RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613541.1

STX4-217, Transcript of syntaxin 4, humanhuman

TSL 2

Gene STX4, Length 649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4-217ENST00000613541 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa21.03■□□□□ 0.96
STX4-217ENST00000613541 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP21.03■□□□□ 0.96
STX4-217ENST00000613541 MEIS3Q99687 375 aa21.03■□□□□ 0.96
STX4-217ENST00000613541 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP21.03■□□□□ 0.96
STX4-217ENST00000613541 MTMR10Q9NXD2 777 aa21.03■□□□□ 0.96
STX4-217ENST00000613541 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.96
STX4-217ENST00000613541 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP21.02■□□□□ 0.96
STX4-217ENST00000613541 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa21.02■□□□□ 0.96
STX4-217ENST00000613541 ARHGAP45Q92619 1136 aa21.02■□□□□ 0.96
STX4-217ENST00000613541 COL6A1P12109 1028 aa21.01■□□□□ 0.95
STX4-217ENST00000613541 ERVK-9P63128 1117 aa21.01■□□□□ 0.95
STX4-217ENST00000613541 ERVK-24P63145 666 aa21.01■□□□□ 0.95
STX4-217ENST00000613541 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
STX4-217ENST00000613541 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
STX4-217ENST00000613541 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
STX4-217ENST00000613541 PLEKHH3Q7Z736 793 aa21.01■□□□□ 0.95
STX4-217ENST00000613541 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
STX4-217ENST00000613541 PLXNB2O15031 1838 aa21.01■□□□□ 0.95
STX4-217ENST00000613541 PFASO15067 1338 aa21.01■□□□□ 0.95
STX4-217ENST00000613541 PPP4CP60510 307 aa21■□□□□ 0.95
STX4-217ENST00000613541 CCNA1P78396 465 aa21■□□□□ 0.95
STX4-217ENST00000613541 Q7L0L9 218 aa21■□□□□ 0.95
STX4-217ENST00000613541 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP21■□□□□ 0.95
STX4-217ENST00000613541 APBA2Q99767 749 aa21■□□□□ 0.95
STX4-217ENST00000613541 TXNRD2Q9NNW7 524 aa21■□□□□ 0.95
STX4-217ENST00000613541 HLA-DOAP06340 250 aa20.99■□□□□ 0.95
STX4-217ENST00000613541 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
STX4-217ENST00000613541 USP17L2Q6R6M4 530 aa20.99■□□□□ 0.95
STX4-217ENST00000613541 GPR142Q7Z601 462 aa20.99■□□□□ 0.95
STX4-217ENST00000613541 USP6NLQ92738 828 aa20.99■□□□□ 0.95
STX4-217ENST00000613541 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
STX4-217ENST00000613541 RBPJLQ9UBG7 517 aa20.99■□□□□ 0.95
STX4-217ENST00000613541 MCAMP43121 646 aa20.98■□□□□ 0.95
STX4-217ENST00000613541 MORN1Q5T089 497 aa20.98■□□□□ 0.95
STX4-217ENST00000613541 MFSD14CQ5VZR4 134 aa20.98■□□□□ 0.95
STX4-217ENST00000613541 PI16Q6UXB8 463 aa20.98■□□□□ 0.95
STX4-217ENST00000613541 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
STX4-217ENST00000613541 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa20.98■□□□□ 0.95
STX4-217ENST00000613541 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP20.98■□□□□ 0.95
STX4-217ENST00000613541 MSCO60682 206 aa20.97■□□□□ 0.95
STX4-217ENST00000613541 CCDC158Q5M9N0 1113 aa20.97■□□□□ 0.95
STX4-217ENST00000613541 LHX8Q68G74 356 aa20.97■□□□□ 0.95
STX4-217ENST00000613541 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa20.97■□□□□ 0.95
STX4-217ENST00000613541 CDCA7LQ96GN5 454 aa20.97■□□□□ 0.95
STX4-217ENST00000613541 PAGR1Q9BTK6 254 aa20.97■□□□□ 0.95
STX4-217ENST00000613541 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa20.97■□□□□ 0.95
STX4-217ENST00000613541 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa20.97■□□□□ 0.95
STX4-217ENST00000613541 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
STX4-217ENST00000613541 GNAI2P04899 355 aa20.96■□□□□ 0.95
STX4-217ENST00000613541 MAP2K5Q13163 448 aa20.96■□□□□ 0.95
STX4-217ENST00000613541 Q3C1V9 767 aa20.96■□□□□ 0.95
STX4-217ENST00000613541 TTC39AQ5SRH9 613 aa20.96■□□□□ 0.95
STX4-217ENST00000613541 CERS3Q8IU89 383 aa20.96■□□□□ 0.95
STX4-217ENST00000613541 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
STX4-217ENST00000613541 FLT1P17948 1338 aa20.96■□□□□ 0.95
STX4-217ENST00000613541 LAMA3Q16787 3333 aa20.96■□□□□ 0.95
STX4-217ENST00000613541 USP17L15C9J2P7 530 aa20.95■□□□□ 0.94
STX4-217ENST00000613541 USP17L13C9JLJ4 530 aa20.95■□□□□ 0.94
STX4-217ENST00000613541 USP17L11C9JVI0 530 aa20.95■□□□□ 0.94
STX4-217ENST00000613541 USP17L18D6R9N7 530 aa20.95■□□□□ 0.94
STX4-217ENST00000613541 USP17L22D6RA61 530 aa20.95■□□□□ 0.94
STX4-217ENST00000613541 USP17L17D6RBQ6 530 aa20.95■□□□□ 0.94
STX4-217ENST00000613541 USP17L19D6RCP7 530 aa20.95■□□□□ 0.94
STX4-217ENST00000613541 USP17L20D6RJB6 530 aa20.95■□□□□ 0.94
STX4-217ENST00000613541 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
STX4-217ENST00000613541 USP14P54578 494 aa20.95■□□□□ 0.94
STX4-217ENST00000613541 USP17L24Q0WX57 530 aa20.95■□□□□ 0.94
STX4-217ENST00000613541 LRRC26Q2I0M4 334 aa20.95■□□□□ 0.94
STX4-217ENST00000613541 PORCNQ9H237 461 aa20.95■□□□□ 0.94
STX4-217ENST00000613541 GPR108Q9NPR9 543 aa20.95■□□□□ 0.94
STX4-217ENST00000613541 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa20.95■□□□□ 0.94
STX4-217ENST00000613541 SLC15A5A6NIM6 579 aa20.94■□□□□ 0.94
STX4-217ENST00000613541 GDF11O95390 407 aa20.94■□□□□ 0.94
STX4-217ENST00000613541 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
STX4-217ENST00000613541 PALD1Q9ULE6 856 aa20.94■□□□□ 0.94
STX4-217ENST00000613541 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa20.94■□□□□ 0.94
STX4-217ENST00000613541 CCL14Q16627 93 aa20.93■□□□□ 0.94
STX4-217ENST00000613541 C12orf42Q96LP6 360 aa20.93■□□□□ 0.94
STX4-217ENST00000613541 FEZ1Q99689 392 aa20.93■□□□□ 0.94
STX4-217ENST00000613541 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
STX4-217ENST00000613541 DNAJC18Q9H819 358 aa20.93■□□□□ 0.94
STX4-217ENST00000613541 EMILIN3Q9NT22 766 aa20.93■□□□□ 0.94
STX4-217ENST00000613541 COL6A3P12111 3177 aa20.93■□□□□ 0.94
STX4-217ENST00000613541 RARSP54136 660 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
STX4-217ENST00000613541 ATP2B2Q01814 1243 aa20.92■□□□□ 0.94
STX4-217ENST00000613541 SNRKQ9NRH2 765 aa20.92■□□□□ 0.94
STX4-217ENST00000613541 A0A0C4DFX4 3053 aa20.91■□□□□ 0.94
STX4-217ENST00000613541 POTEB2H3BUK9 544 aa20.91■□□□□ 0.94
STX4-217ENST00000613541 SIPA1L1O43166 1804 aa20.91■□□□□ 0.94
STX4-217ENST00000613541 PEX10O60683 326 aa20.91■□□□□ 0.94
STX4-217ENST00000613541 JAG1P78504 1218 aa20.91■□□□□ 0.94
STX4-217ENST00000613541 WDR78Q5VTH9 848 aa20.91■□□□□ 0.94
STX4-217ENST00000613541 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP20.91■□□□□ 0.94
STX4-217ENST00000613541 LPAR1Q92633 364 aa20.91■□□□□ 0.94
STX4-217ENST00000613541 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
STX4-217ENST00000613541 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
STX4-217ENST00000613541 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
STX4-217ENST00000613541 MAST2Q6P0Q8 1798 aa20.9■□□□□ 0.94
STX4-217ENST00000613541 GH2P01242 217 aa20.9■□□□□ 0.94
STX4-217ENST00000613541 HOXC6P09630 235 aa20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.9 ms