RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550208.1

BRF1-216, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, humanhuman

TSL 3

Gene BRF1, Length 1,040 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1-216ENST00000550208 NAPBQ9H115 298 aa26.92■■□□□ 1.9
BRF1-216ENST00000550208 BMP2KLQ5H9B9 411 aa26.91■■□□□ 1.9
BRF1-216ENST00000550208 IL25Q9H293 177 aa26.91■■□□□ 1.9
BRF1-216ENST00000550208 SWAP70Q9UH65 585 aa26.91■■□□□ 1.9
BRF1-216ENST00000550208 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa26.91■■□□□ 1.9
BRF1-216ENST00000550208 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
BRF1-216ENST00000550208 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
BRF1-216ENST00000550208 GTF2A2P52657 109 aa26.9■■□□□ 1.9
BRF1-216ENST00000550208 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
BRF1-216ENST00000550208 INHBEP58166 350 aa26.9■■□□□ 1.9
BRF1-216ENST00000550208 ALX1Q15699 326 aa26.9■■□□□ 1.9
BRF1-216ENST00000550208 C16orf86Q6ZW13 317 aa26.9■■□□□ 1.9
BRF1-216ENST00000550208 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
BRF1-216ENST00000550208 GH2P01242 217 aa26.89■■□□□ 1.9
BRF1-216ENST00000550208 FGAP02671 866 aa26.89■■□□□ 1.9
BRF1-216ENST00000550208 SREBF2Q12772 1141 aa26.89■■□□□ 1.9
BRF1-216ENST00000550208 ABCB5Q2M3G0 1257 aa26.89■■□□□ 1.9
BRF1-216ENST00000550208 PTPN18Q99952 460 aa26.89■■□□□ 1.9
BRF1-216ENST00000550208 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa26.89■■□□□ 1.9
BRF1-216ENST00000550208 KCNH4Q9UQ05 1017 aa26.89■■□□□ 1.9
BRF1-216ENST00000550208 DOCK1Q14185 1865 aa26.89■■□□□ 1.89
BRF1-216ENST00000550208 USP17L5A8MUK1 530 aa26.88■■□□□ 1.89
BRF1-216ENST00000550208 ASNSP08243 561 aa26.88■■□□□ 1.89
BRF1-216ENST00000550208 SNAPC2Q13487 334 aa26.88■■□□□ 1.89
BRF1-216ENST00000550208 BRI3BPQ8WY22 251 aa26.88■■□□□ 1.89
BRF1-216ENST00000550208 BEGAINQ9BUH8 593 aa26.88■■□□□ 1.89
BRF1-216ENST00000550208 GINM1Q9NU53 330 aa26.88■■□□□ 1.89
BRF1-216ENST00000550208 RNF186Q9NXI6 227 aa26.88■■□□□ 1.89
BRF1-216ENST00000550208 TAOK2Q9UL54 1235 aa26.88■■□□□ 1.89
BRF1-216ENST00000550208 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa26.87■■□□□ 1.89
BRF1-216ENST00000550208 CXCL11O14625 94 aa26.87■■□□□ 1.89
BRF1-216ENST00000550208 PPARAQ07869 468 aa26.87■■□□□ 1.89
BRF1-216ENST00000550208 CCL15Q16663 113 aa26.87■■□□□ 1.89
BRF1-216ENST00000550208 IFNL1Q8IU54 200 aa26.87■■□□□ 1.89
BRF1-216ENST00000550208 RUFY2Q8WXA3 655 aa26.87■■□□□ 1.89
BRF1-216ENST00000550208 CABP5Q9NP86 173 aa26.87■■□□□ 1.89
BRF1-216ENST00000550208 CETPP11597 493 aa26.86■■□□□ 1.89
BRF1-216ENST00000550208 SPP2Q13103 211 aa26.86■■□□□ 1.89
BRF1-216ENST00000550208 ATAD5Q96QE3 1844 aa26.86■■□□□ 1.89
BRF1-216ENST00000550208 TRIM75PA6NK02 468 aa26.85■■□□□ 1.89
BRF1-216ENST00000550208 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP26.85■■□□□ 1.89
BRF1-216ENST00000550208 FOXN1O15353 648 aa26.85■■□□□ 1.89
BRF1-216ENST00000550208 TRPA1O75762 1119 aa26.85■■□□□ 1.89
BRF1-216ENST00000550208 AKR1B1P15121 316 aa26.85■■□□□ 1.89
BRF1-216ENST00000550208 GUCY1A2P33402 732 aa26.85■■□□□ 1.89
BRF1-216ENST00000550208 ZNF280CQ8ND82 737 aa26.85■■□□□ 1.89
BRF1-216ENST00000550208 PHIPQ8WWQ0 1821 aa26.84■■□□□ 1.89
BRF1-216ENST00000550208 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
BRF1-216ENST00000550208 CTDSPL2Q05D32 466 aa26.84■■□□□ 1.89
BRF1-216ENST00000550208 RAB3GAP1Q15042 981 aa26.84■■□□□ 1.89
BRF1-216ENST00000550208 WDR18Q9BV38 432 aa26.84■■□□□ 1.89
BRF1-216ENST00000550208 MKNK2Q9HBH9 465 aa26.84■■□□□ 1.89
BRF1-216ENST00000550208 TSKSQ9UJT2 592 aa26.84■■□□□ 1.89
BRF1-216ENST00000550208 SGSM2O43147 1006 aa26.83■■□□□ 1.89
BRF1-216ENST00000550208 MOGSQ13724 837 aa26.83■■□□□ 1.89
BRF1-216ENST00000550208 SEPT2Q15019 361 aa26.83■■□□□ 1.89
BRF1-216ENST00000550208 CCDC17Q96LX7 622 aa26.83■■□□□ 1.89
BRF1-216ENST00000550208 TBC1D2Q9BYX2 928 aa26.83■■□□□ 1.89
BRF1-216ENST00000550208 AS3MTQ9HBK9 375 aa26.83■■□□□ 1.89
BRF1-216ENST00000550208 INCENPQ9NQS7 918 aa26.83■■□□□ 1.89
BRF1-216ENST00000550208 RAD50Q92878 1312 aa26.83■■□□□ 1.89
BRF1-216ENST00000550208 ROBO3Q96MS0 1386 aa26.83■■□□□ 1.88
BRF1-216ENST00000550208 PRDM1O75626 825 aa26.82■■□□□ 1.88
BRF1-216ENST00000550208 RASA1P20936 1047 aa26.82■■□□□ 1.88
BRF1-216ENST00000550208 DSCC1Q9BVC3 393 aa26.82■■□□□ 1.88
BRF1-216ENST00000550208 TACC3Q9Y6A5 838 aa26.82■■□□□ 1.88
BRF1-216ENST00000550208 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
BRF1-216ENST00000550208 BTBD19C9JJ37 291 aa26.81■■□□□ 1.88
BRF1-216ENST00000550208 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
BRF1-216ENST00000550208 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa26.81■■□□□ 1.88
BRF1-216ENST00000550208 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
BRF1-216ENST00000550208 FAM43AQ8N2R8 423 aa26.81■■□□□ 1.88
BRF1-216ENST00000550208 ANAPC4Q9UJX5 808 aa26.81■■□□□ 1.88
BRF1-216ENST00000550208 HAND2P61296 217 aa26.8■■□□□ 1.88
BRF1-216ENST00000550208 PTH1RQ03431 593 aa26.8■■□□□ 1.88
BRF1-216ENST00000550208 TMEM179Q6ZVK1 233 aa26.8■■□□□ 1.88
BRF1-216ENST00000550208 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
BRF1-216ENST00000550208 ZMYM6O95789 1325 aa26.8■■□□□ 1.88
BRF1-216ENST00000550208 LAMB1P07942 1786 aa26.79■■□□□ 1.88
BRF1-216ENST00000550208 CA12O43570 354 aa26.79■■□□□ 1.88
BRF1-216ENST00000550208 TBC1D8O95759 1140 aa26.79■■□□□ 1.88
BRF1-216ENST00000550208 PDE4BQ07343 736 aa26.79■■□□□ 1.88
BRF1-216ENST00000550208 GPAT2Q6NUI2 795 aa26.79■■□□□ 1.88
BRF1-216ENST00000550208 GADL1Q6ZQY3 521 aa26.79■■□□□ 1.88
BRF1-216ENST00000550208 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
BRF1-216ENST00000550208 ACER1Q8TDN7 264 aa26.79■■□□□ 1.88
BRF1-216ENST00000550208 SAGE1Q9NXZ1 904 aa26.79■■□□□ 1.88
BRF1-216ENST00000550208 ALDH1A1P00352 501 aa26.78■■□□□ 1.88
BRF1-216ENST00000550208 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
BRF1-216ENST00000550208 HMGCS2P54868 508 aa26.78■■□□□ 1.88
BRF1-216ENST00000550208 BACE1P56817 501 aa26.78■■□□□ 1.88
BRF1-216ENST00000550208 DGKZQ13574 1117 aa26.78■■□□□ 1.88
BRF1-216ENST00000550208 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa26.78■■□□□ 1.88
BRF1-216ENST00000550208 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP26.78■■□□□ 1.88
BRF1-216ENST00000550208 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa26.78■■□□□ 1.88
BRF1-216ENST00000550208 ZNF287Q9HBT7 754 aa26.78■■□□□ 1.88
BRF1-216ENST00000550208 MYH8P13535 1937 aa26.78■■□□□ 1.88
BRF1-216ENST00000550208 PCNTO95613 3336 aa26.78■■□□□ 1.88
BRF1-216ENST00000550208 USP17L10C9JJH3 530 aa26.77■■□□□ 1.88
BRF1-216ENST00000550208 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
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