1KQ8IY84 436 aa18.15■□□□□ 0.5
LAMC1-201ENST00000258341 NBPF3Q9H094 633 aa18.15■□□□□ 0.5
LAMC1-201ENST00000258341 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
LAMC1-201ENST00000258341 LMTK3Q96Q04 1460 aa18.15■□□□□ 0.5
LAMC1-201ENST00000258341 PFDN6O15212 129 aa18.15■□□□□ 0.5
LAMC1-201ENST00000258341 RASSF2P50749 326 aa18.15■□□□□ 0.5
LAMC1-201ENST00000258341 GADL1Q6ZQY3 521 aa18.15■□□□□ 0.5
LAMC1-201ENST00000258341 CTAGE3PQ8IX95 158 aa18.15■□□□□ 0.5
LAMC1-201ENST00000258341 PDZD8Q8NEN9 1154 aa18.15■□□□□ 0.5
LAMC1-201ENST00000258341 FAM102BQ5T8I3 360 aa18.15■□□□□ 0.5
LAMC1-201ENST00000258341 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa18.15■□□□□ 0.5
LAMC1-201ENST00000258341 GPIHBP1Q8IV16 184 aa18.15■□□□□ 0.5
LAMC1-201ENST00000258341 DCLK2Q8N568 766 aa18.15■□□□□ 0.5
LAMC1-201ENST00000258341 BCAP29Q9UHQ4 241 aa18.15■□□□□ 0.5
LAMC1-201ENST00000258341 USH1CQ9Y6N9 552 aa18.15■□□□□ 0.5
LAMC1-201ENST00000258341 MAP3K5Q99683 1374 aa18.15■□□□□ 0.5
LAMC1-201ENST00000258341 HAUS1Q96CS2 278 aa18.15■□□□□ 0.5
LAMC1-201ENST00000258341 HAUS8Q9BT25 410 aa18.15■□□□□ 0.5
LAMC1-201ENST00000258341 PAGR1Q9BTK6 254 aa18.15■□□□□ 0.5
LAMC1-201ENST00000258341 ANAPC5Q9UJX4 755 aa18.15■□□□□ 0.5
LAMC1-201ENST00000258341 ATP6V1E1P36543 226 aa18.15■□□□□ 0.5
LAMC1-201ENST00000258341 PARD3BQ8TEW8 1205 aa18.15■□□□□ 0.5
LAMC1-201ENST00000258341 EFCC1Q9HA90 598 aa18.15■□□□□ 0.5
LAMC1-201ENST00000258341 POLKQ9UBT6 870 aa18.15■□□□□ 0.5
LAMC1-201ENST00000258341 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
LAMC1-201ENST00000258341 PHBP35232 272 aa18.15■□□□□ 0.5
LAMC1-201ENST00000258341 LRMPQ12912 555 aa18.15■□□□□ 0.5
LAMC1-201ENST00000258341 KIF9Q9HAQ2 790 aa18.15■□□□□ 0.5
LAMC1-201ENST00000258341 CCDC68Q9H2F9 335 aa18.14■□□□□ 0.5
LAMC1-201ENST00000258341 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.5
LAMC1-201ENST00000258341 KCNH3Q9ULD8 1083 aa18.14■□□□□ 0.5
LAMC1-201ENST00000258341 A0A1B0GUL7 405 aa18.14■□□□□ 0.49
LAMC1-201ENST00000258341 C8orf58Q8NAV2 365 aa18.14■□□□□ 0.49
LAMC1-201ENST00000258341 VPS37BQ9H9H4 285 aa18.14■□□□□ 0.49
LAMC1-201ENST00000258341 VCX3AQ9NNX9 186 aa18.14■□□□□ 0.49
LAMC1-201ENST00000258341 BTG4Q9NY30 223 aa18.14■□□□□ 0.49
LAMC1-201ENST00000258341 V9GY48 417 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
LAMC1-201ENST00000258341 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
LAMC1-201ENST00000258341 ADCY7P51828 1080 aa18.14■□□□□ 0.49
LAMC1-201ENST00000258341 CFAP221Q4G0U5 840 aa18.14■□□□□ 0.49
LAMC1-201ENST00000258341 CERS3Q8IU89 383 aa18.14■□□□□ 0.49
LAMC1-201ENST00000258341 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
LAMC1-201ENST00000258341 A0A1B0GUA9 196 aa18.14■□□□□ 0.49
LAMC1-201ENST00000258341 SPDYE2BA6NHP3 402 aa18.14■□□□□ 0.49
LAMC1-201ENST00000258341 SPDYE6P0CI01 402 aa18.14■□□□□ 0.49
LAMC1-201ENST00000258341 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
LAMC1-201ENST00000258341 TNRQ92752 1358 aa18.14■□□□□ 0.49
LAMC1-201ENST00000258341 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
LAMC1-201ENST00000258341 TMEM87BQ96K49 555 aa18.14■□□□□ 0.49
LAMC1-201ENST00000258341 RAB17Q9H0T7 212 aa18.14■□□□□ 0.49
LAMC1-201ENST00000258341 PARP2Q9UGN5 583 aa18.14■□□□□ 0.49
LAMC1-201ENST00000258341 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
LAMC1-201ENST00000258341 LONRF3Q496Y0 759 aa18.13■□□□□ 0.49
LAMC1-201ENST00000258341 NSMFQ6X4W1 530 aa18.13■□□□□ 0.49
LAMC1-201ENST00000258341 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP18.13■□□□□ 0.49
LAMC1-201ENST00000258341 STAM2O75886 525 aa18.13■□□□□ 0.49
LAMC1-201ENST00000258341 GAS7O60861 476 aa18.13■□□□□ 0.49
LAMC1-201ENST00000258341 RPS6KB1P23443 525 aa18.13■□□□□ 0.49
LAMC1-201ENST00000258341 COG7P83436 770 aa18.13■□□□□ 0.49
LAMC1-201ENST00000258341 ARHGAP4P98171 946 aa18.13■□□□□ 0.49
LAMC1-201ENST00000258341 TTC38Q5R3I4 469 aa18.13■□□□□ 0.49
LAMC1-201ENST00000258341 DEPTORQ8TB45 409 aa18.13■□□□□ 0.49
LAMC1-201ENST00000258341 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
LAMC1-201ENST00000258341 SMIM24O75264 130 aa18.13■□□□□ 0.49
LAMC1-201ENST00000258341 SFMBT2Q5VUG0 894 aa18.13■□□□□ 0.49
LAMC1-201ENST00000258341 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
LAMC1-201ENST00000258341 MLXIPQ9HAP2 919 aa18.13■□□□□ 0.49
LAMC1-201ENST00000258341 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa18.13■□□□□ 0.49
LAMC1-201ENST00000258341 IRX4P78413 519 aa18.13■□□□□ 0.49
LAMC1-201ENST00000258341 MMEL1Q495T6 779 aa18.13■□□□□ 0.49
LAMC1-201ENST00000258341 NELFBQ8WX92 580 aa18.13■□□□□ 0.49
LAMC1-201ENST00000258341 TIMM10P62072 90 aa18.13■□□□□ 0.49
LAMC1-201ENST00000258341 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
LAMC1-201ENST00000258341 KDM5BQ9UGL1 1544 aa18.12■□□□□ 0.49
LAMC1-201ENST00000258341 INPP5BP32019 993 aa18.12■□□□□ 0.49
LAMC1-201ENST00000258341 CASP2P42575 452 aa18.12■□□□□ 0.49
LAMC1-201ENST00000258341 CDR2Q01850 454 aa18.12■□□□□ 0.49
LAMC1-201ENST00000258341 PPFIA1Q13136 1202 aa18.12■□□□□ 0.49
LAMC1-201ENST00000258341 SESTD1Q86VW0 696 aa18.12■□□□□ 0.49
LAMC1-201ENST00000258341 LINS1Q8NG48 757 aa18.12■□□□□ 0.49
LAMC1-201ENST00000258341 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
LAMC1-201ENST00000258341 ARHGAP45Q92619 1136 aa18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms