RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567092.1

CFAP20-206, Transcript of cilia and flagella associated protein 20, human

TSL 2

Gene CFAP20, Length 710 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CFAP20-206	ENST00000567092	IRF6	O14896	467 aa		13.65	□□□□□ -0.22
CFAP20-206	ENST00000567092	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
CFAP20-206	ENST00000567092	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
CFAP20-206	ENST00000567092	ATP5J	P18859	108 aa		13.65	□□□□□ -0.22
CFAP20-206	ENST00000567092	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
CFAP20-206	ENST00000567092	RHBDL3	P58872	404 aa		13.65	□□□□□ -0.22
CFAP20-206	ENST00000567092	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
CFAP20-206	ENST00000567092	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
CFAP20-206	ENST00000567092	CASC1	Q6TDU7	716 aa		13.65	□□□□□ -0.22
CFAP20-206	ENST00000567092	IDI2	Q9BXS1	227 aa		13.65	□□□□□ -0.22
CFAP20-206	ENST00000567092	UPF2	Q9HAU5	1272 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
CFAP20-206	ENST00000567092	KIAA0100	Q14667	2235 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
CFAP20-206	ENST00000567092	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CFAP20-206	ENST00000567092	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CFAP20-206	ENST00000567092	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
CFAP20-206	ENST00000567092	TBC1D12	O60347	775 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CFAP20-206	ENST00000567092	MCAM	P43121	646 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CFAP20-206	ENST00000567092	TCP10	Q12799	353 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CFAP20-206	ENST00000567092	CCL15	Q16663	113 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CFAP20-206	ENST00000567092	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
CFAP20-206	ENST00000567092	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CFAP20-206	ENST00000567092	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CFAP20-206	ENST00000567092	CD99L2	Q8TCZ2	262 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CFAP20-206	ENST00000567092	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	13.64	□□□□□ -0.23
CFAP20-206	ENST00000567092	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CFAP20-206	ENST00000567092	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
CFAP20-206	ENST00000567092	BTBD19	C9JJ37	291 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CFAP20-206	ENST00000567092	MAP3K10	Q02779	954 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CFAP20-206	ENST00000567092	PPIL2	Q13356	520 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CFAP20-206	ENST00000567092	ERO1B	Q86YB8	467 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CFAP20-206	ENST00000567092	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
CFAP20-206	ENST00000567092	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CFAP20-206	ENST00000567092	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CFAP20-206	ENST00000567092	MROH7-TTC4	A0A0A0MT08	1334 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CFAP20-206	ENST00000567092	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
CFAP20-206	ENST00000567092	CTGF	P29279	349 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CFAP20-206	ENST00000567092	GTF2A2	P52657	109 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CFAP20-206	ENST00000567092	MECOM	Q03112	1051 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CFAP20-206	ENST00000567092	NSUN4	Q96CB9	384 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
CFAP20-206	ENST00000567092	EVI5L	Q96CN4	794 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CFAP20-206	ENST00000567092	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
CFAP20-206	ENST00000567092	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CFAP20-206	ENST00000567092	USP40	Q9NVE5	1235 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CFAP20-206	ENST00000567092	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
CFAP20-206	ENST00000567092	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
CFAP20-206	ENST00000567092	CSAD	Q9Y600	493 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CFAP20-206	ENST00000567092	GPR75-ASB3	A0A0A6YYF3	556 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CFAP20-206	ENST00000567092	BTD	P43251	543 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CFAP20-206	ENST00000567092	DCAF15	Q66K64	600 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CFAP20-206	ENST00000567092	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CFAP20-206	ENST00000567092	PTPN22	Q9Y2R2	807 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CFAP20-206	ENST00000567092	TRIM17	Q9Y577	477 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CFAP20-206	ENST00000567092	TRIM6-TRIM34	B2RNG4	842 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CFAP20-206	ENST00000567092	HIP1	O00291	1037 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CFAP20-206	ENST00000567092	ENTPD3	O75355	529 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CFAP20-206	ENST00000567092	PPAT	Q06203	517 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CFAP20-206	ENST00000567092	POTEE	Q6S8J3	1075 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CFAP20-206	ENST00000567092	SPATA5	Q8NB90	893 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CFAP20-206	ENST00000567092	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CFAP20-206	ENST00000567092	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
CFAP20-206	ENST00000567092	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
CFAP20-206	ENST00000567092	FRMD4A	Q9P2Q2	1039 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
CFAP20-206	ENST00000567092	CHML	P26374	656 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CFAP20-206	ENST00000567092	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
CFAP20-206	ENST00000567092	SP3	Q02447	781 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CFAP20-206	ENST00000567092	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
CFAP20-206	ENST00000567092	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CFAP20-206	ENST00000567092	GPAT2	Q6NUI2	795 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CFAP20-206	ENST00000567092	ADGRA1	Q86SQ6	560 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CFAP20-206	ENST00000567092	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
CFAP20-206	ENST00000567092	ARMC5	Q96C12	935 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CFAP20-206	ENST00000567092	ERO1A	Q96HE7	468 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CFAP20-206	ENST00000567092	TBC1D32	Q96NH3	1257 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CFAP20-206	ENST00000567092	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CFAP20-206	ENST00000567092	HAUS7	Q99871	368 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CFAP20-206	ENST00000567092	CRISPLD2	Q9H0B8	497 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CFAP20-206	ENST00000567092	ABCF2	Q9UG63	623 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CFAP20-206	ENST00000567092	DOCK3	Q8IZD9	2030 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CFAP20-206	ENST00000567092	TLR2	O60603	784 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CFAP20-206	ENST00000567092	REC8	O95072	547 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CFAP20-206	ENST00000567092	CETP	P11597	493 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CFAP20-206	ENST00000567092	ANP32A	P39687	249 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
CFAP20-206	ENST00000567092	SNAPC2	Q13487	334 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CFAP20-206	ENST00000567092	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
CFAP20-206	ENST00000567092	CCDC158	Q5M9N0	1113 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CFAP20-206	ENST00000567092	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CFAP20-206	ENST00000567092	DZIP1	Q86YF9	867 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
CFAP20-206	ENST00000567092	RILPL2	Q969X0	211 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CFAP20-206	ENST00000567092	HOOK2	Q96ED9	719 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CFAP20-206	ENST00000567092	BCL11A	Q9H165	835 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CFAP20-206	ENST00000567092	MYH1	P12882	1939 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CFAP20-206	ENST00000567092	ARHGAP33	O14559	1287 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CFAP20-206	ENST00000567092	C17orf99	Q6UX52	265 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CFAP20-206	ENST00000567092	ERICH6	Q7L0X2	663 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CFAP20-206	ENST00000567092	SCYL3	Q8IZE3	742 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CFAP20-206	ENST00000567092	IL27	Q8NEV9	243 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CFAP20-206	ENST00000567092	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CFAP20-206	ENST00000567092	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CFAP20-206	ENST00000567092	PLXNB2	O15031	1838 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CFAP20-206	ENST00000567092		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24

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