RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555806.5

NEDD1-208, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 1, humanhuman

TSL 4

Gene NEDD1, Length 565 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1-208ENST00000555806 SDR42E1Q8WUS8 393 aa22.24■■□□□ 1.15
NEDD1-208ENST00000555806 WDR18Q9BV38 432 aa22.24■■□□□ 1.15
NEDD1-208ENST00000555806 MCM9Q9NXL9 1143 aa22.24■■□□□ 1.15
NEDD1-208ENST00000555806 PNMA3Q9UL41 463 aa22.24■■□□□ 1.15
NEDD1-208ENST00000555806 MYH7P12883 1935 aa22.23■■□□□ 1.15
NEDD1-208ENST00000555806 MBD4O95243 580 aa22.23■■□□□ 1.15
NEDD1-208ENST00000555806 GNRH1P01148 92 aa22.23■■□□□ 1.15
NEDD1-208ENST00000555806 BCRP11274 1271 aa22.23■■□□□ 1.15
NEDD1-208ENST00000555806 TSHZ3Q63HK5 1081 aa22.23■■□□□ 1.15
NEDD1-208ENST00000555806 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa22.23■■□□□ 1.15
NEDD1-208ENST00000555806 GH2P01242 217 aa22.22■■□□□ 1.15
NEDD1-208ENST00000555806 CTGFP29279 349 aa22.22■■□□□ 1.15
NEDD1-208ENST00000555806 PLCD1P51178 756 aa22.22■■□□□ 1.15
NEDD1-208ENST00000555806 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP22.22■■□□□ 1.15
NEDD1-208ENST00000555806 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa22.22■■□□□ 1.15
NEDD1-208ENST00000555806 SH3D19Q5HYK7 790 aa22.22■■□□□ 1.15
NEDD1-208ENST00000555806 TRIM47Q96LD4 638 aa22.22■■□□□ 1.15
NEDD1-208ENST00000555806 TMOD4Q9NZQ9 345 aa22.22■■□□□ 1.15
NEDD1-208ENST00000555806 CHGBP05060 677 aa22.21■■□□□ 1.15
NEDD1-208ENST00000555806 HOXD10P28358 340 aa22.21■■□□□ 1.15
NEDD1-208ENST00000555806 BACE1P56817 501 aa22.21■■□□□ 1.15
NEDD1-208ENST00000555806 UBE3CQ15386 1083 aa22.21■■□□□ 1.15
NEDD1-208ENST00000555806 TATDN1Q6P1N9 297 aa22.21■■□□□ 1.15
NEDD1-208ENST00000555806 ARMC5Q96C12 935 aa22.21■■□□□ 1.15
NEDD1-208ENST00000555806 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
NEDD1-208ENST00000555806 USP17L10C9JJH3 530 aa22.2■■□□□ 1.14
NEDD1-208ENST00000555806 OSBPP22059 807 aa22.2■■□□□ 1.14
NEDD1-208ENST00000555806 PRMT2P55345 433 aa22.2■■□□□ 1.14
NEDD1-208ENST00000555806 FCGRTP55899 365 aa22.2■■□□□ 1.14
NEDD1-208ENST00000555806 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
NEDD1-208ENST00000555806 NBPF11Q86T75 865 aa22.2■■□□□ 1.14
NEDD1-208ENST00000555806 SRRDQ9UH36 339 aa22.2■■□□□ 1.14
NEDD1-208ENST00000555806 HTTP42858 3142 aa22.19■■□□□ 1.14
NEDD1-208ENST00000555806 C19orf81C9J6K1 198 aa22.19■■□□□ 1.14
NEDD1-208ENST00000555806 PRKAB2O43741 272 aa22.19■■□□□ 1.14
NEDD1-208ENST00000555806 RAB3GAP1Q15042 981 aa22.19■■□□□ 1.14
NEDD1-208ENST00000555806 ABCB5Q2M3G0 1257 aa22.19■■□□□ 1.14
NEDD1-208ENST00000555806 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa22.19■■□□□ 1.14
NEDD1-208ENST00000555806 CABP5Q9NP86 173 aa22.19■■□□□ 1.14
NEDD1-208ENST00000555806 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
NEDD1-208ENST00000555806 MYPNQ86TC9 1320 aa22.18■■□□□ 1.14
NEDD1-208ENST00000555806 CYP2D6P10635 497 aa22.18■■□□□ 1.14
NEDD1-208ENST00000555806 SHMT1P34896 483 aa22.18■■□□□ 1.14
NEDD1-208ENST00000555806 KBTBD3Q8NAB2 608 aa22.18■■□□□ 1.14
NEDD1-208ENST00000555806 DDRGK1Q96HY6 314 aa22.18■■□□□ 1.14
NEDD1-208ENST00000555806 FEZ1Q99689 392 aa22.18■■□□□ 1.14
NEDD1-208ENST00000555806 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
NEDD1-208ENST00000555806 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa22.18■■□□□ 1.14
NEDD1-208ENST00000555806 MGAMO43451 1857 aa22.17■■□□□ 1.14
NEDD1-208ENST00000555806 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
NEDD1-208ENST00000555806 EVX2Q03828 476 aa22.17■■□□□ 1.14
NEDD1-208ENST00000555806 GABPAQ06546 454 aa22.17■■□□□ 1.14
NEDD1-208ENST00000555806 AMOTL1Q8IY63 956 aa22.17■■□□□ 1.14
NEDD1-208ENST00000555806 RAET1EQ8TD07 263 aa22.17■■□□□ 1.14
NEDD1-208ENST00000555806 SH3TC2Q8TF17 1288 aa22.17■■□□□ 1.14
NEDD1-208ENST00000555806 ZNF333Q96JL9 665 aa22.17■■□□□ 1.14
NEDD1-208ENST00000555806 TTC41PQ6P2S7 1318 aa22.16■■□□□ 1.14
NEDD1-208ENST00000555806 ERC2O15083 957 aa22.16■■□□□ 1.14
NEDD1-208ENST00000555806 MYCP01106 439 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
NEDD1-208ENST00000555806 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
NEDD1-208ENST00000555806 USP17L2Q6R6M4 530 aa22.16■■□□□ 1.14
NEDD1-208ENST00000555806 TMEM106CQ9BVX2 250 aa22.16■■□□□ 1.14
NEDD1-208ENST00000555806 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
NEDD1-208ENST00000555806 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa22.16■■□□□ 1.14
NEDD1-208ENST00000555806 POTEFA5A3E0 1075 aa22.15■■□□□ 1.14
NEDD1-208ENST00000555806 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
NEDD1-208ENST00000555806 PRKCZQ05513 592 aa22.15■■□□□ 1.14
NEDD1-208ENST00000555806 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
NEDD1-208ENST00000555806 FAM110CQ1W6H9 321 aa22.15■■□□□ 1.14
NEDD1-208ENST00000555806 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
NEDD1-208ENST00000555806 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
NEDD1-208ENST00000555806 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
NEDD1-208ENST00000555806 ANKRD45Q5TZF3 282 aa22.14■■□□□ 1.13
NEDD1-208ENST00000555806 SLC44A5Q8NCS7 719 aa22.14■■□□□ 1.13
NEDD1-208ENST00000555806 DYNLL2Q96FJ2 89 aa22.14■■□□□ 1.13
NEDD1-208ENST00000555806 EMILIN3Q9NT22 766 aa22.14■■□□□ 1.13
NEDD1-208ENST00000555806 SWAP70Q9UH65 585 aa22.14■■□□□ 1.13
NEDD1-208ENST00000555806 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
NEDD1-208ENST00000555806 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
NEDD1-208ENST00000555806 MX1P20591 662 aa22.13■■□□□ 1.13
NEDD1-208ENST00000555806 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
NEDD1-208ENST00000555806 APPBP2Q92624 585 aa22.13■■□□□ 1.13
NEDD1-208ENST00000555806 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
NEDD1-208ENST00000555806 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa22.12■■□□□ 1.13
NEDD1-208ENST00000555806 USP17L12C9JPN9 530 aa22.12■■□□□ 1.13
NEDD1-208ENST00000555806 USP17L21D6R901 530 aa22.12■■□□□ 1.13
NEDD1-208ENST00000555806 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
NEDD1-208ENST00000555806 USP14P54578 494 aa22.12■■□□□ 1.13
NEDD1-208ENST00000555806 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
NEDD1-208ENST00000555806 SEPT2Q15019 361 aa22.12■■□□□ 1.13
NEDD1-208ENST00000555806 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
NEDD1-208ENST00000555806 PI4K2BQ8TCG2 481 aa22.12■■□□□ 1.13
NEDD1-208ENST00000555806 ACER1Q8TDN7 264 aa22.12■■□□□ 1.13
NEDD1-208ENST00000555806 GCC1Q96CN9 775 aa22.12■■□□□ 1.13
NEDD1-208ENST00000555806 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
NEDD1-208ENST00000555806 GABRQQ9UN88 632 aa22.12■■□□□ 1.13
NEDD1-208ENST00000555806 MYH8P13535 1937 aa22.12■■□□□ 1.13
NEDD1-208ENST00000555806 GRK4P32298 578 aa22.11■■□□□ 1.13
NEDD1-208ENST00000555806 GUCY1A2P33402 732 aa22.11■■□□□ 1.13
NEDD1-208ENST00000555806 AAMPQ13685 434 aa22.11■■□□□ 1.13
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