RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608287.1

SGMS1-208, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 4

Gene SGMS1, Length 542 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-208ENST00000608287 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
SGMS1-208ENST00000608287 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
SGMS1-208ENST00000608287 SPP2Q13103 211 aa23.49■■□□□ 1.35
SGMS1-208ENST00000608287 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
SGMS1-208ENST00000608287 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
SGMS1-208ENST00000608287 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
SGMS1-208ENST00000608287 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP23.49■■□□□ 1.35
SGMS1-208ENST00000608287 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
SGMS1-208ENST00000608287 HMMRO75330 724 aa23.48■■□□□ 1.35
SGMS1-208ENST00000608287 NPM3O75607 178 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
SGMS1-208ENST00000608287 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
SGMS1-208ENST00000608287 TRIM32Q13049 653 aa23.48■■□□□ 1.35
SGMS1-208ENST00000608287 PICALMQ13492 652 aa23.48■■□□□ 1.35
SGMS1-208ENST00000608287 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa23.48■■□□□ 1.35
SGMS1-208ENST00000608287 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
SGMS1-208ENST00000608287 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
SGMS1-208ENST00000608287 ABCF2Q9UG63 623 aa23.48■■□□□ 1.35
SGMS1-208ENST00000608287 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
SGMS1-208ENST00000608287 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
SGMS1-208ENST00000608287 MAPK4P31152 587 aa23.47■■□□□ 1.35
SGMS1-208ENST00000608287 HMGCS2P54868 508 aa23.47■■□□□ 1.35
SGMS1-208ENST00000608287 ERC1Q8IUD2 1116 aa23.47■■□□□ 1.35
SGMS1-208ENST00000608287 DBNDD2Q9BQY9 259 aa23.47■■□□□ 1.35
SGMS1-208ENST00000608287 HMG20BQ9P0W2 317 aa23.47■■□□□ 1.35
SGMS1-208ENST00000608287 PLXNB2O15031 1838 aa23.46■■□□□ 1.35
SGMS1-208ENST00000608287 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa23.46■■□□□ 1.35
SGMS1-208ENST00000608287 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa23.46■■□□□ 1.35
SGMS1-208ENST00000608287 SH3D19Q5HYK7 790 aa23.46■■□□□ 1.35
SGMS1-208ENST00000608287 CCDC158Q5M9N0 1113 aa23.46■■□□□ 1.35
SGMS1-208ENST00000608287 TTC39AQ5SRH9 613 aa23.46■■□□□ 1.35
SGMS1-208ENST00000608287 SIRT2Q8IXJ6 389 aa23.46■■□□□ 1.35
SGMS1-208ENST00000608287 SPATA5Q8NB90 893 aa23.46■■□□□ 1.35
SGMS1-208ENST00000608287 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa23.46■■□□□ 1.35
SGMS1-208ENST00000608287 ATAD5Q96QE3 1844 aa23.46■■□□□ 1.35
SGMS1-208ENST00000608287 USP17L5A8MUK1 530 aa23.45■■□□□ 1.34
SGMS1-208ENST00000608287 RGS2P41220 211 aa23.45■■□□□ 1.34
SGMS1-208ENST00000608287 BTDP43251 543 aa23.45■■□□□ 1.34
SGMS1-208ENST00000608287 LRRC26Q2I0M4 334 aa23.45■■□□□ 1.34
SGMS1-208ENST00000608287 PI16Q6UXB8 463 aa23.45■■□□□ 1.34
SGMS1-208ENST00000608287 TMOD4Q9NZQ9 345 aa23.45■■□□□ 1.34
SGMS1-208ENST00000608287 RRP1P56182 461 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
SGMS1-208ENST00000608287 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
SGMS1-208ENST00000608287 FAM161BQ96MY7 647 aa23.44■■□□□ 1.34
SGMS1-208ENST00000608287 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
SGMS1-208ENST00000608287 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa23.43■■□□□ 1.34
SGMS1-208ENST00000608287 APBB1O00213 710 aa23.43■■□□□ 1.34
SGMS1-208ENST00000608287 MSCO60682 206 aa23.43■■□□□ 1.34
SGMS1-208ENST00000608287 MCAMP43121 646 aa23.43■■□□□ 1.34
SGMS1-208ENST00000608287 ERICH6Q7L0X2 663 aa23.43■■□□□ 1.34
SGMS1-208ENST00000608287 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
SGMS1-208ENST00000608287 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
SGMS1-208ENST00000608287 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
SGMS1-208ENST00000608287 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
SGMS1-208ENST00000608287 MAST2Q6P0Q8 1798 aa23.42■■□□□ 1.34
SGMS1-208ENST00000608287 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
SGMS1-208ENST00000608287 CAP2P40123 477 aa23.42■■□□□ 1.34
SGMS1-208ENST00000608287 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
SGMS1-208ENST00000608287 APBA2Q99767 749 aa23.42■■□□□ 1.34
SGMS1-208ENST00000608287 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
SGMS1-208ENST00000608287 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
SGMS1-208ENST00000608287 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
SGMS1-208ENST00000608287 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
SGMS1-208ENST00000608287 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
SGMS1-208ENST00000608287 LHX8Q68G74 356 aa23.41■■□□□ 1.34
SGMS1-208ENST00000608287 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa23.41■■□□□ 1.34
SGMS1-208ENST00000608287 RHPN1Q8TCX5 695 aa23.41■■□□□ 1.34
SGMS1-208ENST00000608287 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
SGMS1-208ENST00000608287 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa23.41■■□□□ 1.34
SGMS1-208ENST00000608287 SNRKQ9NRH2 765 aa23.41■■□□□ 1.34
SGMS1-208ENST00000608287 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa23.4■■□□□ 1.34
SGMS1-208ENST00000608287 C19orf81C9J6K1 198 aa23.4■■□□□ 1.34
SGMS1-208ENST00000608287 LDHCP07864 332 aa23.4■■□□□ 1.34
SGMS1-208ENST00000608287 GSTO1P78417 241 aa23.4■■□□□ 1.34
SGMS1-208ENST00000608287 AACSQ86V21 672 aa23.4■■□□□ 1.34
SGMS1-208ENST00000608287 KIF1BPQ96EK5 621 aa23.4■■□□□ 1.34
SGMS1-208ENST00000608287 WDR18Q9BV38 432 aa23.4■■□□□ 1.34
SGMS1-208ENST00000608287 FRMPD3Q5JV73 1810 aa23.39■■□□□ 1.33
SGMS1-208ENST00000608287 ASNSP08243 561 aa23.39■■□□□ 1.33
SGMS1-208ENST00000608287 HERVK_113P62684 666 aa23.39■■□□□ 1.33
SGMS1-208ENST00000608287 MECOMQ03112 1051 aa23.39■■□□□ 1.33
SGMS1-208ENST00000608287 BCL11AQ9H165 835 aa23.39■■□□□ 1.33
SGMS1-208ENST00000608287 GINM1Q9NU53 330 aa23.39■■□□□ 1.33
SGMS1-208ENST00000608287 RAI14Q9P0K7 980 aa23.39■■□□□ 1.33
SGMS1-208ENST00000608287 RAB11FIP3O75154 756 aa23.38■■□□□ 1.33
SGMS1-208ENST00000608287 BACE1P56817 501 aa23.38■■□□□ 1.33
SGMS1-208ENST00000608287 MFSD14CQ5VZR4 134 aa23.38■■□□□ 1.33
SGMS1-208ENST00000608287 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
SGMS1-208ENST00000608287 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
SGMS1-208ENST00000608287 LRP2BPQ9P2M1 347 aa23.38■■□□□ 1.33
SGMS1-208ENST00000608287 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
SGMS1-208ENST00000608287 CCNA1P78396 465 aa23.37■■□□□ 1.33
SGMS1-208ENST00000608287 MTMR2Q13614 643 aa23.37■■□□□ 1.33
SGMS1-208ENST00000608287 GPR142Q7Z601 462 aa23.37■■□□□ 1.33
SGMS1-208ENST00000608287 PLEKHH3Q7Z736 793 aa23.37■■□□□ 1.33
SGMS1-208ENST00000608287 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
SGMS1-208ENST00000608287 USP6NLQ92738 828 aa23.37■■□□□ 1.33
SGMS1-208ENST00000608287 TMEM265A0A087WTH1 108 aa23.36■■□□□ 1.33
SGMS1-208ENST00000608287 DNM1LO00429 736 aa23.36■■□□□ 1.33
SGMS1-208ENST00000608287 ERVK-9P63128 1117 aa23.36■■□□□ 1.33
SGMS1-208ENST00000608287 ERVK-24P63145 666 aa23.36■■□□□ 1.33
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