RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566353.5

STX4-216, Transcript of syntaxin 4, humanhuman

TSL 2

Gene STX4, Length 696 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4-216ENST00000566353 GDF11O95390 407 aa25.74■■□□□ 1.71
STX4-216ENST00000566353 TFRCP02786 760 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
STX4-216ENST00000566353 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
STX4-216ENST00000566353 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
STX4-216ENST00000566353 MORF4L1Q9UBU8 362 aa25.74■■□□□ 1.71
STX4-216ENST00000566353 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
STX4-216ENST00000566353 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa25.73■■□□□ 1.71
STX4-216ENST00000566353 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
STX4-216ENST00000566353 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
STX4-216ENST00000566353 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
STX4-216ENST00000566353 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP25.73■■□□□ 1.71
STX4-216ENST00000566353 GINM1Q9NU53 330 aa25.73■■□□□ 1.71
STX4-216ENST00000566353 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa25.73■■□□□ 1.71
STX4-216ENST00000566353 NR2E3Q9Y5X4 410 aa25.73■■□□□ 1.71
STX4-216ENST00000566353 HMGCRP04035 888 aa25.72■■□□□ 1.71
STX4-216ENST00000566353 HLA-DOAP06340 250 aa25.72■■□□□ 1.71
STX4-216ENST00000566353 CYP7A1P22680 504 aa25.72■■□□□ 1.71
STX4-216ENST00000566353 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa25.72■■□□□ 1.71
STX4-216ENST00000566353 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
STX4-216ENST00000566353 C19orf81C9J6K1 198 aa25.71■■□□□ 1.71
STX4-216ENST00000566353 IDH1O75874 414 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
STX4-216ENST00000566353 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
STX4-216ENST00000566353 GJD2Q9UKL4 321 aa25.71■■□□□ 1.71
STX4-216ENST00000566353 ALPK3Q96L96 1907 aa25.71■■□□□ 1.71
STX4-216ENST00000566353 USP17L10C9JJH3 530 aa25.7■■□□□ 1.7
STX4-216ENST00000566353 CEP85Q6P2H3 762 aa25.7■■□□□ 1.7
STX4-216ENST00000566353 HERVK_113P62684 666 aa25.69■■□□□ 1.7
STX4-216ENST00000566353 MIGA1Q8NAN2 632 aa25.69■■□□□ 1.7
STX4-216ENST00000566353 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
STX4-216ENST00000566353 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa25.69■■□□□ 1.7
STX4-216ENST00000566353 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
STX4-216ENST00000566353 CERS3Q8IU89 383 aa25.68■■□□□ 1.7
STX4-216ENST00000566353 MAGEB6Q8N7X4 407 aa25.68■■□□□ 1.7
STX4-216ENST00000566353 PRO3102Q9H379 93 aa25.68■■□□□ 1.7
STX4-216ENST00000566353 TXNRD2Q9NNW7 524 aa25.68■■□□□ 1.7
STX4-216ENST00000566353 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
STX4-216ENST00000566353 EVI5O60447 810 aa25.67■■□□□ 1.7
STX4-216ENST00000566353 PEX10O60683 326 aa25.67■■□□□ 1.7
STX4-216ENST00000566353 USP5P45974 858 aa25.67■■□□□ 1.7
STX4-216ENST00000566353 TRIM32Q13049 653 aa25.67■■□□□ 1.7
STX4-216ENST00000566353 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa25.67■■□□□ 1.7
STX4-216ENST00000566353 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
STX4-216ENST00000566353 TRIB2Q92519 343 aa25.67■■□□□ 1.7
STX4-216ENST00000566353 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
STX4-216ENST00000566353 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa25.67■■□□□ 1.7
STX4-216ENST00000566353 RPTORQ8N122 1335 aa25.66■■□□□ 1.7
STX4-216ENST00000566353 ERC1Q8IUD2 1116 aa25.66■■□□□ 1.7
STX4-216ENST00000566353 ANTXR1Q9H6X2 564 aa25.66■■□□□ 1.7
STX4-216ENST00000566353 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP25.66■■□□□ 1.7
STX4-216ENST00000566353 NAV1Q8NEY1 1877 aa25.66■■□□□ 1.7
STX4-216ENST00000566353 GH2P01242 217 aa25.65■■□□□ 1.7
STX4-216ENST00000566353 USP17L2Q6R6M4 530 aa25.65■■□□□ 1.7
STX4-216ENST00000566353 NECAB2Q7Z6G3 386 aa25.65■■□□□ 1.7
STX4-216ENST00000566353 AACSQ86V21 672 aa25.65■■□□□ 1.7
STX4-216ENST00000566353 ANKLE1Q8NAG6 615 aa25.65■■□□□ 1.7
STX4-216ENST00000566353 SOCS4Q8WXH5 440 aa25.65■■□□□ 1.7
STX4-216ENST00000566353 EMILIN3Q9NT22 766 aa25.65■■□□□ 1.7
STX4-216ENST00000566353 RBPJLQ9UBG7 517 aa25.65■■□□□ 1.7
STX4-216ENST00000566353 CYP2B6P20813 491 aa25.64■■□□□ 1.7
STX4-216ENST00000566353 MAP3K12Q12852 859 aa25.64■■□□□ 1.7
STX4-216ENST00000566353 TATDN1Q6P1N9 297 aa25.64■■□□□ 1.7
STX4-216ENST00000566353 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP25.64■■□□□ 1.7
STX4-216ENST00000566353 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP25.64■■□□□ 1.7
STX4-216ENST00000566353 NUDT12Q9BQG2 462 aa25.64■■□□□ 1.7
STX4-216ENST00000566353 EHD4Q9H223 541 aa25.64■■□□□ 1.7
STX4-216ENST00000566353 SERPINB13Q9UIV8 391 aa25.64■■□□□ 1.7
STX4-216ENST00000566353 MAPK4P31152 587 aa25.63■■□□□ 1.69
STX4-216ENST00000566353 ERVK-9P63128 1117 aa25.63■■□□□ 1.69
STX4-216ENST00000566353 ERVK-24P63145 666 aa25.63■■□□□ 1.69
STX4-216ENST00000566353 SZT2Q5T011 3432 aa25.62■■□□□ 1.69
STX4-216ENST00000566353 PDE3AQ14432 1141 aa25.62■■□□□ 1.69
STX4-216ENST00000566353 MIER1Q8N108 512 aa25.62■■□□□ 1.69
STX4-216ENST00000566353 PANK1Q8TE04 598 aa25.62■■□□□ 1.69
STX4-216ENST00000566353 C12orf42Q96LP6 360 aa25.62■■□□□ 1.69
STX4-216ENST00000566353 FEZ1Q99689 392 aa25.62■■□□□ 1.69
STX4-216ENST00000566353 PAGR1Q9BTK6 254 aa25.62■■□□□ 1.69
STX4-216ENST00000566353 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
STX4-216ENST00000566353 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
STX4-216ENST00000566353 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa25.61■■□□□ 1.69
STX4-216ENST00000566353 TTC6Q86TZ1 520 aa25.61■■□□□ 1.69
STX4-216ENST00000566353 PORCNQ9H237 461 aa25.61■■□□□ 1.69
STX4-216ENST00000566353 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
STX4-216ENST00000566353 Q3C1V9 767 aa25.6■■□□□ 1.69
STX4-216ENST00000566353 POTEEQ6S8J3 1075 aa25.6■■□□□ 1.69
STX4-216ENST00000566353 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
STX4-216ENST00000566353 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa25.6■■□□□ 1.69
STX4-216ENST00000566353 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
STX4-216ENST00000566353 RAB3GAP1Q15042 981 aa25.59■■□□□ 1.69
STX4-216ENST00000566353 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa25.59■■□□□ 1.69
STX4-216ENST00000566353 GPR142Q7Z601 462 aa25.59■■□□□ 1.69
STX4-216ENST00000566353 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
STX4-216ENST00000566353 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
STX4-216ENST00000566353 USP6NLQ92738 828 aa25.59■■□□□ 1.69
STX4-216ENST00000566353 ZBED9Q6R2W3 1325 aa25.59■■□□□ 1.69
STX4-216ENST00000566353 A0A1W2PPC1 479 aa25.58■■□□□ 1.69
STX4-216ENST00000566353 USP17L15C9J2P7 530 aa25.58■■□□□ 1.69
STX4-216ENST00000566353 USP17L13C9JLJ4 530 aa25.58■■□□□ 1.69
STX4-216ENST00000566353 USP17L11C9JVI0 530 aa25.58■■□□□ 1.69
STX4-216ENST00000566353 USP17L18D6R9N7 530 aa25.58■■□□□ 1.69
STX4-216ENST00000566353 USP17L22D6RA61 530 aa25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.9 ms