RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565236.1

CLN3-215, Transcript of CLN3, battenin, humanhuman

TSL 3

Gene CLN3, Length 582 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3-215ENST00000565236 BACE1P56817 501 aa27.24■■□□□ 1.95
CLN3-215ENST00000565236 BOLA2Q9H3K6 86 aa27.24■■□□□ 1.95
CLN3-215ENST00000565236 TMOD4Q9NZQ9 345 aa27.24■■□□□ 1.95
CLN3-215ENST00000565236 SERPINB13Q9UIV8 391 aa27.24■■□□□ 1.95
CLN3-215ENST00000565236 ZNF532Q9HCE3 1301 aa27.23■■□□□ 1.95
CLN3-215ENST00000565236 MTMR2Q13614 643 aa27.23■■□□□ 1.95
CLN3-215ENST00000565236 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa27.23■■□□□ 1.95
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CLN3-215ENST00000565236 PAG1Q9NWQ8 432 aa27.23■■□□□ 1.95
CLN3-215ENST00000565236 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa27.23■■□□□ 1.95
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CLN3-215ENST00000565236 C19orf81C9J6K1 198 aa27.22■■□□□ 1.95
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CLN3-215ENST00000565236 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP27.22■■□□□ 1.95
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CLN3-215ENST00000565236 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP27.21■■□□□ 1.95
CLN3-215ENST00000565236 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP27.21■■□□□ 1.95
CLN3-215ENST00000565236 MGAMO43451 1857 aa27.21■■□□□ 1.95
CLN3-215ENST00000565236 LOC285556D6RIA3 1793 aa27.2■■□□□ 1.95
CLN3-215ENST00000565236 FAM110CQ1W6H9 321 aa27.2■■□□□ 1.94
CLN3-215ENST00000565236 HAUS7Q99871 368 aa27.2■■□□□ 1.94
CLN3-215ENST00000565236 GABRQQ9UN88 632 aa27.2■■□□□ 1.94
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CLN3-215ENST00000565236 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa27.19■■□□□ 1.94
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CLN3-215ENST00000565236 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
CLN3-215ENST00000565236 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
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CLN3-215ENST00000565236 MCM9Q9NXL9 1143 aa27.17■■□□□ 1.94
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CLN3-215ENST00000565236 UBXN2AP68543 259 aa27.16■■□□□ 1.94
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CLN3-215ENST00000565236 ABCB5Q2M3G0 1257 aa27.16■■□□□ 1.94
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CLN3-215ENST00000565236 C12orf42Q96LP6 360 aa27.08■■□□□ 1.93
CLN3-215ENST00000565236 USP17L15C9J2P7 530 aa27.07■■□□□ 1.92
CLN3-215ENST00000565236 USP17L13C9JLJ4 530 aa27.07■■□□□ 1.92
CLN3-215ENST00000565236 USP17L11C9JVI0 530 aa27.07■■□□□ 1.92
CLN3-215ENST00000565236 USP17L18D6R9N7 530 aa27.07■■□□□ 1.92
CLN3-215ENST00000565236 USP17L22D6RA61 530 aa27.07■■□□□ 1.92
CLN3-215ENST00000565236 USP17L17D6RBQ6 530 aa27.07■■□□□ 1.92
CLN3-215ENST00000565236 USP17L19D6RCP7 530 aa27.07■■□□□ 1.92
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