RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559357.5

USP3-AS1-202, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene USP3-AS1, Length 455 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-202ENST00000559357 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
USP3-AS1-202ENST00000559357 KDM5DQ9BY66 1539 aa7.88□□□□□ -1.15
USP3-AS1-202ENST00000559357 NUP155O75694 1391 aa7.87□□□□□ -1.15
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZNF862O60290 1169 aa7.87□□□□□ -1.15
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
USP3-AS1-202ENST00000559357 AGBL5Q8NDL9 886 aa7.87□□□□□ -1.15
USP3-AS1-202ENST00000559357 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
USP3-AS1-202ENST00000559357 DMRTB1Q96MA1 342 aa7.87□□□□□ -1.15
USP3-AS1-202ENST00000559357 RBCK1Q9BYM8 510 aa7.87□□□□□ -1.15
USP3-AS1-202ENST00000559357 LGR6Q9HBX8 967 aa7.87□□□□□ -1.15
USP3-AS1-202ENST00000559357 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa7.87□□□□□ -1.15
USP3-AS1-202ENST00000559357 FAM135AQ9P2D6 1515 aa7.87□□□□□ -1.15
USP3-AS1-202ENST00000559357 DEPDC5O75140 1603 aa7.86□□□□□ -1.15
USP3-AS1-202ENST00000559357 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa7.86□□□□□ -1.15
USP3-AS1-202ENST00000559357 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa7.86□□□□□ -1.15
USP3-AS1-202ENST00000559357 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
USP3-AS1-202ENST00000559357 FANCD2OSQ96PS1 177 aa7.86□□□□□ -1.15
USP3-AS1-202ENST00000559357 KRT82Q9NSB4 513 aa7.86□□□□□ -1.15
USP3-AS1-202ENST00000559357 CEP152O94986 1710 aa7.86□□□□□ -1.15
USP3-AS1-202ENST00000559357 ID3Q02535 119 aa7.85□□□□□ -1.15
USP3-AS1-202ENST00000559357 TMC1Q8TDI8 760 aa7.85□□□□□ -1.15
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
USP3-AS1-202ENST00000559357 ATXN3LQ9H3M9 355 aa7.85□□□□□ -1.15
USP3-AS1-202ENST00000559357 A2MP01023 1474 aa7.85□□□□□ -1.15
USP3-AS1-202ENST00000559357 MLH3Q9UHC1 1453 aa7.85□□□□□ -1.15
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa7.84□□□□□ -1.15
USP3-AS1-202ENST00000559357 MAGI2Q86UL8 1455 aa7.84□□□□□ -1.15
USP3-AS1-202ENST00000559357 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
USP3-AS1-202ENST00000559357 CDK5R2Q13319 367 aa7.84□□□□□ -1.15
USP3-AS1-202ENST00000559357 PDZD3Q86UT5 571 aa7.84□□□□□ -1.15
USP3-AS1-202ENST00000559357 RETREG2Q8NC44 543 aa7.84□□□□□ -1.15
USP3-AS1-202ENST00000559357 DISC1Q9NRI5 854 aa7.84□□□□□ -1.15
USP3-AS1-202ENST00000559357 TONSLQ96HA7 1378 aa7.84□□□□□ -1.16
USP3-AS1-202ENST00000559357 E9PCH4 1651 aa7.83□□□□□ -1.16
USP3-AS1-202ENST00000559357 MROH1Q8NDA8 1641 aa7.83□□□□□ -1.16
USP3-AS1-202ENST00000559357 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
USP3-AS1-202ENST00000559357 KIF3BO15066 747 aa7.83□□□□□ -1.16
USP3-AS1-202ENST00000559357 SLFN14P0C7P3 912 aa7.83□□□□□ -1.16
USP3-AS1-202ENST00000559357 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
USP3-AS1-202ENST00000559357 CYP27C1Q4G0S4 372 aa7.83□□□□□ -1.16
USP3-AS1-202ENST00000559357 OGFOD2Q6N063 350 aa7.83□□□□□ -1.16
USP3-AS1-202ENST00000559357 PI16Q6UXB8 463 aa7.83□□□□□ -1.16
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
USP3-AS1-202ENST00000559357 ASIC4Q96FT7 647 aa7.83□□□□□ -1.16
USP3-AS1-202ENST00000559357 SLC5A6Q9Y289 635 aa7.83□□□□□ -1.16
USP3-AS1-202ENST00000559357 YEATS2Q9ULM3 1422 aa7.83□□□□□ -1.16
USP3-AS1-202ENST00000559357 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
USP3-AS1-202ENST00000559357 TET3O43151 1660 aa7.83□□□□□ -1.16
USP3-AS1-202ENST00000559357 FAM87AP0C7U9 286 aa7.82□□□□□ -1.16
USP3-AS1-202ENST00000559357 FCGRTP55899 365 aa7.82□□□□□ -1.16
USP3-AS1-202ENST00000559357 DTHD1Q6ZMT9 781 aa7.82□□□□□ -1.16
USP3-AS1-202ENST00000559357 SPRED2Q7Z698 418 aa7.82□□□□□ -1.16
USP3-AS1-202ENST00000559357 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
USP3-AS1-202ENST00000559357 STK11IPQ8N1F8 1099 aa7.82□□□□□ -1.16
USP3-AS1-202ENST00000559357 PIDD1Q9HB75 910 aa7.82□□□□□ -1.16
USP3-AS1-202ENST00000559357 TMEM39AQ9NV64 488 aa7.82□□□□□ -1.16
USP3-AS1-202ENST00000559357 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
USP3-AS1-202ENST00000559357 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa7.81□□□□□ -1.16
USP3-AS1-202ENST00000559357 BCORL1Q5H9F3 1711 aa7.81□□□□□ -1.16
USP3-AS1-202ENST00000559357 SOWAHDA6NJG2 315 aa7.81□□□□□ -1.16
USP3-AS1-202ENST00000559357 TTLL4Q14679 1199 aa7.81□□□□□ -1.16
USP3-AS1-202ENST00000559357 TMC7Q7Z402 723 aa7.81□□□□□ -1.16
USP3-AS1-202ENST00000559357 MISP3Q96FF7 219 aa7.81□□□□□ -1.16
USP3-AS1-202ENST00000559357 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
USP3-AS1-202ENST00000559357 U3KQE9 123 aa7.81□□□□□ -1.16
USP3-AS1-202ENST00000559357 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa7.81□□□□□ -1.16
USP3-AS1-202ENST00000559357 KANK1Q14678 1352 aa7.81□□□□□ -1.16
USP3-AS1-202ENST00000559357 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa7.81□□□□□ -1.16
USP3-AS1-202ENST00000559357 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa7.81□□□□□ -1.16
USP3-AS1-202ENST00000559357 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
USP3-AS1-202ENST00000559357 PPP2R3AQ06190 1150 aa7.8□□□□□ -1.16
USP3-AS1-202ENST00000559357 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
USP3-AS1-202ENST00000559357 FAM181AQ8N9Y4 354 aa7.8□□□□□ -1.16
USP3-AS1-202ENST00000559357 STK35Q8TDR2 534 aa7.8□□□□□ -1.16
USP3-AS1-202ENST00000559357 BCO2Q9BYV7 579 aa7.8□□□□□ -1.16
USP3-AS1-202ENST00000559357 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
USP3-AS1-202ENST00000559357 VWDEQ8N2E2 1590 aa7.8□□□□□ -1.16
USP3-AS1-202ENST00000559357 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa7.79□□□□□ -1.16
USP3-AS1-202ENST00000559357 PAPLNO95428 1278 aa7.79□□□□□ -1.16
USP3-AS1-202ENST00000559357 NEFMP07197 916 aa7.79□□□□□ -1.16
USP3-AS1-202ENST00000559357 JAG1P78504 1218 aa7.79□□□□□ -1.16
USP3-AS1-202ENST00000559357 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP7.79□□□□□ -1.16
USP3-AS1-202ENST00000559357 BNIP3Q12983 259 aa7.79□□□□□ -1.16
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZNF792Q3KQV3 632 aa7.79□□□□□ -1.16
USP3-AS1-202ENST00000559357 POU5F2Q8N7G0 328 aa7.79□□□□□ -1.16
USP3-AS1-202ENST00000559357 NETO1Q8TDF5 533 aa7.79□□□□□ -1.16
USP3-AS1-202ENST00000559357 NLRP2Q9NX02 1062 aa7.79□□□□□ -1.16
USP3-AS1-202ENST00000559357 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
USP3-AS1-202ENST00000559357 LEFTY1O75610 366 aa7.78□□□□□ -1.16
USP3-AS1-202ENST00000559357 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP7.78□□□□□ -1.16
USP3-AS1-202ENST00000559357 DSC3Q14574 896 aa7.78□□□□□ -1.16
USP3-AS1-202ENST00000559357 PLCL1Q15111 1095 aa7.78□□□□□ -1.16
USP3-AS1-202ENST00000559357 GGT6Q6P531 493 aa7.78□□□□□ -1.16
USP3-AS1-202ENST00000559357 SULF2Q8IWU5 870 aa7.78□□□□□ -1.16
USP3-AS1-202ENST00000559357 KCNB2Q92953 911 aa7.78□□□□□ -1.16
USP3-AS1-202ENST00000559357 ATP10AO60312 1499 aa7.78□□□□□ -1.16
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
USP3-AS1-202ENST00000559357 EFCAB6Q5THR3 1501 aa7.78□□□□□ -1.16
USP3-AS1-202ENST00000559357 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.17
USP3-AS1-202ENST00000559357 PDE4CQ08493 712 aa7.77□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.1 ms