RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000006275.8

TRAPPC6A-201, Transcript of trafficking protein particle complex 6A, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC6A, Length 805 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PLEKHH3Q7Z736 793 aa22.97■■□□□ 1.27
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TRAPPC6A-201ENST00000006275 GUCD1Q96NT3 240 aa22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TRIM34Q9BYJ4 488 aa22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PORCNQ9H237 461 aa22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC6A-201ENST00000006275 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC6A-201ENST00000006275 DCTPP1Q9H773 170 aa22.97■■□□□ 1.27
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TRAPPC6A-201ENST00000006275 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa22.93■■□□□ 1.26
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TRAPPC6A-201ENST00000006275 USP17L2Q6R6M4 530 aa22.91■■□□□ 1.26
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TRAPPC6A-201ENST00000006275 USP17L20D6RJB6 530 aa22.86■■□□□ 1.25
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TRAPPC6A-201ENST00000006275 USP17L24Q0WX57 530 aa22.86■■□□□ 1.25
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TRAPPC6A-201ENST00000006275 CYP7A1P22680 504 aa22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PTPREP23469 700 aa22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ADGRA1Q86SQ6 560 aa22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MAGEB6Q8N7X4 407 aa22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CYP2C19P33261 490 aa22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
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