RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495785.1

SRSF10-215, Transcript of serine and arginine rich splicing factor 10, humanhuman

TSL 5

Gene SRSF10, Length 1,390 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF10-215ENST00000495785 TNS4Q8IZW8 715 aa9.47□□□□□ -0.89
SRSF10-215ENST00000495785 RHBDD1Q8TEB9 315 aa9.47□□□□□ -0.89
SRSF10-215ENST00000495785 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
SRSF10-215ENST00000495785 CHPF2Q9P2E5 772 aa9.47□□□□□ -0.89
SRSF10-215ENST00000495785 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
SRSF10-215ENST00000495785 ABCC4O15439 1325 aa9.47□□□□□ -0.89
SRSF10-215ENST00000495785 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
SRSF10-215ENST00000495785 PPIP5K2O43314 1243 aa9.46□□□□□ -0.9
SRSF10-215ENST00000495785 BBOX1O75936 387 aa9.46□□□□□ -0.9
SRSF10-215ENST00000495785 MYCP01106 439 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
SRSF10-215ENST00000495785 TAF1P21675 1872 aa9.46□□□□□ -0.9
SRSF10-215ENST00000495785 SCNN1DP51172 638 aa9.46□□□□□ -0.9
SRSF10-215ENST00000495785 LTBP1Q14766 1721 aa9.46□□□□□ -0.9
SRSF10-215ENST00000495785 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP9.46□□□□□ -0.9
SRSF10-215ENST00000495785 SP8Q8IXZ3 490 aa9.46□□□□□ -0.9
SRSF10-215ENST00000495785 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa9.45□□□□□ -0.9
SRSF10-215ENST00000495785 CNTNAP1P78357 1384 aa9.45□□□□□ -0.9
SRSF10-215ENST00000495785 CXCL9Q07325 125 aa9.45□□□□□ -0.9
SRSF10-215ENST00000495785 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa9.45□□□□□ -0.9
SRSF10-215ENST00000495785 DUSP27Q5VZP5 1158 aa9.45□□□□□ -0.9
SRSF10-215ENST00000495785 NIM1KQ8IY84 436 aa9.45□□□□□ -0.9
SRSF10-215ENST00000495785 PLBD2Q8NHP8 589 aa9.45□□□□□ -0.9
SRSF10-215ENST00000495785 ZNF592Q92610 1267 aa9.45□□□□□ -0.9
SRSF10-215ENST00000495785 FAM89AQ96GI7 184 aa9.45□□□□□ -0.9
SRSF10-215ENST00000495785 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
SRSF10-215ENST00000495785 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
SRSF10-215ENST00000495785 LAMB2P55268 1798 aa9.44□□□□□ -0.9
SRSF10-215ENST00000495785 SH3TC1Q8TE82 1336 aa9.44□□□□□ -0.9
SRSF10-215ENST00000495785 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
SRSF10-215ENST00000495785 FOXN1O15353 648 aa9.44□□□□□ -0.9
SRSF10-215ENST00000495785 CD33P20138 364 aa9.44□□□□□ -0.9
SRSF10-215ENST00000495785 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
SRSF10-215ENST00000495785 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
SRSF10-215ENST00000495785 LRP8Q14114 963 aa9.44□□□□□ -0.9
SRSF10-215ENST00000495785 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa9.44□□□□□ -0.9
SRSF10-215ENST00000495785 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
SRSF10-215ENST00000495785 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa9.44□□□□□ -0.9
SRSF10-215ENST00000495785 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
SRSF10-215ENST00000495785 NLRP8Q86W28 1048 aa9.44□□□□□ -0.9
SRSF10-215ENST00000495785 ISCA1Q9BUE6 129 aa9.44□□□□□ -0.9
SRSF10-215ENST00000495785 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
SRSF10-215ENST00000495785 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
SRSF10-215ENST00000495785 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
SRSF10-215ENST00000495785 ZNRF3Q9ULT6 936 aa9.44□□□□□ -0.9
SRSF10-215ENST00000495785 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa9.43□□□□□ -0.9
SRSF10-215ENST00000495785 TRAF5O00463 557 aa9.43□□□□□ -0.9
SRSF10-215ENST00000495785 APAF1O14727 1248 aa9.43□□□□□ -0.9
SRSF10-215ENST00000495785 RAD17O75943 681 aa9.43□□□□□ -0.9
SRSF10-215ENST00000495785 ZNF853P0CG23 659 aa9.43□□□□□ -0.9
SRSF10-215ENST00000495785 MAPTP10636 758 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
SRSF10-215ENST00000495785 GRAPQ13588 217 aa9.43□□□□□ -0.9
SRSF10-215ENST00000495785 DEFB115Q30KQ5 88 aa9.43□□□□□ -0.9
SRSF10-215ENST00000495785 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
SRSF10-215ENST00000495785 VPS33BQ9H267 617 aa9.43□□□□□ -0.9
SRSF10-215ENST00000495785 CEP126Q9P2H0 1117 aa9.43□□□□□ -0.9
SRSF10-215ENST00000495785 PRR12Q9ULL5 1215 aa9.43□□□□□ -0.9
SRSF10-215ENST00000495785 DCDC2BA2VCK2 349 aa9.42□□□□□ -0.9
SRSF10-215ENST00000495785 RASSF10A6NK89 507 aa9.42□□□□□ -0.9
SRSF10-215ENST00000495785 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
SRSF10-215ENST00000495785 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
SRSF10-215ENST00000495785 TNP2Q05952 138 aa9.42□□□□□ -0.9
SRSF10-215ENST00000495785 KIAA2012Q0VF49 1180 aa9.42□□□□□ -0.9
SRSF10-215ENST00000495785 CST9Q5W186 159 aa9.42□□□□□ -0.9
SRSF10-215ENST00000495785 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
SRSF10-215ENST00000495785 SUPT20HQ8NEM7 779 aa9.42□□□□□ -0.9
SRSF10-215ENST00000495785 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
SRSF10-215ENST00000495785 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
SRSF10-215ENST00000495785 HYPKQ9NX55 129 aa9.42□□□□□ -0.9
SRSF10-215ENST00000495785 GPRC5DQ9NZD1 345 aa9.42□□□□□ -0.9
SRSF10-215ENST00000495785 SHTN1A0MZ66 631 aa9.41□□□□□ -0.9
SRSF10-215ENST00000495785 YDJCA8MPS7 323 aa9.41□□□□□ -0.9
SRSF10-215ENST00000495785 APBB1O00213 710 aa9.41□□□□□ -0.9
SRSF10-215ENST00000495785 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
SRSF10-215ENST00000495785 HOXB7P09629 217 aa9.41□□□□□ -0.9
SRSF10-215ENST00000495785 ALAS2P22557 587 aa9.41□□□□□ -0.9
SRSF10-215ENST00000495785 PLA2G4AP47712 749 aa9.41□□□□□ -0.9
SRSF10-215ENST00000495785 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
SRSF10-215ENST00000495785 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
SRSF10-215ENST00000495785 CCDC184Q52MB2 194 aa9.41□□□□□ -0.9
SRSF10-215ENST00000495785 CIAPIN1Q6FI81 312 aa9.41□□□□□ -0.9
SRSF10-215ENST00000495785 C8orf58Q8NAV2 365 aa9.41□□□□□ -0.9
SRSF10-215ENST00000495785 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
SRSF10-215ENST00000495785 NACC1Q96RE7 527 aa9.41□□□□□ -0.9
SRSF10-215ENST00000495785 KCNQ5Q9NR82 932 aa9.41□□□□□ -0.9
SRSF10-215ENST00000495785 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
SRSF10-215ENST00000495785 COL4A1P02462 1669 aa9.41□□□□□ -0.9
SRSF10-215ENST00000495785 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
SRSF10-215ENST00000495785 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
SRSF10-215ENST00000495785 AIDAQ96BJ3 306 aa9.4□□□□□ -0.9
SRSF10-215ENST00000495785 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
SRSF10-215ENST00000495785 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
SRSF10-215ENST00000495785 POLLQ9UGP5 575 aa9.4□□□□□ -0.9
SRSF10-215ENST00000495785 HCN2Q9UL51 889 aa9.4□□□□□ -0.9
SRSF10-215ENST00000495785 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.91
SRSF10-215ENST00000495785 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
SRSF10-215ENST00000495785 LBX1P52954 281 aa9.39□□□□□ -0.91
SRSF10-215ENST00000495785 GPSM2P81274 684 aa9.39□□□□□ -0.91
SRSF10-215ENST00000495785 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
SRSF10-215ENST00000495785 DLK2Q6UY11 383 aa9.39□□□□□ -0.91
SRSF10-215ENST00000495785 C1orf216Q8TAB5 229 aa9.39□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.8 ms