RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623052.1

C9orf170-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 170, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf170, Length 3,239 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170-201ENST00000623052 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
C9orf170-201ENST00000623052 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
C9orf170-201ENST00000623052 CCDC152Q4G0S7 254 aa15.34■□□□□ 0.05
C9orf170-201ENST00000623052 ACSBG1Q96GR2 724 aa15.34■□□□□ 0.05
C9orf170-201ENST00000623052 ERO1AQ96HE7 468 aa15.34■□□□□ 0.05
C9orf170-201ENST00000623052 TNKSO95271 1327 aa15.34■□□□□ 0.05
C9orf170-201ENST00000623052 MYH13Q9UKX3 1938 aa15.33■□□□□ 0.05
C9orf170-201ENST00000623052 SERPINC1P01008 464 aa15.33■□□□□ 0.04
C9orf170-201ENST00000623052 MORC3Q14149 939 aa15.33■□□□□ 0.04
C9orf170-201ENST00000623052 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP15.33■□□□□ 0.04
C9orf170-201ENST00000623052 REXO1L1PQ8IX06 675 aa15.33■□□□□ 0.04
C9orf170-201ENST00000623052 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP15.33■□□□□ 0.04
C9orf170-201ENST00000623052 WASF1Q92558 559 aa15.33■□□□□ 0.04
C9orf170-201ENST00000623052 PKNOX2Q96KN3 472 aa15.33■□□□□ 0.04
C9orf170-201ENST00000623052 CYP7A1P22680 504 aa15.33■□□□□ 0.04
C9orf170-201ENST00000623052 ATP6V1AP38606 617 aa15.33■□□□□ 0.04
C9orf170-201ENST00000623052 GYG1P46976 350 aa15.33■□□□□ 0.04
C9orf170-201ENST00000623052 CFAP100Q494V2 611 aa15.33■□□□□ 0.04
C9orf170-201ENST00000623052 NUP133Q8WUM0 1156 aa15.33■□□□□ 0.04
C9orf170-201ENST00000623052 CSRNP2Q9H175 543 aa15.33■□□□□ 0.04
C9orf170-201ENST00000623052 ANAPC4Q9UJX5 808 aa15.33■□□□□ 0.04
C9orf170-201ENST00000623052 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa15.32■□□□□ 0.04
C9orf170-201ENST00000623052 SLU7O95391 586 aaKnown RBP15.32■□□□□ 0.04
C9orf170-201ENST00000623052 RILPL1Q5EBL4 403 aa15.32■□□□□ 0.04
C9orf170-201ENST00000623052 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP15.32■□□□□ 0.04
C9orf170-201ENST00000623052 FEZ1Q99689 392 aa15.32■□□□□ 0.04
C9orf170-201ENST00000623052 NACAP1Q9BZK3 213 aa15.32■□□□□ 0.04
C9orf170-201ENST00000623052 LRP2BPQ9P2M1 347 aa15.32■□□□□ 0.04
C9orf170-201ENST00000623052 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP15.32■□□□□ 0.04
C9orf170-201ENST00000623052 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa15.32■□□□□ 0.04
C9orf170-201ENST00000623052 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP15.32■□□□□ 0.04
C9orf170-201ENST00000623052 SPATA20Q8TB22 786 aa15.32■□□□□ 0.04
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF446Q9NWS9 450 aa15.32■□□□□ 0.04
C9orf170-201ENST00000623052 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP15.32■□□□□ 0.04
C9orf170-201ENST00000623052 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa15.32■□□□□ 0.04
C9orf170-201ENST00000623052 PRDM1O75626 825 aa15.32■□□□□ 0.04
C9orf170-201ENST00000623052 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP15.32■□□□□ 0.04
C9orf170-201ENST00000623052 RCAN1P53805 252 aa15.32■□□□□ 0.04
C9orf170-201ENST00000623052 SIK1P57059 783 aa15.32■□□□□ 0.04
C9orf170-201ENST00000623052 NPY5RQ15761 445 aa15.32■□□□□ 0.04
C9orf170-201ENST00000623052 TRIM22Q8IYM9 498 aa15.32■□□□□ 0.04
C9orf170-201ENST00000623052 MTA3Q9BTC8 594 aa15.32■□□□□ 0.04
C9orf170-201ENST00000623052 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP15.31■□□□□ 0.04
C9orf170-201ENST00000623052 PLEKHA8P1O95397 391 aa15.31■□□□□ 0.04
C9orf170-201ENST00000623052 PARP10Q53GL7 1025 aa15.31■□□□□ 0.04
C9orf170-201ENST00000623052 OLFM4Q6UX06 510 aa15.31■□□□□ 0.04
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP15.31■□□□□ 0.04
C9orf170-201ENST00000623052 CABP5Q9NP86 173 aa15.31■□□□□ 0.04
C9orf170-201ENST00000623052 OGFRQ9NZT2 677 aa15.31■□□□□ 0.04
C9orf170-201ENST00000623052 VPS54Q9P1Q0 977 aa15.31■□□□□ 0.04
C9orf170-201ENST00000623052 MINDY4BA8MYZ0 360 aa15.31■□□□□ 0.04
C9orf170-201ENST00000623052 PDILTQ8N807 584 aa15.31■□□□□ 0.04
C9orf170-201ENST00000623052 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP15.31■□□□□ 0.04
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP15.31■□□□□ 0.04
C9orf170-201ENST00000623052 FAM53CQ9NYF3 392 aa15.31■□□□□ 0.04
C9orf170-201ENST00000623052 CBFA2T2O43439 604 aa15.3■□□□□ 0.04
C9orf170-201ENST00000623052 SART3Q15020 963 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
C9orf170-201ENST00000623052 PHF20Q9BVI0 1012 aa15.3■□□□□ 0.04
C9orf170-201ENST00000623052 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP15.3■□□□□ 0.04
C9orf170-201ENST00000623052 VWA3AA6NCI4 1184 aa15.3■□□□□ 0.04
C9orf170-201ENST00000623052 ADAMTS3O15072 1205 aa15.3■□□□□ 0.04
C9orf170-201ENST00000623052 ATP2B1P20020 1258 aa15.3■□□□□ 0.04
C9orf170-201ENST00000623052 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP15.3■□□□□ 0.04
C9orf170-201ENST00000623052 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
C9orf170-201ENST00000623052 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa15.3■□□□□ 0.04
C9orf170-201ENST00000623052 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa15.3■□□□□ 0.04
C9orf170-201ENST00000623052 KLRK1P26718 216 aa15.3■□□□□ 0.04
C9orf170-201ENST00000623052 CASP1P29466 404 aa15.3■□□□□ 0.04
C9orf170-201ENST00000623052 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
C9orf170-201ENST00000623052 TC2NQ8N9U0 490 aa15.3■□□□□ 0.04
C9orf170-201ENST00000623052 TNFRSF25Q93038 417 aa15.3■□□□□ 0.04
C9orf170-201ENST00000623052 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP15.3■□□□□ 0.04
C9orf170-201ENST00000623052 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
C9orf170-201ENST00000623052 ABCF2Q9UG63 623 aa15.3■□□□□ 0.04
C9orf170-201ENST00000623052 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP15.3■□□□□ 0.04
C9orf170-201ENST00000623052 TOP1P11387 765 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
C9orf170-201ENST00000623052 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa15.29■□□□□ 0.04
C9orf170-201ENST00000623052 EPSTI1Q96J88 318 aa15.29■□□□□ 0.04
C9orf170-201ENST00000623052 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
C9orf170-201ENST00000623052 ERICH2A1L162 156 aa15.29■□□□□ 0.04
C9orf170-201ENST00000623052 MYO1BO43795 1136 aa15.29■□□□□ 0.04
C9orf170-201ENST00000623052 ETF1P62495 437 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
C9orf170-201ENST00000623052 ERFEQ4G0M1 354 aa15.29■□□□□ 0.04
C9orf170-201ENST00000623052 UBAC1Q9BSL1 405 aa15.29■□□□□ 0.04
C9orf170-201ENST00000623052 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa15.29■□□□□ 0.04
C9orf170-201ENST00000623052 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa15.29■□□□□ 0.04
C9orf170-201ENST00000623052 CD44P16070 742 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
C9orf170-201ENST00000623052 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
C9orf170-201ENST00000623052 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
C9orf170-201ENST00000623052 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP15.28■□□□□ 0.04
C9orf170-201ENST00000623052 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
C9orf170-201ENST00000623052 TROAPQ12815 778 aa15.28■□□□□ 0.04
C9orf170-201ENST00000623052 TMTC2Q8N394 836 aa15.28■□□□□ 0.04
C9orf170-201ENST00000623052 A0A0G2JS52 829 aa15.28■□□□□ 0.04
C9orf170-201ENST00000623052 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa15.28■□□□□ 0.04
C9orf170-201ENST00000623052 NPHP1O15259 732 aa15.28■□□□□ 0.04
C9orf170-201ENST00000623052 FGRP09769 529 aa15.28■□□□□ 0.04
C9orf170-201ENST00000623052 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa15.28■□□□□ 0.04
C9orf170-201ENST00000623052 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa15.28■□□□□ 0.04
C9orf170-201ENST00000623052 SMARCE1Q969G3 411 aa15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19 ms