RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563645.1

GDE1-202, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

TSL 2

Gene GDE1, Length 769 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-202ENST00000563645 ADAM30Q9UKF2 790 aa6.51□□□□□ -1.37
GDE1-202ENST00000563645 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
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GDE1-202ENST00000563645 F13A1P00488 732 aa6.5□□□□□ -1.37
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GDE1-202ENST00000563645 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
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GDE1-202ENST00000563645 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa6.42□□□□□ -1.38
GDE1-202ENST00000563645 HSPA12BQ96MM6 686 aa6.42□□□□□ -1.38
GDE1-202ENST00000563645 SEMA3GQ9NS98 782 aa6.42□□□□□ -1.38
GDE1-202ENST00000563645 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
GDE1-202ENST00000563645 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa6.42□□□□□ -1.38
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