RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597576.1

ZNF548-208, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

TSL 2

Gene ZNF548, Length 659 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-208ENST00000597576 TNNI2P48788 182 aa9.52□□□□□ -0.89
ZNF548-208ENST00000597576 CACNB3P54284 484 aa9.52□□□□□ -0.89
ZNF548-208ENST00000597576 ATP2B3Q16720 1220 aa9.52□□□□□ -0.89
ZNF548-208ENST00000597576 GORABQ5T7V8 394 aa9.52□□□□□ -0.89
ZNF548-208ENST00000597576 FAM83AQ86UY5 434 aa9.52□□□□□ -0.89
ZNF548-208ENST00000597576 COA7Q96BR5 231 aa9.52□□□□□ -0.89
ZNF548-208ENST00000597576 GPATCH3Q96I76 525 aa9.52□□□□□ -0.89
ZNF548-208ENST00000597576 LRRCC1Q9C099 1032 aa9.52□□□□□ -0.89
ZNF548-208ENST00000597576 ATAD5Q96QE3 1844 aa9.52□□□□□ -0.89
ZNF548-208ENST00000597576 ZFHX4Q86UP3 3567 aa9.52□□□□□ -0.89
ZNF548-208ENST00000597576 CACNA1GO43497 2377 aa9.51□□□□□ -0.89
ZNF548-208ENST00000597576 CXCL11O14625 94 aa9.51□□□□□ -0.89
ZNF548-208ENST00000597576 GPR37L1O60883 481 aa9.51□□□□□ -0.89
ZNF548-208ENST00000597576 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
ZNF548-208ENST00000597576 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
ZNF548-208ENST00000597576 GRIK5Q16478 980 aa9.51□□□□□ -0.89
ZNF548-208ENST00000597576 FAM110CQ1W6H9 321 aa9.51□□□□□ -0.89
ZNF548-208ENST00000597576 LRRC24Q50LG9 513 aa9.51□□□□□ -0.89
ZNF548-208ENST00000597576 TMEM31Q5JXX7 168 aa9.51□□□□□ -0.89
ZNF548-208ENST00000597576 FKBP1CQ5VVH2 108 aa9.51□□□□□ -0.89
ZNF548-208ENST00000597576 KLHDC4Q8TBB5 520 aa9.51□□□□□ -0.89
ZNF548-208ENST00000597576 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
ZNF548-208ENST00000597576 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
ZNF548-208ENST00000597576 VPS13AQ96RL7 3174 aa9.51□□□□□ -0.89
ZNF548-208ENST00000597576 MYH13Q9UKX3 1938 aa9.5□□□□□ -0.89
ZNF548-208ENST00000597576 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
ZNF548-208ENST00000597576 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
ZNF548-208ENST00000597576 CRKP46108 304 aa9.5□□□□□ -0.89
ZNF548-208ENST00000597576 CCDC158Q5M9N0 1113 aa9.5□□□□□ -0.89
ZNF548-208ENST00000597576 MFSD14BQ5SR56 506 aa9.5□□□□□ -0.89
ZNF548-208ENST00000597576 MIGA2Q7L4E1 593 aa9.5□□□□□ -0.89
ZNF548-208ENST00000597576 ATG9AQ7Z3C6 839 aa9.5□□□□□ -0.89
ZNF548-208ENST00000597576 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa9.5□□□□□ -0.89
ZNF548-208ENST00000597576 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP9.5□□□□□ -0.89
ZNF548-208ENST00000597576 ZNF341Q9BYN7 854 aa9.5□□□□□ -0.89
ZNF548-208ENST00000597576 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
ZNF548-208ENST00000597576 ZNF576Q9H609 170 aa9.5□□□□□ -0.89
ZNF548-208ENST00000597576 DCTPP1Q9H773 170 aa9.5□□□□□ -0.89
ZNF548-208ENST00000597576 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa9.5□□□□□ -0.89
ZNF548-208ENST00000597576 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa9.5□□□□□ -0.89
ZNF548-208ENST00000597576 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
ZNF548-208ENST00000597576 ATRNL1Q5VV63 1379 aa9.5□□□□□ -0.89
ZNF548-208ENST00000597576 CACNA1HO95180 2353 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF548-208ENST00000597576 SEMA3EO15041 775 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF548-208ENST00000597576 TAF5LO75529 589 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF548-208ENST00000597576 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF548-208ENST00000597576 DNAJB2P25686 324 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF548-208ENST00000597576 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
ZNF548-208ENST00000597576 TFCP2Q12800 502 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF548-208ENST00000597576 ADGRE1Q14246 886 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF548-208ENST00000597576 DCAF15Q66K64 600 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF548-208ENST00000597576 VGLL2Q8N8G2 317 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF548-208ENST00000597576 RHPN1Q8TCX5 695 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF548-208ENST00000597576 BADQ92934 168 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF548-208ENST00000597576 CCDC136Q96JN2 1154 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF548-208ENST00000597576 NEUROD6Q96NK8 337 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF548-208ENST00000597576 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
ZNF548-208ENST00000597576 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
ZNF548-208ENST00000597576 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF548-208ENST00000597576 DNAH14Q0VDD8 3507 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF548-208ENST00000597576 BAHCC1Q9P281 2608 aa9.49□□□□□ -0.89
ZNF548-208ENST00000597576 A0A1B0GUL7 405 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF548-208ENST00000597576 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
ZNF548-208ENST00000597576 EPHB4P54760 987 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF548-208ENST00000597576 RTP1P59025 263 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF548-208ENST00000597576 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
ZNF548-208ENST00000597576 TNNI3KQ59H18 835 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF548-208ENST00000597576 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF548-208ENST00000597576 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
ZNF548-208ENST00000597576 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
ZNF548-208ENST00000597576 SIRT2Q8IXJ6 389 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF548-208ENST00000597576 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
ZNF548-208ENST00000597576 PPM1EQ8WY54 764 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF548-208ENST00000597576 HOOK2Q96ED9 719 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF548-208ENST00000597576 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF548-208ENST00000597576 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa9.48□□□□□ -0.89
ZNF548-208ENST00000597576 APBB1O00213 710 aa9.47□□□□□ -0.89
ZNF548-208ENST00000597576 ERC2O15083 957 aa9.47□□□□□ -0.89
ZNF548-208ENST00000597576 ZBTB22O15209 634 aa9.47□□□□□ -0.89
ZNF548-208ENST00000597576 IGSF3O75054 1194 aa9.47□□□□□ -0.89
ZNF548-208ENST00000597576 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
ZNF548-208ENST00000597576 FGFR2P21802 821 aa9.47□□□□□ -0.89
ZNF548-208ENST00000597576 ITGB8P26012 769 aa9.47□□□□□ -0.89
ZNF548-208ENST00000597576 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
ZNF548-208ENST00000597576 NHLH1Q02575 133 aa9.47□□□□□ -0.89
ZNF548-208ENST00000597576 TFF2Q03403 129 aa9.47□□□□□ -0.89
ZNF548-208ENST00000597576 SNX17Q15036 470 aa9.47□□□□□ -0.89
ZNF548-208ENST00000597576 TTC39AQ5SRH9 613 aa9.47□□□□□ -0.89
ZNF548-208ENST00000597576 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
ZNF548-208ENST00000597576 AACSQ86V21 672 aa9.47□□□□□ -0.89
ZNF548-208ENST00000597576 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
ZNF548-208ENST00000597576 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
ZNF548-208ENST00000597576 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa9.47□□□□□ -0.89
ZNF548-208ENST00000597576 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
ZNF548-208ENST00000597576 PPP4R2Q9NY27 417 aa9.47□□□□□ -0.89
ZNF548-208ENST00000597576 DENND2AQ9ULE3 1009 aa9.47□□□□□ -0.89
ZNF548-208ENST00000597576 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
ZNF548-208ENST00000597576 CHD6Q8TD26 2715 aa9.47□□□□□ -0.89
ZNF548-208ENST00000597576 TRIM43BA6NCK2 446 aa9.46□□□□□ -0.9
ZNF548-208ENST00000597576 FAM86C2PA6NEL3 165 aa9.46□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms