RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000234111.8

ODC1-201, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ODC1, Length 2,653 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-201ENST00000234111 ZNF185O15231 689 aa23.93■■□□□ 1.42
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ODC1-201ENST00000234111 TRIM29Q14134 588 aa23.93■■□□□ 1.42
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ODC1-201ENST00000234111 MCM8Q9UJA3 840 aa23.93■■□□□ 1.42
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ODC1-201ENST00000234111 AIDAQ96BJ3 306 aa23.88■■□□□ 1.41
ODC1-201ENST00000234111 DIP2AQ14689 1571 aa23.88■■□□□ 1.41
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ODC1-201ENST00000234111 HERVK_113P62684 666 aa23.88■■□□□ 1.41
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ODC1-201ENST00000234111 ABTB2Q8N961 1025 aa23.88■■□□□ 1.41
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ODC1-201ENST00000234111 A0A087X0B3 334 aa23.86■■□□□ 1.41
ODC1-201ENST00000234111 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
ODC1-201ENST00000234111 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
ODC1-201ENST00000234111 LMBR1LQ6UX01 489 aa23.86■■□□□ 1.41
ODC1-201ENST00000234111 CYB5R4Q7L1T6 521 aa23.86■■□□□ 1.41
ODC1-201ENST00000234111 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
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