RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524131.5

MEG3-223, Transcript of maternally expressed 3, human

TSL 5 BASIC

Gene MEG3, Length 721 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MEG3-223	ENST00000524131	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
MEG3-223	ENST00000524131	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		13.91	□□□□□ -0.18
MEG3-223	ENST00000524131	SLC5A1	P13866	664 aa		13.91	□□□□□ -0.18
MEG3-223	ENST00000524131	GORAB	Q5T7V8	394 aa		13.91	□□□□□ -0.18
MEG3-223	ENST00000524131	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
MEG3-223	ENST00000524131	SLAIN1	Q8ND83	568 aa		13.91	□□□□□ -0.18
MEG3-223	ENST00000524131	U2AF1L4	Q8WU68	220 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
MEG3-223	ENST00000524131	LPIN2	Q92539	896 aa		13.91	□□□□□ -0.18
MEG3-223	ENST00000524131	DPF3	Q92784	378 aa		13.91	□□□□□ -0.18
MEG3-223	ENST00000524131	LSG1	Q9H089	658 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
MEG3-223	ENST00000524131	RNF208	Q9H0X6	261 aa		13.91	□□□□□ -0.18
MEG3-223	ENST00000524131	CXCL11	O14625	94 aa		13.9	□□□□□ -0.18
MEG3-223	ENST00000524131	FCGRT	P55899	365 aa		13.9	□□□□□ -0.18
MEG3-223	ENST00000524131	TIMM10	P62072	90 aa		13.9	□□□□□ -0.18
MEG3-223	ENST00000524131	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		13.9	□□□□□ -0.18
MEG3-223	ENST00000524131	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
MEG3-223	ENST00000524131	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		13.9	□□□□□ -0.18
MEG3-223	ENST00000524131	XAGE2	Q96GT9	111 aa		13.9	□□□□□ -0.18
MEG3-223	ENST00000524131	HTATIP2	Q9BUP3	242 aa		13.9	□□□□□ -0.18
MEG3-223	ENST00000524131	UNC93B1	Q9H1C4	597 aa		13.9	□□□□□ -0.18
MEG3-223	ENST00000524131	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		13.9	□□□□□ -0.18
MEG3-223	ENST00000524131	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
MEG3-223	ENST00000524131		K7ELQ4	463 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
MEG3-223	ENST00000524131	ZBTB22	O15209	634 aa		13.89	□□□□□ -0.19
MEG3-223	ENST00000524131	FARP2	O94887	1054 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
MEG3-223	ENST00000524131	UBXN2A	P68543	259 aa		13.89	□□□□□ -0.19
MEG3-223	ENST00000524131	SCYL3	Q8IZE3	742 aa		13.89	□□□□□ -0.19
MEG3-223	ENST00000524131	KCNB2	Q92953	911 aa		13.89	□□□□□ -0.19
MEG3-223	ENST00000524131	IDI2	Q9BXS1	227 aa		13.89	□□□□□ -0.19
MEG3-223	ENST00000524131	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		13.89	□□□□□ -0.19
MEG3-223	ENST00000524131	GAK	O14976	1311 aa		13.89	□□□□□ -0.19
MEG3-223	ENST00000524131	CCDC171	Q6TFL3	1326 aa		13.89	□□□□□ -0.19
MEG3-223	ENST00000524131	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
MEG3-223	ENST00000524131	PTPRA	P18433	802 aa		13.88	□□□□□ -0.19
MEG3-223	ENST00000524131	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
MEG3-223	ENST00000524131	MAP3K10	Q02779	954 aa		13.88	□□□□□ -0.19
MEG3-223	ENST00000524131	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
MEG3-223	ENST00000524131	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
MEG3-223	ENST00000524131	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		13.88	□□□□□ -0.19
MEG3-223	ENST00000524131	CIZ1	Q9ULV3	898 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
MEG3-223	ENST00000524131	SLC45A1	Q9Y2W3	748 aa		13.88	□□□□□ -0.19
MEG3-223	ENST00000524131	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		13.88	□□□□□ -0.19
MEG3-223	ENST00000524131	ADCY3	O60266	1144 aa		13.87	□□□□□ -0.19
MEG3-223	ENST00000524131	ENTPD3	O75355	529 aa		13.87	□□□□□ -0.19
MEG3-223	ENST00000524131	SGPL1	O95470	568 aa		13.87	□□□□□ -0.19
MEG3-223	ENST00000524131	INHA	P05111	366 aa		13.87	□□□□□ -0.19
MEG3-223	ENST00000524131	SLURP2	P0DP57	97 aa		13.87	□□□□□ -0.19
MEG3-223	ENST00000524131	ELN	P15502	786 aa		13.87	□□□□□ -0.19
MEG3-223	ENST00000524131	PHKA1	P46020	1223 aa		13.87	□□□□□ -0.19
MEG3-223	ENST00000524131	FLT3LG	P49771	235 aa		13.87	□□□□□ -0.19
MEG3-223	ENST00000524131	IRF5	Q13568	498 aa		13.87	□□□□□ -0.19
MEG3-223	ENST00000524131	RNF20	Q5VTR2	975 aa		13.87	□□□□□ -0.19
MEG3-223	ENST00000524131	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		13.87	□□□□□ -0.19
MEG3-223	ENST00000524131	PXYLP1	Q8TE99	480 aa		13.87	□□□□□ -0.19
MEG3-223	ENST00000524131	MAP4K1	Q92918	833 aa		13.87	□□□□□ -0.19
MEG3-223	ENST00000524131	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
MEG3-223	ENST00000524131	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		13.87	□□□□□ -0.19
MEG3-223	ENST00000524131	PAK6	Q9NQU5	681 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
MEG3-223	ENST00000524131	USP40	Q9NVE5	1235 aa		13.87	□□□□□ -0.19
MEG3-223	ENST00000524131	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		13.87	□□□□□ -0.19
MEG3-223	ENST00000524131	FRMD4A	Q9P2Q2	1039 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
MEG3-223	ENST00000524131	BIN2	Q9UBW5	565 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
MEG3-223	ENST00000524131	ZHX2	Q9Y6X8	837 aa		13.87	□□□□□ -0.19
MEG3-223	ENST00000524131	EYS	Q5T1H1	3165 aa		13.87	□□□□□ -0.19
MEG3-223	ENST00000524131		A0A1W2PPC1	479 aa		13.86	□□□□□ -0.19
MEG3-223	ENST00000524131	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
MEG3-223	ENST00000524131	SOX1	O00570	391 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
MEG3-223	ENST00000524131	SEMA3E	O15041	775 aa		13.86	□□□□□ -0.19
MEG3-223	ENST00000524131	MCMDC2	Q4G0Z9	681 aa		13.86	□□□□□ -0.19
MEG3-223	ENST00000524131	FASTKD5	Q7L8L6	764 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
MEG3-223	ENST00000524131	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	13.86	□□□□□ -0.19
MEG3-223	ENST00000524131	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
MEG3-223	ENST00000524131	NR2E3	Q9Y5X4	410 aa		13.86	□□□□□ -0.19
MEG3-223	ENST00000524131	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
MEG3-223	ENST00000524131	GOLIM4	O00461	696 aa		13.85	□□□□□ -0.19
MEG3-223	ENST00000524131	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
MEG3-223	ENST00000524131	IGSF3	O75054	1194 aa		13.85	□□□□□ -0.19
MEG3-223	ENST00000524131	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	13.85	□□□□□ -0.19
MEG3-223	ENST00000524131	ADORA1	P30542	326 aa		13.85	□□□□□ -0.19
MEG3-223	ENST00000524131	SLC4A3	P48751	1232 aa		13.85	□□□□□ -0.19
MEG3-223	ENST00000524131	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		13.85	□□□□□ -0.19
MEG3-223	ENST00000524131	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		13.85	□□□□□ -0.19
MEG3-223	ENST00000524131	GADL1	Q6ZQY3	521 aa		13.85	□□□□□ -0.19
MEG3-223	ENST00000524131	ANP32E	Q9BTT0	268 aa		13.85	□□□□□ -0.19
MEG3-223	ENST00000524131	CRISPLD2	Q9H0B8	497 aa		13.85	□□□□□ -0.19
MEG3-223	ENST00000524131	IL25	Q9H293	177 aa		13.85	□□□□□ -0.19
MEG3-223	ENST00000524131	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		13.85	□□□□□ -0.19
MEG3-223	ENST00000524131	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		13.85	□□□□□ -0.19
MEG3-223	ENST00000524131		U3KPZ7	1027 aa	Predicted RBP	13.85	□□□□□ -0.19
MEG3-223	ENST00000524131	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
MEG3-223	ENST00000524131		A0A0D9SFI3	127 aa		13.84	□□□□□ -0.19
MEG3-223	ENST00000524131	TNPO2	O14787	897 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
MEG3-223	ENST00000524131	KRT32	Q14532	448 aa		13.84	□□□□□ -0.19
MEG3-223	ENST00000524131	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
MEG3-223	ENST00000524131	CCDC84	Q86UT8	332 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
MEG3-223	ENST00000524131	FAM227B	Q96M60	508 aa		13.84	□□□□□ -0.19
MEG3-223	ENST00000524131	DEFB118	Q96PH6	123 aa		13.84	□□□□□ -0.19
MEG3-223	ENST00000524131	PICK1	Q9NRD5	415 aa		13.84	□□□□□ -0.19
MEG3-223	ENST00000524131	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
MEG3-223	ENST00000524131	CHMP5	Q9NZZ3	219 aa		13.84	□□□□□ -0.19

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