RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641582.1

CASC19-241, Transcript of cancer susceptibility 19, humanhuman

Gene CASC19, Length 1,421 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC19-241ENST00000641582 C12orf40Q86WS4 652 aa6.92□□□□□ -1.3
CASC19-241ENST00000641582 GAL3ST3Q96A11 431 aa6.92□□□□□ -1.3
CASC19-241ENST00000641582 JAG2Q9Y219 1238 aa6.92□□□□□ -1.3
CASC19-241ENST00000641582 U3KQE9 123 aa6.92□□□□□ -1.3
CASC19-241ENST00000641582 ST13P50502 369 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
CASC19-241ENST00000641582 INPP5AQ14642 412 aa6.91□□□□□ -1.3
CASC19-241ENST00000641582 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
CASC19-241ENST00000641582 AOC3Q16853 763 aa6.91□□□□□ -1.3
CASC19-241ENST00000641582 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
CASC19-241ENST00000641582 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
CASC19-241ENST00000641582 USP31Q70CQ4 1352 aa6.9□□□□□ -1.3
CASC19-241ENST00000641582 FANCGO15287 622 aa6.9□□□□□ -1.31
CASC19-241ENST00000641582 FAM87AP0C7U9 286 aa6.9□□□□□ -1.31
CASC19-241ENST00000641582 LIG3P49916 1009 aa6.9□□□□□ -1.31
CASC19-241ENST00000641582 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
CASC19-241ENST00000641582 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
CASC19-241ENST00000641582 LRFN4Q6PJG9 635 aa6.9□□□□□ -1.31
CASC19-241ENST00000641582 AGMOQ6ZNB7 445 aa6.9□□□□□ -1.31
CASC19-241ENST00000641582 AMIGO3Q86WK7 504 aa6.9□□□□□ -1.31
CASC19-241ENST00000641582 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP6.9□□□□□ -1.31
CASC19-241ENST00000641582 HRASLS5Q96KN8 279 aa6.9□□□□□ -1.31
CASC19-241ENST00000641582 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
CASC19-241ENST00000641582 SORBS3O60504 671 aa6.89□□□□□ -1.31
CASC19-241ENST00000641582 KRT1P04264 644 aa6.89□□□□□ -1.31
CASC19-241ENST00000641582 MAP3K11Q16584 847 aa6.89□□□□□ -1.31
CASC19-241ENST00000641582 ZBTB37Q5TC79 503 aa6.89□□□□□ -1.31
CASC19-241ENST00000641582 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CASC19-241ENST00000641582 CYFIP1Q7L576 1253 aa6.89□□□□□ -1.31
CASC19-241ENST00000641582 UBE3DQ7Z6J8 389 aa6.89□□□□□ -1.31
CASC19-241ENST00000641582 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CASC19-241ENST00000641582 MKNK2Q9HBH9 465 aa6.89□□□□□ -1.31
CASC19-241ENST00000641582 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa6.89□□□□□ -1.31
CASC19-241ENST00000641582 BICRAQ9NZM4 1560 aa6.88□□□□□ -1.31
CASC19-241ENST00000641582 LEFTY1O75610 366 aa6.88□□□□□ -1.31
CASC19-241ENST00000641582 ELMO3Q96BJ8 720 aa6.88□□□□□ -1.31
CASC19-241ENST00000641582 PLPPR2Q96GM1 343 aa6.88□□□□□ -1.31
CASC19-241ENST00000641582 CRELD1Q96HD1 420 aa6.88□□□□□ -1.31
CASC19-241ENST00000641582 DUSP23Q9BVJ7 150 aa6.88□□□□□ -1.31
CASC19-241ENST00000641582 ZBTB7CA1YPR0 619 aa6.87□□□□□ -1.31
CASC19-241ENST00000641582 INHBBP09529 407 aa6.87□□□□□ -1.31
CASC19-241ENST00000641582 C1QTNF9P0C862 333 aa6.87□□□□□ -1.31
CASC19-241ENST00000641582 RLBP1P12271 317 aa6.87□□□□□ -1.31
CASC19-241ENST00000641582 CDK8P49336 464 aa6.87□□□□□ -1.31
CASC19-241ENST00000641582 SEPT6Q14141 434 aa6.87□□□□□ -1.31
CASC19-241ENST00000641582 HDXQ7Z353 690 aa6.87□□□□□ -1.31
CASC19-241ENST00000641582 HOMEZQ8IX15 550 aa6.87□□□□□ -1.31
CASC19-241ENST00000641582 PICK1Q9NRD5 415 aa6.87□□□□□ -1.31
CASC19-241ENST00000641582 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa6.87□□□□□ -1.31
CASC19-241ENST00000641582 TMEM265A0A087WTH1 108 aa6.86□□□□□ -1.31
CASC19-241ENST00000641582 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
CASC19-241ENST00000641582 BCL2L13Q9BXK5 485 aa6.86□□□□□ -1.31
CASC19-241ENST00000641582 MRS2Q9HD23 443 aa6.86□□□□□ -1.31
CASC19-241ENST00000641582 PRDM7Q9NQW5 492 aa6.86□□□□□ -1.31
CASC19-241ENST00000641582 VTI1BQ9UEU0 232 aa6.86□□□□□ -1.31
CASC19-241ENST00000641582 PLAGL2Q9UPG8 496 aa6.86□□□□□ -1.31
CASC19-241ENST00000641582 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
CASC19-241ENST00000641582 GFRA2O00451 464 aa6.85□□□□□ -1.31
CASC19-241ENST00000641582 CEACAM5P06731 702 aa6.85□□□□□ -1.31
CASC19-241ENST00000641582 OXCT1P55809 520 aa6.85□□□□□ -1.31
CASC19-241ENST00000641582 CTSWP56202 376 aa6.85□□□□□ -1.31
CASC19-241ENST00000641582 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
CASC19-241ENST00000641582 TMCO4Q5TGY1 634 aa6.85□□□□□ -1.31
CASC19-241ENST00000641582 PRR23BQ6ZRT6 265 aa6.85□□□□□ -1.31
CASC19-241ENST00000641582 TOP6BLQ8N6T0 577 aa6.85□□□□□ -1.31
CASC19-241ENST00000641582 KCT2Q8NC54 265 aa6.85□□□□□ -1.31
CASC19-241ENST00000641582 PHC3Q8NDX5 983 aa6.85□□□□□ -1.31
CASC19-241ENST00000641582 ZNF507Q8TCN5 953 aa6.85□□□□□ -1.31
CASC19-241ENST00000641582 WNT10AQ9GZT5 417 aa6.85□□□□□ -1.31
CASC19-241ENST00000641582 CTNND2Q9UQB3 1225 aa6.85□□□□□ -1.31
CASC19-241ENST00000641582 TLR6Q9Y2C9 796 aa6.85□□□□□ -1.31
CASC19-241ENST00000641582 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa6.84□□□□□ -1.31
CASC19-241ENST00000641582 LMNB1P20700 586 aa6.84□□□□□ -1.31
CASC19-241ENST00000641582 CDC37L1Q7L3B6 337 aa6.84□□□□□ -1.31
CASC19-241ENST00000641582 FAM214BQ7L5A3 538 aa6.84□□□□□ -1.31
CASC19-241ENST00000641582 GIPC2Q8TF65 315 aa6.84□□□□□ -1.31
CASC19-241ENST00000641582 CECR2Q9BXF3 1484 aa6.84□□□□□ -1.31
CASC19-241ENST00000641582 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa6.84□□□□□ -1.31
CASC19-241ENST00000641582 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
CASC19-241ENST00000641582 NFIBO00712 420 aa6.84□□□□□ -1.32
CASC19-241ENST00000641582 FYB2Q5VWT5 728 aa6.84□□□□□ -1.32
CASC19-241ENST00000641582 FBRSQ9HAH7 460 aa6.84□□□□□ -1.32
CASC19-241ENST00000641582 PRDM10Q9NQV6 1147 aa6.84□□□□□ -1.32
CASC19-241ENST00000641582 TACC3Q9Y6A5 838 aa6.84□□□□□ -1.32
CASC19-241ENST00000641582 LRIG2O94898 1065 aa6.83□□□□□ -1.32
CASC19-241ENST00000641582 ITGAEP38570 1179 aa6.83□□□□□ -1.32
CASC19-241ENST00000641582 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP6.83□□□□□ -1.32
CASC19-241ENST00000641582 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
CASC19-241ENST00000641582 ARMCX6Q7L4S7 300 aa6.83□□□□□ -1.32
CASC19-241ENST00000641582 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
CASC19-241ENST00000641582 TNKS2Q9H2K2 1166 aa6.83□□□□□ -1.32
CASC19-241ENST00000641582 UNC13AQ9UPW8 1703 aa6.82□□□□□ -1.32
CASC19-241ENST00000641582 GLI1P08151 1106 aa6.82□□□□□ -1.32
CASC19-241ENST00000641582 CAP2P40123 477 aa6.82□□□□□ -1.32
CASC19-241ENST00000641582 AFMP43652 599 aa6.82□□□□□ -1.32
CASC19-241ENST00000641582 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
CASC19-241ENST00000641582 NKG7Q16617 165 aa6.82□□□□□ -1.32
CASC19-241ENST00000641582 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa6.82□□□□□ -1.32
CASC19-241ENST00000641582 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa6.82□□□□□ -1.32
CASC19-241ENST00000641582 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
CASC19-241ENST00000641582 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.4 ms