RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613122.4

CTDP1-208, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 5,866 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-208ENST00000613122 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.53■■□□□ 1.2
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CTDP1-208ENST00000613122 VPS16Q9H269 839 aa22.52■■□□□ 1.2
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CTDP1-208ENST00000613122 USP17L21D6R901 530 aa22.52■■□□□ 1.19
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CTDP1-208ENST00000613122 ZNF654Q8IZM8 581 aa22.47■■□□□ 1.19
CTDP1-208ENST00000613122 DEPTORQ8TB45 409 aa22.47■■□□□ 1.19
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CTDP1-208ENST00000613122 KIF24Q5T7B8 1368 aa22.46■■□□□ 1.19
CTDP1-208ENST00000613122 IFNL3Q8IZI9 196 aa22.46■■□□□ 1.19
CTDP1-208ENST00000613122 METTL13Q8N6R0 699 aa22.46■■□□□ 1.19
CTDP1-208ENST00000613122 HAUS7Q99871 368 aa22.46■■□□□ 1.19
CTDP1-208ENST00000613122 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
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