RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP33.62■■■□□ 2.97
CAPNS1-217ENST00000629983 Q7L0L9 218 aa33.62■■■□□ 2.97
CAPNS1-217ENST00000629983 PAGR1Q9BTK6 254 aa33.62■■■□□ 2.97
CAPNS1-217ENST00000629983 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP33.62■■■□□ 2.97
CAPNS1-217ENST00000629983 MAPK4P31152 587 aa33.61■■■□□ 2.97
CAPNS1-217ENST00000629983 RARSP54136 660 aaKnown RBP33.61■■■□□ 2.97
CAPNS1-217ENST00000629983 TTC39AQ5SRH9 613 aa33.61■■■□□ 2.97
CAPNS1-217ENST00000629983 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP33.61■■■□□ 2.97
CAPNS1-217ENST00000629983 TDHQ8IZJ6 230 aa33.61■■■□□ 2.97
CAPNS1-217ENST00000629983 C19orf81C9J6K1 198 aa33.6■■■□□ 2.97
CAPNS1-217ENST00000629983 USP17L10C9JJH3 530 aa33.6■■■□□ 2.97
CAPNS1-217ENST00000629983 GNAI2P04899 355 aa33.6■■■□□ 2.97
CAPNS1-217ENST00000629983 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa33.6■■■□□ 2.97
CAPNS1-217ENST00000629983 GPR153Q6NV75 609 aa33.6■■■□□ 2.97
CAPNS1-217ENST00000629983 ATAD5Q96QE3 1844 aa33.6■■■□□ 2.97
CAPNS1-217ENST00000629983 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP33.59■■■□□ 2.97
CAPNS1-217ENST00000629983 PFASO15067 1338 aa33.59■■■□□ 2.97
CAPNS1-217ENST00000629983 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP33.59■■■□□ 2.97
CAPNS1-217ENST00000629983 JAG1P78504 1218 aa33.59■■■□□ 2.97
CAPNS1-217ENST00000629983 FLT1P17948 1338 aa33.58■■■□□ 2.97
CAPNS1-217ENST00000629983 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP33.58■■■□□ 2.97
CAPNS1-217ENST00000629983 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP33.58■■■□□ 2.97
CAPNS1-217ENST00000629983 LRIT3Q3SXY7 679 aa33.58■■■□□ 2.97
CAPNS1-217ENST00000629983 ARHGAP45Q92619 1136 aa33.58■■■□□ 2.97
CAPNS1-217ENST00000629983 DNAJC18Q9H819 358 aa33.58■■■□□ 2.97
CAPNS1-217ENST00000629983 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP33.58■■■□□ 2.97
CAPNS1-217ENST00000629983 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa33.58■■■□□ 2.97
CAPNS1-217ENST00000629983 LAMA3Q16787 3333 aa33.58■■■□□ 2.97
CAPNS1-217ENST00000629983 RGS2P41220 211 aa33.57■■■□□ 2.96
CAPNS1-217ENST00000629983 ERVK-9P63128 1117 aa33.57■■■□□ 2.96
CAPNS1-217ENST00000629983 ERVK-24P63145 666 aa33.57■■■□□ 2.96
CAPNS1-217ENST00000629983 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP33.57■■■□□ 2.96
CAPNS1-217ENST00000629983 RBPJLQ9UBG7 517 aa33.57■■■□□ 2.96
CAPNS1-217ENST00000629983 PALD1Q9ULE6 856 aa33.57■■■□□ 2.96
CAPNS1-217ENST00000629983 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa33.56■■■□□ 2.96
CAPNS1-217ENST00000629983 HLA-DOAP06340 250 aa33.56■■■□□ 2.96
CAPNS1-217ENST00000629983 GPR142Q7Z601 462 aa33.56■■■□□ 2.96
CAPNS1-217ENST00000629983 PLEKHH3Q7Z736 793 aa33.56■■■□□ 2.96
CAPNS1-217ENST00000629983 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP33.56■■■□□ 2.96
CAPNS1-217ENST00000629983 PORCNQ9H237 461 aa33.56■■■□□ 2.96
CAPNS1-217ENST00000629983 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP33.55■■■□□ 2.96
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC158Q5M9N0 1113 aa33.55■■■□□ 2.96
CAPNS1-217ENST00000629983 GINM1Q9NU53 330 aa33.55■■■□□ 2.96
CAPNS1-217ENST00000629983 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP33.54■■■□□ 2.96
CAPNS1-217ENST00000629983 CCL14Q16627 93 aa33.54■■■□□ 2.96
CAPNS1-217ENST00000629983 Q3C1V9 767 aa33.54■■■□□ 2.96
CAPNS1-217ENST00000629983 APBA2Q99767 749 aa33.54■■■□□ 2.96
CAPNS1-217ENST00000629983 PPP4CP60510 307 aa33.53■■■□□ 2.96
CAPNS1-217ENST00000629983 USP17L2Q6R6M4 530 aa33.53■■■□□ 2.96
CAPNS1-217ENST00000629983 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa33.53■■■□□ 2.96
CAPNS1-217ENST00000629983 ADGRA1Q86SQ6 560 aa33.53■■■□□ 2.96
CAPNS1-217ENST00000629983 FEZ1Q99689 392 aa33.53■■■□□ 2.96
CAPNS1-217ENST00000629983 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP33.52■■■□□ 2.96
CAPNS1-217ENST00000629983 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP33.52■■■□□ 2.96
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CAPNS1-217ENST00000629983 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP33.52■■■□□ 2.96
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CAPNS1-217ENST00000629983 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa33.52■■■□□ 2.96
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CAPNS1-217ENST00000629983 MORN1Q5T089 497 aa33.5■■■□□ 2.95
CAPNS1-217ENST00000629983 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP33.5■■■□□ 2.95
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CAPNS1-217ENST00000629983 MTMR10Q9NXD2 777 aa33.5■■■□□ 2.95
CAPNS1-217ENST00000629983 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa33.5■■■□□ 2.95
CAPNS1-217ENST00000629983 GH2P01242 217 aa33.49■■■□□ 2.95
CAPNS1-217ENST00000629983 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP33.49■■■□□ 2.95
CAPNS1-217ENST00000629983 CLUAP1Q96AJ1 413 aa33.49■■■□□ 2.95
CAPNS1-217ENST00000629983 TNNQ9UQP3 1299 aa33.49■■■□□ 2.95
CAPNS1-217ENST00000629983 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa33.49■■■□□ 2.95
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CAPNS1-217ENST00000629983 COL6A3P12111 3177 aa33.47■■■□□ 2.95
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CAPNS1-217ENST00000629983 USP17L13C9JLJ4 530 aa33.45■■■□□ 2.95
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CAPNS1-217ENST00000629983 USP17L18D6R9N7 530 aa33.45■■■□□ 2.95
CAPNS1-217ENST00000629983 USP17L22D6RA61 530 aa33.45■■■□□ 2.95
CAPNS1-217ENST00000629983 USP17L17D6RBQ6 530 aa33.45■■■□□ 2.95
CAPNS1-217ENST00000629983 USP17L19D6RCP7 530 aa33.45■■■□□ 2.95
CAPNS1-217ENST00000629983 USP17L20D6RJB6 530 aa33.45■■■□□ 2.95
CAPNS1-217ENST00000629983 USP5P45974 858 aa33.45■■■□□ 2.95
CAPNS1-217ENST00000629983 USP17L24Q0WX57 530 aa33.45■■■□□ 2.95
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