RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558960.1

ADAMTS17-205, Transcript of ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 17, humanhuman

TSL 2

Gene ADAMTS17, Length 571 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ADAMTS17-205ENST00000558960 CTR9Q6PD62 1173 aa25.14■■□□□ 1.62
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ADAMTS17-205ENST00000558960 TBC1D8O95759 1140 aa25.13■■□□□ 1.61
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ADAMTS17-205ENST00000558960 TDO2P48775 406 aa25.13■■□□□ 1.61
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ADAMTS17-205ENST00000558960 SHMT1P34896 483 aa25.11■■□□□ 1.61
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ADAMTS17-205ENST00000558960 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa25.07■■□□□ 1.6
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ADAMTS17-205ENST00000558960 TMEM179Q6ZVK1 233 aa25.06■■□□□ 1.6
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ADAMTS17-205ENST00000558960 SLC44A5Q8NCS7 719 aa25.04■■□□□ 1.6
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ADAMTS17-205ENST00000558960 PHIPQ8WWQ0 1821 aa25.02■■□□□ 1.6
ADAMTS17-205ENST00000558960 ROBO3Q96MS0 1386 aa25.02■■□□□ 1.6
ADAMTS17-205ENST00000558960 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
ADAMTS17-205ENST00000558960 OSBPP22059 807 aa25.01■■□□□ 1.59
ADAMTS17-205ENST00000558960 SEPT2Q15019 361 aa25.01■■□□□ 1.59
ADAMTS17-205ENST00000558960 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
ADAMTS17-205ENST00000558960 VPS53Q5VIR6 699 aa25.01■■□□□ 1.59
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