RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613500.4

NLRP1-215, Transcript of NLR family pyrin domain containing 1, human

TSL 5 BASIC

Gene NLRP1, Length 4,494 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NLRP1-215	ENST00000613500	IRAK4	Q9NWZ3	460 aa		11.29	□□□□□ -0.6
NLRP1-215	ENST00000613500	USP17L8	P0C7I0	530 aa		11.28	□□□□□ -0.6
NLRP1-215	ENST00000613500	CNGA1	P29973	690 aa		11.28	□□□□□ -0.6
NLRP1-215	ENST00000613500	WTAP	Q15007	396 aa		11.28	□□□□□ -0.6
NLRP1-215	ENST00000613500	RNF168	Q8IYW5	571 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
NLRP1-215	ENST00000613500	RPUSD2	Q8IZ73	545 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
NLRP1-215	ENST00000613500	ANKS4B	Q8N8V4	417 aa		11.28	□□□□□ -0.6
NLRP1-215	ENST00000613500	BCAS4	Q8TDM0	211 aa		11.28	□□□□□ -0.6
NLRP1-215	ENST00000613500	KRT23	Q9C075	422 aa		11.28	□□□□□ -0.6
NLRP1-215	ENST00000613500	AS3MT	Q9HBK9	375 aa		11.28	□□□□□ -0.6
NLRP1-215	ENST00000613500	DDX41	Q9UJV9	622 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
NLRP1-215	ENST00000613500	DTNB	O60941	627 aa		11.28	□□□□□ -0.6
NLRP1-215	ENST00000613500	YEATS4	O95619	227 aa		11.28	□□□□□ -0.6
NLRP1-215	ENST00000613500	YY1	P25490	414 aa		11.28	□□□□□ -0.6
NLRP1-215	ENST00000613500	HPD	P32754	393 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
NLRP1-215	ENST00000613500	CCT5	P48643	541 aa		11.28	□□□□□ -0.6
NLRP1-215	ENST00000613500	TTC22	Q5TAA0	569 aa		11.28	□□□□□ -0.6
NLRP1-215	ENST00000613500	CCDC144CP	Q8IYA2	1237 aa		11.28	□□□□□ -0.6
NLRP1-215	ENST00000613500	CNNM3	Q8NE01	707 aa		11.28	□□□□□ -0.6
NLRP1-215	ENST00000613500	XPO5	Q9HAV4	1204 aa	Known RBP eCLIP	11.28	□□□□□ -0.6
NLRP1-215	ENST00000613500	SPC25	Q9HBM1	224 aa		11.28	□□□□□ -0.6
NLRP1-215	ENST00000613500	SLC5A4	Q9NY91	659 aa		11.28	□□□□□ -0.6
NLRP1-215	ENST00000613500	MRFAP1	Q9Y605	127 aa		11.28	□□□□□ -0.6
NLRP1-215	ENST00000613500	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		11.28	□□□□□ -0.6
NLRP1-215	ENST00000613500	STIM1	Q13586	685 aa		11.28	□□□□□ -0.6
NLRP1-215	ENST00000613500	PKP1	Q13835	747 aa		11.28	□□□□□ -0.6
NLRP1-215	ENST00000613500	NEDD9	Q14511	834 aa		11.28	□□□□□ -0.6
NLRP1-215	ENST00000613500	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		11.28	□□□□□ -0.6
NLRP1-215	ENST00000613500	COL15A1	P39059	1388 aa		11.28	□□□□□ -0.6
NLRP1-215	ENST00000613500	TRIM66	O15016	1216 aa		11.27	□□□□□ -0.6
NLRP1-215	ENST00000613500	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.6
NLRP1-215	ENST00000613500	GNAQ	P50148	359 aa		11.27	□□□□□ -0.6
NLRP1-215	ENST00000613500	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.6
NLRP1-215	ENST00000613500	WHAMMP3	Q1A5X7	153 aa		11.27	□□□□□ -0.6
NLRP1-215	ENST00000613500	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.6
NLRP1-215	ENST00000613500	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		11.27	□□□□□ -0.6
NLRP1-215	ENST00000613500	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		11.27	□□□□□ -0.6
NLRP1-215	ENST00000613500	NAA15	Q9BXJ9	866 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.6
NLRP1-215	ENST00000613500	CBX8	Q9HC52	389 aa		11.27	□□□□□ -0.6
NLRP1-215	ENST00000613500	USP17L3	A6NCW0	530 aa		11.27	□□□□□ -0.61
NLRP1-215	ENST00000613500	USP17L4	A6NCW7	530 aa		11.27	□□□□□ -0.61
NLRP1-215	ENST00000613500	USO1	O60763	962 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
NLRP1-215	ENST00000613500	BCAM	P50895	628 aa		11.27	□□□□□ -0.61
NLRP1-215	ENST00000613500	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		11.27	□□□□□ -0.61
NLRP1-215	ENST00000613500	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		11.27	□□□□□ -0.61
NLRP1-215	ENST00000613500	TGFBRAP1	Q8WUH2	860 aa		11.27	□□□□□ -0.61
NLRP1-215	ENST00000613500	SWAP70	Q9UH65	585 aa		11.27	□□□□□ -0.61
NLRP1-215	ENST00000613500	GYS2	P54840	703 aa		11.27	□□□□□ -0.61
NLRP1-215	ENST00000613500	CABS1	Q96KC9	395 aa		11.27	□□□□□ -0.61
NLRP1-215	ENST00000613500	CNNM2	Q9H8M5	875 aa		11.27	□□□□□ -0.61
NLRP1-215	ENST00000613500	TECPR2	O15040	1411 aa		11.27	□□□□□ -0.61
NLRP1-215	ENST00000613500	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
NLRP1-215	ENST00000613500	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
NLRP1-215	ENST00000613500	FBXO38	Q6PIJ6	1188 aa		11.27	□□□□□ -0.61
NLRP1-215	ENST00000613500	GPT2	Q8TD30	523 aa		11.27	□□□□□ -0.61
NLRP1-215	ENST00000613500	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		11.27	□□□□□ -0.61
NLRP1-215	ENST00000613500	HGS	O14964	777 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
NLRP1-215	ENST00000613500	MCMDC2	Q4G0Z9	681 aa		11.26	□□□□□ -0.61
NLRP1-215	ENST00000613500	MMS22L	Q6ZRQ5	1243 aa		11.26	□□□□□ -0.61
NLRP1-215	ENST00000613500	LMNTD2	Q8IXW0	634 aa		11.26	□□□□□ -0.61
NLRP1-215	ENST00000613500	MIPOL1	Q8TD10	442 aa		11.26	□□□□□ -0.61
NLRP1-215	ENST00000613500	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
NLRP1-215	ENST00000613500	CKAP4	Q07065	602 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
NLRP1-215	ENST00000613500	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
NLRP1-215	ENST00000613500	KIAA1524	Q8TCG1	905 aa		11.26	□□□□□ -0.61
NLRP1-215	ENST00000613500	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
NLRP1-215	ENST00000613500	RAB34	Q9BZG1	259 aa		11.26	□□□□□ -0.61
NLRP1-215	ENST00000613500	PDE11A	Q9HCR9	933 aa		11.26	□□□□□ -0.61
NLRP1-215	ENST00000613500	TPX2	Q9ULW0	747 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
NLRP1-215	ENST00000613500	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		11.26	□□□□□ -0.61
NLRP1-215	ENST00000613500	SEPT6	Q14141	434 aa		11.26	□□□□□ -0.61
NLRP1-215	ENST00000613500	HLF	Q16534	295 aa		11.26	□□□□□ -0.61
NLRP1-215	ENST00000613500	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		11.26	□□□□□ -0.61
NLRP1-215	ENST00000613500	EFCAB13	Q8IY85	973 aa		11.26	□□□□□ -0.61
NLRP1-215	ENST00000613500	TMTC2	Q8N394	836 aa		11.26	□□□□□ -0.61
NLRP1-215	ENST00000613500	ARFGAP2	Q8N6H7	521 aa		11.26	□□□□□ -0.61
NLRP1-215	ENST00000613500	SPATA5	Q8NB90	893 aa		11.26	□□□□□ -0.61
NLRP1-215	ENST00000613500	FAM114A2	Q9NRY5	505 aa		11.26	□□□□□ -0.61
NLRP1-215	ENST00000613500	SUFU	Q9UMX1	484 aa		11.26	□□□□□ -0.61
NLRP1-215	ENST00000613500	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		11.26	□□□□□ -0.61
NLRP1-215	ENST00000613500	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		11.26	□□□□□ -0.61
NLRP1-215	ENST00000613500	DCC	P43146	1447 aa		11.25	□□□□□ -0.61
NLRP1-215	ENST00000613500	TUBB	P07437	444 aa		11.25	□□□□□ -0.61
NLRP1-215	ENST00000613500	DPEP1	P16444	411 aa		11.25	□□□□□ -0.61
NLRP1-215	ENST00000613500	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
NLRP1-215	ENST00000613500	NSMF	Q6X4W1	530 aa		11.25	□□□□□ -0.61
NLRP1-215	ENST00000613500	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		11.25	□□□□□ -0.61
NLRP1-215	ENST00000613500	CXorf56	Q9H5V9	222 aa		11.25	□□□□□ -0.61
NLRP1-215	ENST00000613500	GUCA1B	Q9UMX6	200 aa		11.25	□□□□□ -0.61
NLRP1-215	ENST00000613500		A0A087WUV0	522 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
NLRP1-215	ENST00000613500	MAGEA9	P43362	315 aa		11.25	□□□□□ -0.61
NLRP1-215	ENST00000613500	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
NLRP1-215	ENST00000613500	TNNI3K	Q59H18	835 aa		11.25	□□□□□ -0.61
NLRP1-215	ENST00000613500	CFAP58	Q5T655	872 aa		11.25	□□□□□ -0.61
NLRP1-215	ENST00000613500	FAM173B	Q6P4H8	233 aa		11.25	□□□□□ -0.61
NLRP1-215	ENST00000613500	ARHGAP30	Q7Z6I6	1101 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
NLRP1-215	ENST00000613500	CCDC50	Q8IVM0	306 aa		11.25	□□□□□ -0.61
NLRP1-215	ENST00000613500	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		11.25	□□□□□ -0.61
NLRP1-215	ENST00000613500	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
NLRP1-215	ENST00000613500	ZBED4	O75132	1171 aa		11.25	□□□□□ -0.61

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