RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641658.1

MFSD8-240, Transcript of major facilitator superfamily domain containing 8, human

Gene MFSD8, Length 1,731 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MFSD8-240	ENST00000641658		A6NHS1	94 aa		7.32	□□□□□ -1.24
MFSD8-240	ENST00000641658	CAMTA2	O94983	1202 aa		7.32	□□□□□ -1.24
MFSD8-240	ENST00000641658	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
MFSD8-240	ENST00000641658	LMNB1	P20700	586 aa		7.32	□□□□□ -1.24
MFSD8-240	ENST00000641658	PPP2R1A	P30153	589 aa		7.32	□□□□□ -1.24
MFSD8-240	ENST00000641658	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	7.32	□□□□□ -1.24	2e-6	■■■□□ 16.1
MFSD8-240	ENST00000641658	NPAS4	Q8IUM7	802 aa		7.32	□□□□□ -1.24
MFSD8-240	ENST00000641658	GJD3	Q8N144	294 aa		7.32	□□□□□ -1.24
MFSD8-240	ENST00000641658	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		7.32	□□□□□ -1.24
MFSD8-240	ENST00000641658	PCDHGC4	Q9Y5F7	938 aa		7.32	□□□□□ -1.24
MFSD8-240	ENST00000641658	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		7.32	□□□□□ -1.24
MFSD8-240	ENST00000641658	GLTPD2	A6NH11	291 aa		7.32	□□□□□ -1.24
MFSD8-240	ENST00000641658	KHNYN	O15037	678 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
MFSD8-240	ENST00000641658	EPB42	P16452	691 aa		7.32	□□□□□ -1.24
MFSD8-240	ENST00000641658	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
MFSD8-240	ENST00000641658	FAM129B	Q96TA1	746 aa		7.32	□□□□□ -1.24
MFSD8-240	ENST00000641658	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		7.32	□□□□□ -1.24
MFSD8-240	ENST00000641658	CDC14C	A4D256	554 aa		7.31	□□□□□ -1.24
MFSD8-240	ENST00000641658	FAM177B	A6PVY3	158 aa		7.31	□□□□□ -1.24
MFSD8-240	ENST00000641658	GPR182	O15218	404 aa		7.31	□□□□□ -1.24
MFSD8-240	ENST00000641658	NPHP1	O15259	732 aa		7.31	□□□□□ -1.24
MFSD8-240	ENST00000641658	PPFIA3	O75145	1194 aa		7.31	□□□□□ -1.24
MFSD8-240	ENST00000641658	GRN	P28799	593 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
MFSD8-240	ENST00000641658	FSTL1	Q12841	308 aa		7.31	□□□□□ -1.24
MFSD8-240	ENST00000641658	SFSWAP	Q12872	951 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
MFSD8-240	ENST00000641658	UBAP2L	Q14157	1087 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
MFSD8-240	ENST00000641658	OLFM4	Q6UX06	510 aa		7.31	□□□□□ -1.24
MFSD8-240	ENST00000641658	CNBD1	Q8NA66	436 aa		7.31	□□□□□ -1.24
MFSD8-240	ENST00000641658	GTPBP3	Q969Y2	492 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
MFSD8-240	ENST00000641658	ZNF775	Q96BV0	537 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
MFSD8-240	ENST00000641658	ZNF837	Q96EG3	531 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
MFSD8-240	ENST00000641658	CFAP53	Q96M91	514 aa		7.31	□□□□□ -1.24
MFSD8-240	ENST00000641658	DMRTB1	Q96MA1	342 aa		7.31	□□□□□ -1.24
MFSD8-240	ENST00000641658	SETDB2	Q96T68	719 aa		7.31	□□□□□ -1.24
MFSD8-240	ENST00000641658	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		7.31	□□□□□ -1.24
MFSD8-240	ENST00000641658	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
MFSD8-240	ENST00000641658	KCNMB2	Q9Y691	235 aa		7.31	□□□□□ -1.24
MFSD8-240	ENST00000641658	TAF1	P21675	1872 aa		7.3	□□□□□ -1.24
MFSD8-240	ENST00000641658	RPLP1	P05386	114 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
MFSD8-240	ENST00000641658	PDE6B	P35913	854 aa		7.3	□□□□□ -1.24
MFSD8-240	ENST00000641658	TRIP4	Q15650	581 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
MFSD8-240	ENST00000641658	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
MFSD8-240	ENST00000641658	NGEF	Q8N5V2	710 aa		7.3	□□□□□ -1.24
MFSD8-240	ENST00000641658	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		7.3	□□□□□ -1.24
MFSD8-240	ENST00000641658	ZNF428	Q96B54	188 aa		7.3	□□□□□ -1.24
MFSD8-240	ENST00000641658	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		7.3	□□□□□ -1.24
MFSD8-240	ENST00000641658	NIF3L1	Q9GZT8	377 aa		7.3	□□□□□ -1.24
MFSD8-240	ENST00000641658	FNDC3A	Q9Y2H6	1198 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
MFSD8-240	ENST00000641658	TREH	O43280	583 aa		7.3	□□□□□ -1.24
MFSD8-240	ENST00000641658	BNIP3L	O60238	219 aa		7.3	□□□□□ -1.24
MFSD8-240	ENST00000641658	IGHA2	P01877	340 aa		7.3	□□□□□ -1.24
MFSD8-240	ENST00000641658	FAM157B	P0CG42	384 aa		7.3	□□□□□ -1.24
MFSD8-240	ENST00000641658	SRGN	P10124	158 aa		7.3	□□□□□ -1.24
MFSD8-240	ENST00000641658	MAPT	P10636	758 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
MFSD8-240	ENST00000641658	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
MFSD8-240	ENST00000641658	PLCB3	Q01970	1234 aa		7.3	□□□□□ -1.24
MFSD8-240	ENST00000641658	TNP2	Q05952	138 aa		7.3	□□□□□ -1.24
MFSD8-240	ENST00000641658	EHHADH	Q08426	723 aa		7.3	□□□□□ -1.24
MFSD8-240	ENST00000641658	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
MFSD8-240	ENST00000641658	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
MFSD8-240	ENST00000641658	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
MFSD8-240	ENST00000641658	ABHD17A	Q96GS6	310 aa		7.3	□□□□□ -1.24
MFSD8-240	ENST00000641658	GMCL1	Q96IK5	515 aa		7.3	□□□□□ -1.24
MFSD8-240	ENST00000641658	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
MFSD8-240	ENST00000641658	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		7.3	□□□□□ -1.24
MFSD8-240	ENST00000641658	NUDC	Q9Y266	331 aa		7.3	□□□□□ -1.24
MFSD8-240	ENST00000641658	XYLB	O75191	536 aa		7.29	□□□□□ -1.24
MFSD8-240	ENST00000641658	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
MFSD8-240	ENST00000641658	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
MFSD8-240	ENST00000641658	MAPK8	P45983	427 aa		7.29	□□□□□ -1.24
MFSD8-240	ENST00000641658	ST5	P78524	1137 aa		7.29	□□□□□ -1.24
MFSD8-240	ENST00000641658	HLF	Q16534	295 aa		7.29	□□□□□ -1.24
MFSD8-240	ENST00000641658	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
MFSD8-240	ENST00000641658	SLC51A	Q86UW1	340 aa		7.29	□□□□□ -1.24
MFSD8-240	ENST00000641658	VWA5B2	Q8N398	1253 aa		7.29	□□□□□ -1.24
MFSD8-240	ENST00000641658	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		7.29	□□□□□ -1.24
MFSD8-240	ENST00000641658	SCN4A	P35499	1836 aa		7.29	□□□□□ -1.24
MFSD8-240	ENST00000641658	GPR25	O00155	361 aa		7.28	□□□□□ -1.24
MFSD8-240	ENST00000641658	EFS	O43281	561 aa		7.28	□□□□□ -1.24
MFSD8-240	ENST00000641658	P4HB	P07237	508 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
MFSD8-240	ENST00000641658	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
MFSD8-240	ENST00000641658	STYK1	Q6J9G0	422 aa		7.28	□□□□□ -1.24
MFSD8-240	ENST00000641658	ZNF438	Q7Z4V0	828 aa		7.28	□□□□□ -1.24
MFSD8-240	ENST00000641658	MASTL	Q96GX5	879 aa		7.28	□□□□□ -1.24
MFSD8-240	ENST00000641658	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	7.28	□□□□□ -1.24
MFSD8-240	ENST00000641658	LAMB2	P55268	1798 aa		7.27	□□□□□ -1.25
MFSD8-240	ENST00000641658	DSC3	Q14574	896 aa		7.27	□□□□□ -1.25
MFSD8-240	ENST00000641658	GRIN2C	Q14957	1233 aa		7.27	□□□□□ -1.25
MFSD8-240	ENST00000641658	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
MFSD8-240	ENST00000641658	JMY	Q8N9B5	988 aa		7.27	□□□□□ -1.25
MFSD8-240	ENST00000641658	GIPC2	Q8TF65	315 aa		7.27	□□□□□ -1.25
MFSD8-240	ENST00000641658	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
MFSD8-240	ENST00000641658	NDFIP2	Q9NV92	336 aa		7.27	□□□□□ -1.25
MFSD8-240	ENST00000641658	MARK1	Q9P0L2	795 aa		7.27	□□□□□ -1.25
MFSD8-240	ENST00000641658	HCN2	Q9UL51	889 aa		7.27	□□□□□ -1.25
MFSD8-240	ENST00000641658	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		7.27	□□□□□ -1.25
MFSD8-240	ENST00000641658	CD33	P20138	364 aa		7.27	□□□□□ -1.25
MFSD8-240	ENST00000641658	VEGFB	P49765	207 aa		7.27	□□□□□ -1.25
MFSD8-240	ENST00000641658	TAGLN	Q01995	201 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
MFSD8-240	ENST00000641658	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25

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