RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229022.7

VDR-201, Transcript of vitamin D receptor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene VDR, Length 4,773 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VDR-201ENST00000229022 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
VDR-201ENST00000229022 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa14.5□□□□□ -0.09
VDR-201ENST00000229022 FGAP02671 866 aa14.5□□□□□ -0.09
VDR-201ENST00000229022 ZNF853P0CG23 659 aa14.5□□□□□ -0.09
VDR-201ENST00000229022 BCRP11274 1271 aa14.5□□□□□ -0.09
VDR-201ENST00000229022 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
VDR-201ENST00000229022 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
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VDR-201ENST00000229022 CFAP221Q4G0U5 840 aa14.49□□□□□ -0.09
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VDR-201ENST00000229022 H7C1D1 291 aa14.48□□□□□ -0.09
VDR-201ENST00000229022 NDC80O14777 642 aa14.48□□□□□ -0.09
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VDR-201ENST00000229022 CCDC114Q96M63 670 aa14.48□□□□□ -0.09
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VDR-201ENST00000229022 MED23Q9ULK4 1368 aa14.48□□□□□ -0.09
VDR-201ENST00000229022 SMCO2A6NFE2 343 aa14.48□□□□□ -0.09
VDR-201ENST00000229022 H0YIN7 160 aa14.48□□□□□ -0.09
VDR-201ENST00000229022 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP14.48□□□□□ -0.09
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VDR-201ENST00000229022 SLC8A3P57103 927 aa14.48□□□□□ -0.09
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VDR-201ENST00000229022 TNKSO95271 1327 aa14.48□□□□□ -0.09
VDR-201ENST00000229022 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa14.48□□□□□ -0.09
VDR-201ENST00000229022 SEMA3EO15041 775 aa14.48□□□□□ -0.09
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VDR-201ENST00000229022 CHURC1Q8WUH1 139 aa14.48□□□□□ -0.09
VDR-201ENST00000229022 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa14.48□□□□□ -0.09
VDR-201ENST00000229022 ZMYND15Q9H091 742 aa14.48□□□□□ -0.09
VDR-201ENST00000229022 STK32BQ9NY57 414 aa14.48□□□□□ -0.09
VDR-201ENST00000229022 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
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VDR-201ENST00000229022 CHMP2AO43633 222 aa14.47□□□□□ -0.09
VDR-201ENST00000229022 MAP3K9P80192 1104 aa14.47□□□□□ -0.09
VDR-201ENST00000229022 PPFIA1Q13136 1202 aa14.47□□□□□ -0.09
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VDR-201ENST00000229022 RPS6KA1Q15418 735 aa14.47□□□□□ -0.09
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VDR-201ENST00000229022 TRAPPC10P48553 1259 aa14.46□□□□□ -0.09
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VDR-201ENST00000229022 DYMQ7RTS9 669 aa14.46□□□□□ -0.09
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VDR-201ENST00000229022 TRIM58Q8NG06 486 aa14.46□□□□□ -0.09
VDR-201ENST00000229022 PNOCQ13519 176 aa14.46□□□□□ -0.09
VDR-201ENST00000229022 ELF2Q15723 593 aa14.46□□□□□ -0.09
VDR-201ENST00000229022 TEKT1Q969V4 418 aa14.46□□□□□ -0.09
VDR-201ENST00000229022 PCDHA7Q9UN72 937 aa14.46□□□□□ -0.09
VDR-201ENST00000229022 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
VDR-201ENST00000229022 SP4Q02446 784 aa14.46□□□□□ -0.09
VDR-201ENST00000229022 TRPC3Q13507 836 aa14.46□□□□□ -0.09
VDR-201ENST00000229022 MTMR3Q13615 1198 aa14.46□□□□□ -0.09
VDR-201ENST00000229022 BRD3Q15059 726 aa14.46□□□□□ -0.09
VDR-201ENST00000229022 MYCT1Q8N699 235 aa14.46□□□□□ -0.09
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