RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 ZAP70P43403 619 aa29.8■■■□□ 2.36
CAPNS1-204ENST00000587718 CHAMP1Q96JM3 812 aa29.8■■■□□ 2.36
CAPNS1-204ENST00000587718 SREBF2Q12772 1141 aa29.79■■■□□ 2.36
CAPNS1-204ENST00000587718 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP29.79■■■□□ 2.36
CAPNS1-204ENST00000587718 CDAN1Q8IWY9 1227 aa29.79■■■□□ 2.36
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM184AQ8NB25 1140 aa29.79■■■□□ 2.36
CAPNS1-204ENST00000587718 TEKT1Q969V4 418 aa29.79■■■□□ 2.36
CAPNS1-204ENST00000587718 ZDHHC15Q96MV8 337 aa29.79■■■□□ 2.36
CAPNS1-204ENST00000587718 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP29.78■■■□□ 2.36
CAPNS1-204ENST00000587718 HS1BP3Q53T59 392 aa29.78■■■□□ 2.36
CAPNS1-204ENST00000587718 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP29.78■■■□□ 2.36
CAPNS1-204ENST00000587718 CCDC85CA6NKD9 419 aa29.77■■■□□ 2.36
CAPNS1-204ENST00000587718 TCP10L2B9ZVM9 353 aa29.77■■■□□ 2.36
CAPNS1-204ENST00000587718 TBC1D8O95759 1140 aa29.77■■■□□ 2.36
CAPNS1-204ENST00000587718 CHGBP05060 677 aa29.77■■■□□ 2.36
CAPNS1-204ENST00000587718 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP29.77■■■□□ 2.36
CAPNS1-204ENST00000587718 CFHR5Q9BXR6 569 aa29.77■■■□□ 2.36
CAPNS1-204ENST00000587718 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP29.77■■■□□ 2.36
CAPNS1-204ENST00000587718 TCHHQ07283 1943 aa29.77■■■□□ 2.36
CAPNS1-204ENST00000587718 SYCE3A1L190 88 aa29.77■■■□□ 2.36
CAPNS1-204ENST00000587718 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP29.77■■■□□ 2.36
CAPNS1-204ENST00000587718 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP29.77■■■□□ 2.36
CAPNS1-204ENST00000587718 ADD2P35612 726 aa29.77■■■□□ 2.36
CAPNS1-204ENST00000587718 IREB2P48200 963 aaKnown RBP29.77■■■□□ 2.36
CAPNS1-204ENST00000587718 FGD1P98174 961 aa29.77■■■□□ 2.36
CAPNS1-204ENST00000587718 WDR66Q8TBY9 1149 aa29.77■■■□□ 2.36
CAPNS1-204ENST00000587718 WNK4Q96J92 1243 aa29.77■■■□□ 2.36
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM39BQ9GZU3 492 aa29.77■■■□□ 2.36
CAPNS1-204ENST00000587718 RBSNQ9H1K0 784 aa29.77■■■□□ 2.36
CAPNS1-204ENST00000587718 TSPY26PQ9H489 355 aa29.77■■■□□ 2.36
CAPNS1-204ENST00000587718 MCAMP43121 646 aa29.76■■■□□ 2.35
CAPNS1-204ENST00000587718 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP29.76■■■□□ 2.35
CAPNS1-204ENST00000587718 HHIPL2Q6UWX4 724 aa29.76■■■□□ 2.35
CAPNS1-204ENST00000587718 BRF1Q92994 677 aa29.76■■■□□ 2.35
CAPNS1-204ENST00000587718 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP29.76■■■□□ 2.35
CAPNS1-204ENST00000587718 TCEANC2Q96MN5 208 aa29.76■■■□□ 2.35
CAPNS1-204ENST00000587718 ZMYM6O95789 1325 aa29.76■■■□□ 2.35
CAPNS1-204ENST00000587718 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP29.75■■■□□ 2.35
CAPNS1-204ENST00000587718 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP29.75■■■□□ 2.35
CAPNS1-204ENST00000587718 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa29.75■■■□□ 2.35
CAPNS1-204ENST00000587718 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP29.74■■■□□ 2.35
CAPNS1-204ENST00000587718 ZBTB22O15209 634 aa29.74■■■□□ 2.35
CAPNS1-204ENST00000587718 TNNI2P48788 182 aa29.74■■■□□ 2.35
CAPNS1-204ENST00000587718 INHBEP58166 350 aa29.74■■■□□ 2.35
CAPNS1-204ENST00000587718 UVSSAQ2YD98 709 aa29.74■■■□□ 2.35
CAPNS1-204ENST00000587718 GJA5P36382 358 aa29.73■■■□□ 2.35
CAPNS1-204ENST00000587718 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP29.73■■■□□ 2.35
CAPNS1-204ENST00000587718 ATL3Q6DD88 541 aa29.73■■■□□ 2.35
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP29.73■■■□□ 2.35
CAPNS1-204ENST00000587718 PDLIM2Q96JY6 352 aa29.73■■■□□ 2.35
CAPNS1-204ENST00000587718 CACNB3P54284 484 aa29.73■■■□□ 2.35
CAPNS1-204ENST00000587718 FKBP1CQ5VVH2 108 aa29.73■■■□□ 2.35
CAPNS1-204ENST00000587718 CCDC102BQ68D86 513 aa29.73■■■□□ 2.35
CAPNS1-204ENST00000587718 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa29.73■■■□□ 2.35
CAPNS1-204ENST00000587718 GDPD2Q9HCC8 539 aa29.73■■■□□ 2.35
CAPNS1-204ENST00000587718 GPR25O00155 361 aa29.72■■■□□ 2.35
CAPNS1-204ENST00000587718 RGS19P49795 217 aa29.72■■■□□ 2.35
CAPNS1-204ENST00000587718 ALX1Q15699 326 aa29.72■■■□□ 2.35
CAPNS1-204ENST00000587718 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP29.72■■■□□ 2.35
CAPNS1-204ENST00000587718 GPAA1O43292 621 aa29.71■■■□□ 2.35
CAPNS1-204ENST00000587718 PHKA1P46020 1223 aa29.71■■■□□ 2.35
CAPNS1-204ENST00000587718 SCRN1Q12765 414 aa29.71■■■□□ 2.35
CAPNS1-204ENST00000587718 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP29.71■■■□□ 2.35
CAPNS1-204ENST00000587718 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP29.71■■■□□ 2.35
CAPNS1-204ENST00000587718 FOXP2O15409 715 aa29.7■■■□□ 2.35
CAPNS1-204ENST00000587718 FIBPO43427 364 aa29.7■■■□□ 2.35
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM83AQ86UY5 434 aa29.7■■■□□ 2.35
CAPNS1-204ENST00000587718 IFNL1Q8IU54 200 aa29.7■■■□□ 2.35
CAPNS1-204ENST00000587718 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP29.7■■■□□ 2.35
CAPNS1-204ENST00000587718 DOCK2Q92608 1830 aa29.7■■■□□ 2.34
CAPNS1-204ENST00000587718 SALL1Q9NSC2 1324 aa29.69■■■□□ 2.34
CAPNS1-204ENST00000587718 ALDH1A1P00352 501 aa29.69■■■□□ 2.34
CAPNS1-204ENST00000587718 FGAP02671 866 aa29.69■■■□□ 2.34
CAPNS1-204ENST00000587718 MCM5P33992 734 aa29.69■■■□□ 2.34
CAPNS1-204ENST00000587718 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP29.69■■■□□ 2.34
CAPNS1-204ENST00000587718 SEMA3EO15041 775 aa29.69■■■□□ 2.34
CAPNS1-204ENST00000587718 PRDX5P30044 214 aa29.69■■■□□ 2.34
CAPNS1-204ENST00000587718 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP29.69■■■□□ 2.348e-20■■□□□ 14.3
CAPNS1-204ENST00000587718 NCOA7Q8NI08 942 aa29.69■■■□□ 2.34
CAPNS1-204ENST00000587718 LAMB1P07942 1786 aa29.68■■■□□ 2.34
CAPNS1-204ENST00000587718 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP29.68■■■□□ 2.345e-7■■■■□ 22.6
CAPNS1-204ENST00000587718 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP29.68■■■□□ 2.34
CAPNS1-204ENST00000587718 STK3Q13188 491 aa29.68■■■□□ 2.34
CAPNS1-204ENST00000587718 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP29.68■■■□□ 2.34
CAPNS1-204ENST00000587718 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP29.68■■■□□ 2.34
CAPNS1-204ENST00000587718 DENND2AQ9ULE3 1009 aa29.68■■■□□ 2.34
CAPNS1-204ENST00000587718 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa29.68■■■□□ 2.34
CAPNS1-204ENST00000587718 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP29.67■■■□□ 2.34
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF213O14771 459 aa29.67■■■□□ 2.34
CAPNS1-204ENST00000587718 MAP3K9P80192 1104 aa29.67■■■□□ 2.34
CAPNS1-204ENST00000587718 RESTQ13127 1097 aa29.67■■■□□ 2.34
CAPNS1-204ENST00000587718 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP29.67■■■□□ 2.34
CAPNS1-204ENST00000587718 SLFNL1Q499Z3 407 aa29.67■■■□□ 2.34
CAPNS1-204ENST00000587718 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP29.67■■■□□ 2.34
CAPNS1-204ENST00000587718 TMOD2Q9NZR1 351 aa29.67■■■□□ 2.34
CAPNS1-204ENST00000587718 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP29.66■■■□□ 2.34
CAPNS1-204ENST00000587718 CLCN1P35523 988 aa29.66■■■□□ 2.34
CAPNS1-204ENST00000587718 DIXDC1Q155Q3 683 aa29.66■■■□□ 2.34
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa29.66■■■□□ 2.34
CAPNS1-204ENST00000587718 ELP3Q9H9T3 547 aa29.66■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.9 ms