RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568443.2

CLN3-232, Transcript of CLN3, battenin, humanhuman

TSL 3

Gene CLN3, Length 969 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3-232ENST00000568443 BACE1P56817 501 aa27.24■■□□□ 1.95
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CLN3-232ENST00000568443 TMOD4Q9NZQ9 345 aa27.24■■□□□ 1.95
CLN3-232ENST00000568443 SERPINB13Q9UIV8 391 aa27.24■■□□□ 1.95
CLN3-232ENST00000568443 ZNF532Q9HCE3 1301 aa27.23■■□□□ 1.95
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CLN3-232ENST00000568443 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa27.23■■□□□ 1.95
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CLN3-232ENST00000568443 PAG1Q9NWQ8 432 aa27.23■■□□□ 1.95
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CLN3-232ENST00000568443 C19orf81C9J6K1 198 aa27.22■■□□□ 1.95
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CLN3-232ENST00000568443 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP27.22■■□□□ 1.95
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CLN3-232ENST00000568443 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP27.21■■□□□ 1.95
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CLN3-232ENST00000568443 LOC285556D6RIA3 1793 aa27.2■■□□□ 1.95
CLN3-232ENST00000568443 FAM110CQ1W6H9 321 aa27.2■■□□□ 1.94
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CLN3-232ENST00000568443 GABRQQ9UN88 632 aa27.2■■□□□ 1.94
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CLN3-232ENST00000568443 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa27.19■■□□□ 1.94
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CLN3-232ENST00000568443 USP17L13C9JLJ4 530 aa27.07■■□□□ 1.92
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CLN3-232ENST00000568443 USP17L18D6R9N7 530 aa27.07■■□□□ 1.92
CLN3-232ENST00000568443 USP17L22D6RA61 530 aa27.07■■□□□ 1.92
CLN3-232ENST00000568443 USP17L17D6RBQ6 530 aa27.07■■□□□ 1.92
CLN3-232ENST00000568443 USP17L19D6RCP7 530 aa27.07■■□□□ 1.92
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