RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622362.1

FAM200B-223, Transcript of family with sequence similarity 200 member B, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FAM200B, Length 4,377 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM200B-223	ENST00000622362	BAG3	O95817	575 aa		13.08	□□□□□ -0.32
FAM200B-223	ENST00000622362	CLTA	P09496	248 aa		13.08	□□□□□ -0.32
FAM200B-223	ENST00000622362	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		13.08	□□□□□ -0.32
FAM200B-223	ENST00000622362	SEPT14	Q6ZU15	432 aa		13.08	□□□□□ -0.32
FAM200B-223	ENST00000622362	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		13.08	□□□□□ -0.32
FAM200B-223	ENST00000622362	BICD1	Q96G01	975 aa		13.08	□□□□□ -0.32
FAM200B-223	ENST00000622362	CAPS2	Q9BXY5	557 aa		13.08	□□□□□ -0.32
FAM200B-223	ENST00000622362	CRNKL1	Q9BZJ0	848 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
FAM200B-223	ENST00000622362	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		13.08	□□□□□ -0.32
FAM200B-223	ENST00000622362	NOL3	O60936	208 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
FAM200B-223	ENST00000622362	TSPY3	P0CV98	308 aa		13.08	□□□□□ -0.32
FAM200B-223	ENST00000622362	TSPY8	P0CW00	308 aa		13.08	□□□□□ -0.32
FAM200B-223	ENST00000622362	TNNI2	P48788	182 aa		13.08	□□□□□ -0.32
FAM200B-223	ENST00000622362	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		13.08	□□□□□ -0.32
FAM200B-223	ENST00000622362	FERMT1	Q9BQL6	677 aa		13.08	□□□□□ -0.32
FAM200B-223	ENST00000622362	VCX3B	Q9H321	246 aa		13.08	□□□□□ -0.32
FAM200B-223	ENST00000622362	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
FAM200B-223	ENST00000622362	TXNDC9	O14530	226 aa		13.07	□□□□□ -0.32
FAM200B-223	ENST00000622362	GBP1	P32455	592 aa		13.07	□□□□□ -0.32
FAM200B-223	ENST00000622362	TFCP2	Q12800	502 aa		13.07	□□□□□ -0.32
FAM200B-223	ENST00000622362	AP1AR	Q63HQ0	302 aa		13.07	□□□□□ -0.32
FAM200B-223	ENST00000622362	CACTIN	Q8WUQ7	758 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
FAM200B-223	ENST00000622362	ANAPC4	Q9UJX5	808 aa		13.07	□□□□□ -0.32
FAM200B-223	ENST00000622362	PPP2R2C	Q9Y2T4	447 aa		13.07	□□□□□ -0.32
FAM200B-223	ENST00000622362	UTP11	Q9Y3A2	253 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
FAM200B-223	ENST00000622362	SPOP	O43791	374 aa		13.07	□□□□□ -0.32
FAM200B-223	ENST00000622362	PPFIA4	O75335	1185 aa		13.07	□□□□□ -0.32
FAM200B-223	ENST00000622362	LDHC	P07864	332 aa		13.07	□□□□□ -0.32
FAM200B-223	ENST00000622362	HSPA1L	P34931	641 aa		13.07	□□□□□ -0.32
FAM200B-223	ENST00000622362	TIMM10	P62072	90 aa		13.07	□□□□□ -0.32
FAM200B-223	ENST00000622362	PDE4D	Q08499	809 aa		13.07	□□□□□ -0.32
FAM200B-223	ENST00000622362	INF2	Q27J81	1249 aa		13.07	□□□□□ -0.32
FAM200B-223	ENST00000622362	CFAP221	Q4G0U5	840 aa		13.07	□□□□□ -0.32
FAM200B-223	ENST00000622362	VPS52	Q8N1B4	723 aa		13.07	□□□□□ -0.32
FAM200B-223	ENST00000622362	TBC1D31	Q96DN5	1066 aa		13.07	□□□□□ -0.32
FAM200B-223	ENST00000622362	MRFAP1L1	Q96HT8	127 aa		13.07	□□□□□ -0.32
FAM200B-223	ENST00000622362	LLPH	Q9BRT6	129 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
FAM200B-223	ENST00000622362	PALD1	Q9ULE6	856 aa		13.07	□□□□□ -0.32
FAM200B-223	ENST00000622362	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
FAM200B-223	ENST00000622362	CIB2	O75838	187 aa		13.07	□□□□□ -0.32
FAM200B-223	ENST00000622362	ME3	Q16798	604 aa		13.07	□□□□□ -0.32
FAM200B-223	ENST00000622362	GKAP1	Q5VSY0	366 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32
FAM200B-223	ENST00000622362	TTC19	Q6DKK2	380 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32
FAM200B-223	ENST00000622362	HIP1R	O75146	1068 aa		13.06	□□□□□ -0.32
FAM200B-223	ENST00000622362	RPSA	P08865	295 aa	Known RBP	13.06	□□□□□ -0.32
FAM200B-223	ENST00000622362	PAK1	Q13153	545 aa		13.06	□□□□□ -0.32
FAM200B-223	ENST00000622362	PSMD6	Q15008	389 aa		13.06	□□□□□ -0.32
FAM200B-223	ENST00000622362	MIGA1	Q8NAN2	632 aa		13.06	□□□□□ -0.32
FAM200B-223	ENST00000622362	VEZT	Q9HBM0	779 aa		13.06	□□□□□ -0.32
FAM200B-223	ENST00000622362		B4E1Z4	1266 aa		13.06	□□□□□ -0.32
FAM200B-223	ENST00000622362	ANKRD65	E5RJM6	399 aa		13.06	□□□□□ -0.32
FAM200B-223	ENST00000622362	ATP5D	P30049	168 aa		13.06	□□□□□ -0.32
FAM200B-223	ENST00000622362	HNRNPH2	P55795	449 aa	Known RBP	13.06	□□□□□ -0.32
FAM200B-223	ENST00000622362	FAM204A	Q9H8W3	233 aa		13.06	□□□□□ -0.32
FAM200B-223	ENST00000622362	TXNDC16	Q9P2K2	825 aa		13.06	□□□□□ -0.32
FAM200B-223	ENST00000622362	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		13.06	□□□□□ -0.32
FAM200B-223	ENST00000622362	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		13.06	□□□□□ -0.32
FAM200B-223	ENST00000622362	USP54	Q70EL1	1684 aa		13.06	□□□□□ -0.32
FAM200B-223	ENST00000622362	CUTA	O60888	179 aa		13.06	□□□□□ -0.32
FAM200B-223	ENST00000622362	RNF10	Q8N5U6	811 aa	Known RBP	13.06	□□□□□ -0.32
FAM200B-223	ENST00000622362	USP28	Q96RU2	1077 aa		13.06	□□□□□ -0.32
FAM200B-223	ENST00000622362	MED4	Q9NPJ6	270 aa		13.06	□□□□□ -0.32
FAM200B-223	ENST00000622362	MTMR6	Q9Y217	621 aa		13.06	□□□□□ -0.32
FAM200B-223	ENST00000622362	MSH6	P52701	1360 aa		13.06	□□□□□ -0.32
FAM200B-223	ENST00000622362	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		13.06	□□□□□ -0.32
FAM200B-223	ENST00000622362	POSTN	Q15063	836 aa		13.06	□□□□□ -0.32
FAM200B-223	ENST00000622362	E2F5	Q15329	346 aa		13.06	□□□□□ -0.32
FAM200B-223	ENST00000622362	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	13.06	□□□□□ -0.32
FAM200B-223	ENST00000622362	SEL1L2	Q5TEA6	688 aa		13.06	□□□□□ -0.32
FAM200B-223	ENST00000622362	SDCCAG8	Q86SQ7	713 aa	Predicted RBP	13.06	□□□□□ -0.32
FAM200B-223	ENST00000622362	MGARP	Q8TDB4	240 aa		13.06	□□□□□ -0.32
FAM200B-223	ENST00000622362	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	13.06	□□□□□ -0.32
FAM200B-223	ENST00000622362	ITSN1	Q15811	1721 aa		13.06	□□□□□ -0.32
FAM200B-223	ENST00000622362	KIF3C	O14782	793 aa		13.05	□□□□□ -0.32
FAM200B-223	ENST00000622362	CD2BP2	O95400	341 aa	Known RBP	13.05	□□□□□ -0.32
FAM200B-223	ENST00000622362	GSPT1	P15170	499 aa	Known RBP	13.05	□□□□□ -0.32
FAM200B-223	ENST00000622362	LONRF2	Q1L5Z9	754 aa		13.05	□□□□□ -0.32
FAM200B-223	ENST00000622362	USP37	Q86T82	979 aa		13.05	□□□□□ -0.32
FAM200B-223	ENST00000622362	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	13.05	□□□□□ -0.32
FAM200B-223	ENST00000622362	DDX23	Q9BUQ8	820 aa	Known RBP	13.05	□□□□□ -0.32
FAM200B-223	ENST00000622362	ERBB4	Q15303	1308 aa		13.05	□□□□□ -0.32
FAM200B-223	ENST00000622362	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	13.05	□□□□□ -0.32
FAM200B-223	ENST00000622362	ZNF853	P0CG23	659 aa		13.05	□□□□□ -0.32
FAM200B-223	ENST00000622362	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	13.05	□□□□□ -0.32
FAM200B-223	ENST00000622362	AKNAD1	Q5T1N1	836 aa		13.05	□□□□□ -0.32
FAM200B-223	ENST00000622362	KCTD16	Q68DU8	428 aa		13.05	□□□□□ -0.32
FAM200B-223	ENST00000622362	RPUSD2	Q8IZ73	545 aa	Known RBP	13.05	□□□□□ -0.32
FAM200B-223	ENST00000622362	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		13.05	□□□□□ -0.32
FAM200B-223	ENST00000622362	RABGGTA	Q92696	567 aa		13.05	□□□□□ -0.32
FAM200B-223	ENST00000622362	C6orf50	Q9HD87	102 aa		13.05	□□□□□ -0.32
FAM200B-223	ENST00000622362	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	13.05	□□□□□ -0.32
FAM200B-223	ENST00000622362	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		13.05	□□□□□ -0.32
FAM200B-223	ENST00000622362	CETN3	O15182	167 aa		13.05	□□□□□ -0.32
FAM200B-223	ENST00000622362	TPD52	P55327	224 aa	Predicted RBP	13.05	□□□□□ -0.32
FAM200B-223	ENST00000622362	PNOC	Q13519	176 aa		13.05	□□□□□ -0.32
FAM200B-223	ENST00000622362	LETM2	Q2VYF4	491 aa		13.05	□□□□□ -0.32
FAM200B-223	ENST00000622362	CFAP157	Q5JU67	520 aa		13.05	□□□□□ -0.32
FAM200B-223	ENST00000622362	FAM71B	Q8TC56	605 aa		13.05	□□□□□ -0.32
FAM200B-223	ENST00000622362	PHKB	Q93100	1093 aa		13.05	□□□□□ -0.32
FAM200B-223	ENST00000622362	RPGRIP1	Q96KN7	1286 aa		13.05	□□□□□ -0.32

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