RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557065.1

COCH-211, Transcript of cochlin, humanhuman

TSL 5

Gene COCH, Length 654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCH-211ENST00000557065 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
COCH-211ENST00000557065 RLBP1P12271 317 aa9.95□□□□□ -0.82
COCH-211ENST00000557065 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
COCH-211ENST00000557065 USP5P45974 858 aa9.95□□□□□ -0.82
COCH-211ENST00000557065 MAP3K12Q12852 859 aa9.95□□□□□ -0.82
COCH-211ENST00000557065 MTMR2Q13614 643 aa9.95□□□□□ -0.82
COCH-211ENST00000557065 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa9.95□□□□□ -0.82
COCH-211ENST00000557065 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
COCH-211ENST00000557065 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa9.95□□□□□ -0.82
COCH-211ENST00000557065 ADGRA1Q86SQ6 560 aa9.95□□□□□ -0.82
COCH-211ENST00000557065 ERC1Q8IUD2 1116 aa9.95□□□□□ -0.82
COCH-211ENST00000557065 MIER1Q8N108 512 aa9.95□□□□□ -0.82
COCH-211ENST00000557065 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
COCH-211ENST00000557065 DEFB118Q96PH6 123 aa9.95□□□□□ -0.82
COCH-211ENST00000557065 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
COCH-211ENST00000557065 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
COCH-211ENST00000557065 FLT1P17948 1338 aa9.95□□□□□ -0.82
COCH-211ENST00000557065 MYH2Q9UKX2 1941 aa9.95□□□□□ -0.82
COCH-211ENST00000557065 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
COCH-211ENST00000557065 MYH13Q9UKX3 1938 aa9.94□□□□□ -0.82
COCH-211ENST00000557065 MS4A1P11836 297 aa9.94□□□□□ -0.82
COCH-211ENST00000557065 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP9.94□□□□□ -0.82
COCH-211ENST00000557065 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
COCH-211ENST00000557065 JAG1P78504 1218 aa9.94□□□□□ -0.82
COCH-211ENST00000557065 EVX2Q03828 476 aa9.94□□□□□ -0.82
COCH-211ENST00000557065 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
COCH-211ENST00000557065 MIGA1Q8NAN2 632 aa9.94□□□□□ -0.82
COCH-211ENST00000557065 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa9.94□□□□□ -0.82
COCH-211ENST00000557065 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
COCH-211ENST00000557065 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
COCH-211ENST00000557065 GJD2Q9UKL4 321 aa9.94□□□□□ -0.82
COCH-211ENST00000557065 EVI5O60447 810 aa9.93□□□□□ -0.82
COCH-211ENST00000557065 GDF11O95390 407 aa9.93□□□□□ -0.82
COCH-211ENST00000557065 HMGCRP04035 888 aa9.93□□□□□ -0.82
COCH-211ENST00000557065 CEP85Q6P2H3 762 aa9.93□□□□□ -0.82
COCH-211ENST00000557065 USP17L2Q6R6M4 530 aa9.93□□□□□ -0.82
COCH-211ENST00000557065 TTC6Q86TZ1 520 aa9.93□□□□□ -0.82
COCH-211ENST00000557065 AACSQ86V21 672 aa9.93□□□□□ -0.82
COCH-211ENST00000557065 MAGEB6Q8N7X4 407 aa9.93□□□□□ -0.82
COCH-211ENST00000557065 DNAJC18Q9H819 358 aa9.93□□□□□ -0.82
COCH-211ENST00000557065 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
COCH-211ENST00000557065 MORF4L1Q9UBU8 362 aa9.93□□□□□ -0.82
COCH-211ENST00000557065 SERPINB13Q9UIV8 391 aa9.93□□□□□ -0.82
COCH-211ENST00000557065 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa9.93□□□□□ -0.82
COCH-211ENST00000557065 RPTORQ8N122 1335 aa9.92□□□□□ -0.82
COCH-211ENST00000557065 GH2P01242 217 aa9.92□□□□□ -0.82
COCH-211ENST00000557065 MAPK4P31152 587 aa9.92□□□□□ -0.82
COCH-211ENST00000557065 HERVK_113P62684 666 aa9.92□□□□□ -0.82
COCH-211ENST00000557065 PDE3AQ14432 1141 aa9.92□□□□□ -0.82
COCH-211ENST00000557065 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
COCH-211ENST00000557065 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
COCH-211ENST00000557065 PANK1Q8TE04 598 aa9.92□□□□□ -0.82
COCH-211ENST00000557065 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
COCH-211ENST00000557065 NUDT12Q9BQG2 462 aa9.92□□□□□ -0.82
COCH-211ENST00000557065 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa9.92□□□□□ -0.82
COCH-211ENST00000557065 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP9.92□□□□□ -0.82
COCH-211ENST00000557065 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
COCH-211ENST00000557065 CABP5Q9NP86 173 aa9.92□□□□□ -0.82
COCH-211ENST00000557065 RBPJLQ9UBG7 517 aa9.92□□□□□ -0.82
COCH-211ENST00000557065 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa9.92□□□□□ -0.82
COCH-211ENST00000557065 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
COCH-211ENST00000557065 CEP290O15078 2479 aa9.92□□□□□ -0.82
COCH-211ENST00000557065 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
COCH-211ENST00000557065 CYP2B6P20813 491 aa9.91□□□□□ -0.82
COCH-211ENST00000557065 RAB3GAP1Q15042 981 aa9.91□□□□□ -0.82
COCH-211ENST00000557065 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
COCH-211ENST00000557065 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa9.91□□□□□ -0.82
COCH-211ENST00000557065 TATDN1Q6P1N9 297 aa9.91□□□□□ -0.82
COCH-211ENST00000557065 NECAB2Q7Z6G3 386 aa9.91□□□□□ -0.82
COCH-211ENST00000557065 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
COCH-211ENST00000557065 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
COCH-211ENST00000557065 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
COCH-211ENST00000557065 ANKLE1Q8NAG6 615 aa9.91□□□□□ -0.82
COCH-211ENST00000557065 RHPN1Q8TCX5 695 aa9.91□□□□□ -0.82
COCH-211ENST00000557065 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
COCH-211ENST00000557065 FEZ1Q99689 392 aa9.91□□□□□ -0.82
COCH-211ENST00000557065 EHD4Q9H223 541 aa9.91□□□□□ -0.82
COCH-211ENST00000557065 ANTXR1Q9H6X2 564 aa9.91□□□□□ -0.82
COCH-211ENST00000557065 TXNRD2Q9NNW7 524 aa9.91□□□□□ -0.82
COCH-211ENST00000557065 EMILIN3Q9NT22 766 aa9.91□□□□□ -0.82
COCH-211ENST00000557065 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
COCH-211ENST00000557065 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa9.91□□□□□ -0.82
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COCH-211ENST00000557065 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa9.9□□□□□ -0.82
COCH-211ENST00000557065 USP17L15C9J2P7 530 aa9.9□□□□□ -0.82
COCH-211ENST00000557065 USP17L13C9JLJ4 530 aa9.9□□□□□ -0.82
COCH-211ENST00000557065 USP17L11C9JVI0 530 aa9.9□□□□□ -0.82
COCH-211ENST00000557065 USP17L18D6R9N7 530 aa9.9□□□□□ -0.82
COCH-211ENST00000557065 USP17L22D6RA61 530 aa9.9□□□□□ -0.82
COCH-211ENST00000557065 USP17L17D6RBQ6 530 aa9.9□□□□□ -0.82
COCH-211ENST00000557065 USP17L19D6RCP7 530 aa9.9□□□□□ -0.82
COCH-211ENST00000557065 USP17L20D6RJB6 530 aa9.9□□□□□ -0.82
COCH-211ENST00000557065 HMMRO75330 724 aa9.9□□□□□ -0.82
COCH-211ENST00000557065 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
COCH-211ENST00000557065 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
COCH-211ENST00000557065 USP14P54578 494 aa9.9□□□□□ -0.82
COCH-211ENST00000557065 ERVK-9P63128 1117 aa9.9□□□□□ -0.82
COCH-211ENST00000557065 ERVK-24P63145 666 aa9.9□□□□□ -0.82
COCH-211ENST00000557065 CCNA1P78396 465 aa9.9□□□□□ -0.82
COCH-211ENST00000557065 USP17L24Q0WX57 530 aa9.9□□□□□ -0.82
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