RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587267.1

AC087289.2-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene AC087289.2, Length 1,419 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC087289.2-201ENST00000587267 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
AC087289.2-201ENST00000587267 CRBNQ96SW2 442 aa20.23■□□□□ 0.83
AC087289.2-201ENST00000587267 WDR18Q9BV38 432 aa20.23■□□□□ 0.83
AC087289.2-201ENST00000587267 PNMA3Q9UL41 463 aa20.23■□□□□ 0.83
AC087289.2-201ENST00000587267 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa20.23■□□□□ 0.83
AC087289.2-201ENST00000587267 DOCK3Q8IZD9 2030 aa20.22■□□□□ 0.83
AC087289.2-201ENST00000587267 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
AC087289.2-201ENST00000587267 SH3D19Q5HYK7 790 aa20.22■□□□□ 0.83
AC087289.2-201ENST00000587267 TATDN1Q6P1N9 297 aa20.22■□□□□ 0.83
AC087289.2-201ENST00000587267 SDR42E1Q8WUS8 393 aa20.22■□□□□ 0.83
AC087289.2-201ENST00000587267 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa20.22■□□□□ 0.83
AC087289.2-201ENST00000587267 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
AC087289.2-201ENST00000587267 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
AC087289.2-201ENST00000587267 CTGFP29279 349 aa20.21■□□□□ 0.83
AC087289.2-201ENST00000587267 PSMC4P43686 418 aa20.21■□□□□ 0.83
AC087289.2-201ENST00000587267 PLCD1P51178 756 aa20.21■□□□□ 0.83
AC087289.2-201ENST00000587267 MTMR2Q13614 643 aa20.21■□□□□ 0.83
AC087289.2-201ENST00000587267 UBE3CQ15386 1083 aa20.21■□□□□ 0.83
AC087289.2-201ENST00000587267 SLFNL1Q499Z3 407 aa20.21■□□□□ 0.83
AC087289.2-201ENST00000587267 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa20.21■□□□□ 0.83
AC087289.2-201ENST00000587267 ARMC5Q96C12 935 aa20.21■□□□□ 0.83
AC087289.2-201ENST00000587267 ARMT1Q9H993 441 aa20.21■□□□□ 0.83
AC087289.2-201ENST00000587267 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
AC087289.2-201ENST00000587267 MCM9Q9NXL9 1143 aa20.21■□□□□ 0.83
AC087289.2-201ENST00000587267 MBD4O95243 580 aa20.2■□□□□ 0.82
AC087289.2-201ENST00000587267 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
AC087289.2-201ENST00000587267 PRMT2P55345 433 aa20.2■□□□□ 0.82
AC087289.2-201ENST00000587267 BACE1P56817 501 aa20.2■□□□□ 0.82
AC087289.2-201ENST00000587267 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP20.2■□□□□ 0.82
AC087289.2-201ENST00000587267 TRIM47Q96LD4 638 aa20.2■□□□□ 0.82
AC087289.2-201ENST00000587267 USP17L10C9JJH3 530 aa20.19■□□□□ 0.82
AC087289.2-201ENST00000587267 GH2P01242 217 aa20.19■□□□□ 0.82
AC087289.2-201ENST00000587267 CHGBP05060 677 aa20.19■□□□□ 0.82
AC087289.2-201ENST00000587267 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa20.19■□□□□ 0.82
AC087289.2-201ENST00000587267 C19orf81C9J6K1 198 aa20.19■□□□□ 0.82
AC087289.2-201ENST00000587267 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
AC087289.2-201ENST00000587267 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
AC087289.2-201ENST00000587267 TSHZ3Q63HK5 1081 aa20.19■□□□□ 0.82
AC087289.2-201ENST00000587267 NBPF11Q86T75 865 aa20.19■□□□□ 0.82
AC087289.2-201ENST00000587267 TMOD4Q9NZQ9 345 aa20.19■□□□□ 0.82
AC087289.2-201ENST00000587267 OSBPP22059 807 aa20.18■□□□□ 0.82
AC087289.2-201ENST00000587267 HOXD10P28358 340 aa20.18■□□□□ 0.82
AC087289.2-201ENST00000587267 SHMT1P34896 483 aa20.18■□□□□ 0.82
AC087289.2-201ENST00000587267 FCGRTP55899 365 aa20.18■□□□□ 0.82
AC087289.2-201ENST00000587267 GABPAQ06546 454 aa20.18■□□□□ 0.82
AC087289.2-201ENST00000587267 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa20.18■□□□□ 0.82
AC087289.2-201ENST00000587267 SRRDQ9UH36 339 aa20.18■□□□□ 0.82
AC087289.2-201ENST00000587267 TTC41PQ6P2S7 1318 aa20.17■□□□□ 0.82
AC087289.2-201ENST00000587267 PRKAB2O43741 272 aa20.17■□□□□ 0.82
AC087289.2-201ENST00000587267 FAM110CQ1W6H9 321 aa20.17■□□□□ 0.82
AC087289.2-201ENST00000587267 ABCB5Q2M3G0 1257 aa20.17■□□□□ 0.82
AC087289.2-201ENST00000587267 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa20.17■□□□□ 0.82
AC087289.2-201ENST00000587267 KBTBD3Q8NAB2 608 aa20.17■□□□□ 0.82
AC087289.2-201ENST00000587267 ZNF333Q96JL9 665 aa20.17■□□□□ 0.82
AC087289.2-201ENST00000587267 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
AC087289.2-201ENST00000587267 RAB3GAP1Q15042 981 aa20.16■□□□□ 0.82
AC087289.2-201ENST00000587267 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
AC087289.2-201ENST00000587267 CABP5Q9NP86 173 aa20.16■□□□□ 0.82
AC087289.2-201ENST00000587267 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
AC087289.2-201ENST00000587267 MYPNQ86TC9 1320 aa20.16■□□□□ 0.82
AC087289.2-201ENST00000587267 ERC2O15083 957 aa20.15■□□□□ 0.82
AC087289.2-201ENST00000587267 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
AC087289.2-201ENST00000587267 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
AC087289.2-201ENST00000587267 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
AC087289.2-201ENST00000587267 EVX2Q03828 476 aa20.15■□□□□ 0.82
AC087289.2-201ENST00000587267 DDRGK1Q96HY6 314 aa20.15■□□□□ 0.82
AC087289.2-201ENST00000587267 TAOK2Q9UL54 1235 aa20.15■□□□□ 0.82
AC087289.2-201ENST00000587267 CYP2D6P10635 497 aa20.14■□□□□ 0.81
AC087289.2-201ENST00000587267 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
AC087289.2-201ENST00000587267 AAMPQ13685 434 aa20.14■□□□□ 0.81
AC087289.2-201ENST00000587267 AMOTL1Q8IY63 956 aa20.14■□□□□ 0.81
AC087289.2-201ENST00000587267 RAET1EQ8TD07 263 aa20.14■□□□□ 0.81
AC087289.2-201ENST00000587267 SH3TC2Q8TF17 1288 aa20.14■□□□□ 0.81
AC087289.2-201ENST00000587267 FEZ1Q99689 392 aa20.14■□□□□ 0.81
AC087289.2-201ENST00000587267 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
AC087289.2-201ENST00000587267 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa20.14■□□□□ 0.81
AC087289.2-201ENST00000587267 POTEFA5A3E0 1075 aa20.13■□□□□ 0.81
AC087289.2-201ENST00000587267 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
AC087289.2-201ENST00000587267 MX1P20591 662 aa20.13■□□□□ 0.81
AC087289.2-201ENST00000587267 PRKCZQ05513 592 aa20.13■□□□□ 0.81
AC087289.2-201ENST00000587267 USP17L2Q6R6M4 530 aa20.13■□□□□ 0.81
AC087289.2-201ENST00000587267 PI4K2BQ8TCG2 481 aa20.13■□□□□ 0.81
AC087289.2-201ENST00000587267 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
AC087289.2-201ENST00000587267 GCC1Q96CN9 775 aa20.13■□□□□ 0.81
AC087289.2-201ENST00000587267 SWAP70Q9UH65 585 aa20.13■□□□□ 0.81
AC087289.2-201ENST00000587267 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
AC087289.2-201ENST00000587267 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
AC087289.2-201ENST00000587267 SLC44A5Q8NCS7 719 aa20.12■□□□□ 0.81
AC087289.2-201ENST00000587267 APPBP2Q92624 585 aa20.12■□□□□ 0.81
AC087289.2-201ENST00000587267 C12orf42Q96LP6 360 aa20.12■□□□□ 0.81
AC087289.2-201ENST00000587267 EMILIN3Q9NT22 766 aa20.12■□□□□ 0.81
AC087289.2-201ENST00000587267 USP17L12C9JPN9 530 aa20.11■□□□□ 0.81
AC087289.2-201ENST00000587267 USP17L21D6R901 530 aa20.11■□□□□ 0.81
AC087289.2-201ENST00000587267 GUCY1A2P33402 732 aa20.11■□□□□ 0.81
AC087289.2-201ENST00000587267 USP14P54578 494 aa20.11■□□□□ 0.81
AC087289.2-201ENST00000587267 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
AC087289.2-201ENST00000587267 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
AC087289.2-201ENST00000587267 ANKRD45Q5TZF3 282 aa20.11■□□□□ 0.81
AC087289.2-201ENST00000587267 C12orf60Q5U649 245 aa20.11■□□□□ 0.81
AC087289.2-201ENST00000587267 TMEM106CQ9BVX2 250 aa20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.3 ms