RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000060956.12

Trappc1-201, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

TSL 3 BASIC

Gene Trappc1, Length 628 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Nbr1P97432 988 aa6.92□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 PamP97467 979 aa6.92□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 CblbQ3TTA7 982 aa6.92□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ankle2Q6P1H6 964 aa6.92□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Eif4bQ8BGD9 611 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Frmd6Q8C0V9 622 aa6.92□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Sgpl1Q8R0X7 568 aa6.92□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 McamQ8R2Y2 648 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Dnaaf4Q8R368 420 aa6.92□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Prmt3Q922H1 532 aa6.92□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ube2fQ9CY34 185 aa6.92□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Chst7Q9EP78 484 aa6.92□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 B3galt4Q9Z0F0 371 aa6.92□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Phrf1A6H619 1682 aa6.92□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Fndc3c1Q6DFV6 1356 aa6.92□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tbc1d8bA3KGB4 1114 aa6.91□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Nova2D3YVV7 556 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Myd88P22366 296 aa6.91□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Pla2g5P97391 137 aa6.91□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gpbp1l1Q6NZP2 473 aa6.91□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Bend7Q8BSV3 434 aa6.91□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Smoc2Q8CD91 447 aa6.91□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Plekha4Q8VC98 588 aa6.91□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 MyocdQ8VIM5 935 aa6.91□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ivns1abpQ920Q8 642 aa6.91□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ubxn11Q9D572 484 aa6.91□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ecel1Q9JMI0 775 aa6.91□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Carmil3Q3UFQ8 1375 aa6.91□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Scn10aQ6QIY3 1958 aa6.91□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Kdf1A2A9F4 397 aa6.9□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 NmiO35309 314 aa6.9□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Hap1O35668 628 aa6.9□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Fgl2P12804 432 aa6.9□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Cyp2d11P24457 504 aa6.9□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tmprss9P69525 1065 aa6.9□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Fads2p1Q0VAX3 487 aa6.9□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 VgfQ0VGU4 617 aa6.9□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 RubcnlQ3TD16 648 aa6.9□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ccdc51Q3URS9 406 aa6.9□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Znf496Q5SXI5 585 aa6.9□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 IqceQ6PCQ0 778 aa6.9□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Q7TT23 1179 aa6.9□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Trnp1Q80ZI1 223 aa6.9□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Kbtbd13Q8C828 458 aa6.9□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Rab15Q8K386 212 aa6.9□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Aldh1b1Q9CZS1 519 aa6.9□□□□□ -1.3
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Psme4Q5SSW2 1843 aa6.9□□□□□ -1.31
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Wscd2D4PHA7 571 aa6.89□□□□□ -1.31
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Magea4F2Z493 315 aa6.89□□□□□ -1.31
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ap1g2O88512 791 aa6.89□□□□□ -1.31
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Atoh1P48985 351 aa6.89□□□□□ -1.31
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Nme2Q01768 152 aa6.89□□□□□ -1.31
Trappc1-201ENSMUST00000060956 IntuQ059U7 942 aa6.89□□□□□ -1.31
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Q3TQI7 289 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
Trappc1-201ENSMUST00000060956 SpdyaQ5IBH7 310 aa6.89□□□□□ -1.31
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tmprss11eQ5S248 423 aa6.89□□□□□ -1.31
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Rbm27Q5SFM8 1060 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
Trappc1-201ENSMUST00000060956 LpoQ5SW46 710 aa6.89□□□□□ -1.31
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Slc23a3Q60850 611 aa6.89□□□□□ -1.31
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ltbp3Q61810 1268 aa6.89□□□□□ -1.31
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Sorbs1Q62417 1290 aa6.89□□□□□ -1.31
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Zcchc2Q69ZB8 1166 aa6.89□□□□□ -1.31
Trappc1-201ENSMUST00000060956 U2surpQ6NV83 1029 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ddx31Q6NZQ2 687 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
Trappc1-201ENSMUST00000060956 LdhdQ7TNG8 484 aa6.89□□□□□ -1.31
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ttc19Q8CC21 365 aa6.89□□□□□ -1.31
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Mbtps2Q8CHX6 515 aa6.89□□□□□ -1.31
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Rnf208Q8K0W3 265 aa6.89□□□□□ -1.31
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Slc44a4Q91VA1 707 aa6.89□□□□□ -1.31
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Zbtb3Q91X45 518 aa6.89□□□□□ -1.31
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Bicc1Q99MQ1 977 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Heg1E9Q7X6 1337 aa6.89□□□□□ -1.31
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Sik3Q6P4S6 1311 aa6.89□□□□□ -1.31
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Plekhh1Q80TI1 1356 aa6.89□□□□□ -1.31
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Arap2Q8BZ05 1703 aa6.89□□□□□ -1.31
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Kmt2eQ3UG20 1868 aa6.89□□□□□ -1.31
Trappc1-201ENSMUST00000060956 PcntP48725 2898 aa6.88□□□□□ -1.31
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Piezo2Q8CD54 2822 aa6.88□□□□□ -1.31
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Znf609Q8BZ47 1413 aa6.88□□□□□ -1.31
Trappc1-201ENSMUST00000060956 4931408C20RikE9PWP9 1381 aa6.88□□□□□ -1.31
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm13119B1ARV5 481 aa6.88□□□□□ -1.31
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Dpysl4O35098 572 aa6.88□□□□□ -1.31
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Impdh2P24547 514 aa6.88□□□□□ -1.31
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Csrnp1P59054 583 aa6.88□□□□□ -1.31
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Cntnap5bQ0V8T8 1292 aa6.88□□□□□ -1.31
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Rasa3Q60790 834 aa6.88□□□□□ -1.31
Trappc1-201ENSMUST00000060956 PsapQ61207 557 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Sept9Q80UG5 583 aa6.88□□□□□ -1.31
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Prpf40bQ80W14 870 aa6.88□□□□□ -1.31
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Lsm11Q8BUV6 361 aa6.88□□□□□ -1.31
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Slc14a2Q8R4T9 930 aa6.88□□□□□ -1.31
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Rbck1Q9WUB0 508 aa6.88□□□□□ -1.31
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Rbbp6P97868 1790 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm15262A0A140LIQ5 728 aa6.87□□□□□ -1.31
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Rnf19bA2A7Q9 732 aa6.87□□□□□ -1.31
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm6133B2RY53 190 aa6.87□□□□□ -1.31
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Oog1E9Q5G7 496 aa6.87□□□□□ -1.31
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Wnt2bO70283 389 aa6.87□□□□□ -1.31
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Cyp2b10P12791 500 aa6.87□□□□□ -1.31
Trappc1-201ENSMUST00000060956 CebpaP53566 359 aa6.87□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 46.6 ms