RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526055.5

TSPAN4-216, Transcript of tetraspanin 4, humanhuman

TSL 2

Gene TSPAN4, Length 469 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4-216ENST00000526055 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
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TSPAN4-216ENST00000526055 BACE1P56817 501 aa22.23■■□□□ 1.15
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TSPAN4-216ENST00000526055 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
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TSPAN4-216ENST00000526055 LOC285556D6RIA3 1793 aa22.2■■□□□ 1.14
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TSPAN4-216ENST00000526055 TSHZ3Q63HK5 1081 aa22.18■■□□□ 1.14
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TSPAN4-216ENST00000526055 USP14P54578 494 aa22.16■■□□□ 1.14
TSPAN4-216ENST00000526055 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
TSPAN4-216ENST00000526055 C12orf60Q5U649 245 aa22.16■■□□□ 1.14
TSPAN4-216ENST00000526055 C12orf42Q96LP6 360 aa22.16■■□□□ 1.14
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TSPAN4-216ENST00000526055 CTGFP29279 349 aa22.15■■□□□ 1.14
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TSPAN4-216ENST00000526055 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
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TSPAN4-216ENST00000526055 GUCY1A2P33402 732 aa22.12■■□□□ 1.13
TSPAN4-216ENST00000526055 SBK1Q52WX2 424 aa22.12■■□□□ 1.13
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TSPAN4-216ENST00000526055 C16orf86Q6ZW13 317 aa22.12■■□□□ 1.13
TSPAN4-216ENST00000526055 RAET1EQ8TD07 263 aa22.12■■□□□ 1.13
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