RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498648.5

STRADB-210, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta, humanhuman

TSL 3

Gene STRADB, Length 535 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADB-210ENST00000498648 PBX4Q9BYU1 374 aa6.23□□□□□ -1.41
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STRADB-210ENST00000498648 RUBCNLQ9H714 662 aa6.23□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 TRIM39Q9HCM9 518 aa6.23□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 GABRDO14764 452 aa6.22□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 RHOQP17081 205 aa6.22□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 CDK8P49336 464 aa6.22□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 RAPGEF1Q13905 1077 aa6.22□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 MLECQ14165 292 aa6.22□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
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STRADB-210ENST00000498648 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP6.22□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 NLRC3Q7RTR2 1065 aa6.22□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 PDZD3Q86UT5 571 aa6.22□□□□□ -1.41
STRADB-210ENST00000498648 SPICE1Q8N0Z3 855 aa6.22□□□□□ -1.41
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STRADB-210ENST00000498648 CNNM2Q9H8M5 875 aa6.22□□□□□ -1.41
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STRADB-210ENST00000498648 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
STRADB-210ENST00000498648 TRIM27P14373 513 aa6.21□□□□□ -1.42
STRADB-210ENST00000498648 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
STRADB-210ENST00000498648 CD53P19397 219 aa6.21□□□□□ -1.42
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STRADB-210ENST00000498648 ATP11AP98196 1134 aa6.21□□□□□ -1.42
STRADB-210ENST00000498648 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
STRADB-210ENST00000498648 ZNF423Q2M1K9 1284 aa6.21□□□□□ -1.42
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STRADB-210ENST00000498648 GRAMD1BQ3KR37 738 aa6.21□□□□□ -1.42
STRADB-210ENST00000498648 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
STRADB-210ENST00000498648 SYDE2Q5VT97 1194 aa6.21□□□□□ -1.42
STRADB-210ENST00000498648 CDCP2Q5VXM1 449 aa6.21□□□□□ -1.42
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STRADB-210ENST00000498648 REV1Q9UBZ9 1251 aa6.21□□□□□ -1.42
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STRADB-210ENST00000498648 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
STRADB-210ENST00000498648 CORINQ9Y5Q5 1042 aa6.21□□□□□ -1.42
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STRADB-210ENST00000498648 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
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STRADB-210ENST00000498648 TTC1Q99614 292 aa6.2□□□□□ -1.42
STRADB-210ENST00000498648 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
STRADB-210ENST00000498648 MTFR1LQ9H019 292 aa6.2□□□□□ -1.42
STRADB-210ENST00000498648 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa6.19□□□□□ -1.42
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STRADB-210ENST00000498648 VSTM5A8MXK1 200 aa6.19□□□□□ -1.42
STRADB-210ENST00000498648 J3QL48 77 aa6.19□□□□□ -1.42
STRADB-210ENST00000498648 TBX3O15119 743 aa6.19□□□□□ -1.42
STRADB-210ENST00000498648 FBXO21O94952 628 aa6.19□□□□□ -1.42
STRADB-210ENST00000498648 NAT2P11245 290 aa6.19□□□□□ -1.42
STRADB-210ENST00000498648 FGFR1P11362 822 aa6.19□□□□□ -1.42
STRADB-210ENST00000498648 BPIP17213 487 aa6.19□□□□□ -1.42
STRADB-210ENST00000498648 SLC19A1P41440 591 aa6.19□□□□□ -1.42
STRADB-210ENST00000498648 NEK4P51957 841 aa6.19□□□□□ -1.42
STRADB-210ENST00000498648 SIK1P57059 783 aa6.19□□□□□ -1.42
STRADB-210ENST00000498648 GPLD1P80108 840 aa6.19□□□□□ -1.42
STRADB-210ENST00000498648 TCIRG1Q13488 830 aa6.19□□□□□ -1.42
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STRADB-210ENST00000498648 BRAPQ7Z569 592 aa6.19□□□□□ -1.42
STRADB-210ENST00000498648 PODNQ7Z5L7 613 aa6.19□□□□□ -1.42
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STRADB-210ENST00000498648 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
STRADB-210ENST00000498648 PRDM11Q9NQV5 511 aa6.19□□□□□ -1.42
STRADB-210ENST00000498648 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
STRADB-210ENST00000498648 SOX13Q9UN79 622 aa6.19□□□□□ -1.42
STRADB-210ENST00000498648 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa6.19□□□□□ -1.42
STRADB-210ENST00000498648 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
STRADB-210ENST00000498648 KPNA6O60684 536 aa6.18□□□□□ -1.42
STRADB-210ENST00000498648 UPP2O95045 317 aa6.18□□□□□ -1.42
STRADB-210ENST00000498648 APBA3O96018 575 aa6.18□□□□□ -1.42
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