RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493959.6

SENP6-211, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 3

Gene SENP6, Length 867 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-211ENST00000493959 MYCP01106 439 aaPredicted RBP27.44■■□□□ 1.98
SENP6-211ENST00000493959 OSBPP22059 807 aa27.44■■□□□ 1.98
SENP6-211ENST00000493959 SH3D19Q5HYK7 790 aa27.44■■□□□ 1.98
SENP6-211ENST00000493959 TSHZ3Q63HK5 1081 aa27.44■■□□□ 1.98
SENP6-211ENST00000493959 TATDN1Q6P1N9 297 aa27.44■■□□□ 1.98
SENP6-211ENST00000493959 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP27.44■■□□□ 1.98
SENP6-211ENST00000493959 CRBNQ96SW2 442 aa27.44■■□□□ 1.98
SENP6-211ENST00000493959 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP27.44■■□□□ 1.98
SENP6-211ENST00000493959 SERPINB13Q9UIV8 391 aa27.44■■□□□ 1.98
SENP6-211ENST00000493959 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP27.43■■□□□ 1.98
SENP6-211ENST00000493959 DOCK3Q8IZD9 2030 aa27.43■■□□□ 1.98
SENP6-211ENST00000493959 GH2P01242 217 aa27.43■■□□□ 1.98
SENP6-211ENST00000493959 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP27.43■■□□□ 1.98
SENP6-211ENST00000493959 MTMR2Q13614 643 aa27.43■■□□□ 1.98
SENP6-211ENST00000493959 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa27.43■■□□□ 1.98
SENP6-211ENST00000493959 TTC6Q86TZ1 520 aa27.43■■□□□ 1.98
SENP6-211ENST00000493959 ZNF333Q96JL9 665 aa27.43■■□□□ 1.98
SENP6-211ENST00000493959 TBC1D2Q9BYX2 928 aa27.43■■□□□ 1.98
SENP6-211ENST00000493959 AS3MTQ9HBK9 375 aa27.43■■□□□ 1.98
SENP6-211ENST00000493959 ECHDC1Q9NTX5 307 aa27.43■■□□□ 1.98
SENP6-211ENST00000493959 SRRDQ9UH36 339 aa27.43■■□□□ 1.98
SENP6-211ENST00000493959 GNRH1P01148 92 aa27.42■■□□□ 1.98
SENP6-211ENST00000493959 CYP2D6P10635 497 aa27.42■■□□□ 1.98
SENP6-211ENST00000493959 BACE1P56817 501 aa27.42■■□□□ 1.98
SENP6-211ENST00000493959 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa27.42■■□□□ 1.98
SENP6-211ENST00000493959 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP27.42■■□□□ 1.98
SENP6-211ENST00000493959 MBD4O95243 580 aa27.41■■□□□ 1.98
SENP6-211ENST00000493959 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
SENP6-211ENST00000493959 EHD4Q9H223 541 aa27.41■■□□□ 1.98
SENP6-211ENST00000493959 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
SENP6-211ENST00000493959 MCM9Q9NXL9 1143 aa27.41■■□□□ 1.98
SENP6-211ENST00000493959 EN2P19622 333 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
SENP6-211ENST00000493959 SHMT1P34896 483 aa27.4■■□□□ 1.98
SENP6-211ENST00000493959 GABRQQ9UN88 632 aa27.4■■□□□ 1.98
SENP6-211ENST00000493959 SMIM22K7EJ46 135 aa27.39■■□□□ 1.98
SENP6-211ENST00000493959 FCGRTP55899 365 aa27.39■■□□□ 1.98
SENP6-211ENST00000493959 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.98
SENP6-211ENST00000493959 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP27.39■■□□□ 1.985e-16■□□□□ 8.2
SENP6-211ENST00000493959 GINM1Q9NU53 330 aa27.39■■□□□ 1.98
SENP6-211ENST00000493959 USP17L10C9JJH3 530 aa27.38■■□□□ 1.97
SENP6-211ENST00000493959 HOXD10P28358 340 aa27.38■■□□□ 1.97
SENP6-211ENST00000493959 PRMT2P55345 433 aa27.38■■□□□ 1.97
SENP6-211ENST00000493959 PRKCZQ05513 592 aa27.38■■□□□ 1.97
SENP6-211ENST00000493959 GABPAQ06546 454 aa27.38■■□□□ 1.97
SENP6-211ENST00000493959 NBPF11Q86T75 865 aa27.38■■□□□ 1.97
SENP6-211ENST00000493959 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
SENP6-211ENST00000493959 EMILIN3Q9NT22 766 aa27.38■■□□□ 1.97
SENP6-211ENST00000493959 MGAMO43451 1857 aa27.38■■□□□ 1.97
SENP6-211ENST00000493959 MYPNQ86TC9 1320 aa27.38■■□□□ 1.97
SENP6-211ENST00000493959 PEX10O60683 326 aa27.37■■□□□ 1.97
SENP6-211ENST00000493959 UBE3CQ15386 1083 aa27.37■■□□□ 1.97
SENP6-211ENST00000493959 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
SENP6-211ENST00000493959 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
SENP6-211ENST00000493959 TMOD4Q9NZQ9 345 aa27.37■■□□□ 1.97
SENP6-211ENST00000493959 PNMA3Q9UL41 463 aa27.37■■□□□ 1.97
SENP6-211ENST00000493959 LOC285556D6RIA3 1793 aa27.37■■□□□ 1.97
SENP6-211ENST00000493959 C19orf81C9J6K1 198 aa27.36■■□□□ 1.97
SENP6-211ENST00000493959 GUCY1A2P33402 732 aa27.36■■□□□ 1.97
SENP6-211ENST00000493959 RAB3GAP1Q15042 981 aa27.36■■□□□ 1.97
SENP6-211ENST00000493959 ABCB5Q2M3G0 1257 aa27.36■■□□□ 1.97
SENP6-211ENST00000493959 SLC44A5Q8NCS7 719 aa27.36■■□□□ 1.97
SENP6-211ENST00000493959 RAET1EQ8TD07 263 aa27.36■■□□□ 1.97
SENP6-211ENST00000493959 ACER1Q8TDN7 264 aa27.36■■□□□ 1.97
SENP6-211ENST00000493959 DYNLL2Q96FJ2 89 aa27.36■■□□□ 1.97
SENP6-211ENST00000493959 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa27.35■■□□□ 1.97
SENP6-211ENST00000493959 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP27.35■■□□□ 1.97
SENP6-211ENST00000493959 TMEM106CQ9BVX2 250 aa27.35■■□□□ 1.97
SENP6-211ENST00000493959 NAV1Q8NEY1 1877 aa27.34■■□□□ 1.97
SENP6-211ENST00000493959 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
SENP6-211ENST00000493959 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
SENP6-211ENST00000493959 MTFR1Q15390 333 aa27.34■■□□□ 1.97
SENP6-211ENST00000493959 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
SENP6-211ENST00000493959 MYH7P12883 1935 aa27.33■■□□□ 1.97
SENP6-211ENST00000493959 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
SENP6-211ENST00000493959 USP17L2Q6R6M4 530 aa27.33■■□□□ 1.97
SENP6-211ENST00000493959 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
SENP6-211ENST00000493959 GRK4P32298 578 aa27.32■■□□□ 1.96
SENP6-211ENST00000493959 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
SENP6-211ENST00000493959 FLT3LGP49771 235 aa27.32■■□□□ 1.96
SENP6-211ENST00000493959 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
SENP6-211ENST00000493959 SEPT2Q15019 361 aa27.32■■□□□ 1.96
SENP6-211ENST00000493959 FAM110CQ1W6H9 321 aa27.32■■□□□ 1.96
SENP6-211ENST00000493959 POTEEQ6S8J3 1075 aa27.32■■□□□ 1.96
SENP6-211ENST00000493959 CABP5Q9NP86 173 aa27.32■■□□□ 1.96
SENP6-211ENST00000493959 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa27.32■■□□□ 1.96
SENP6-211ENST00000493959 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa27.32■■□□□ 1.96
SENP6-211ENST00000493959 USP17L12C9JPN9 530 aa27.31■■□□□ 1.96
SENP6-211ENST00000493959 USP17L21D6R901 530 aa27.31■■□□□ 1.96
SENP6-211ENST00000493959 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa27.31■■□□□ 1.96
SENP6-211ENST00000493959 KBTBD3Q8NAB2 608 aa27.31■■□□□ 1.96
SENP6-211ENST00000493959 GPATCH3Q96I76 525 aa27.31■■□□□ 1.96
SENP6-211ENST00000493959 TXNRD2Q9NNW7 524 aa27.31■■□□□ 1.96
SENP6-211ENST00000493959 OSBP2Q969R2 916 aa27.3■■□□□ 1.96
SENP6-211ENST00000493959 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
SENP6-211ENST00000493959 ELNP15502 786 aa27.29■■□□□ 1.96
SENP6-211ENST00000493959 HERVK_113P62684 666 aa27.29■■□□□ 1.96
SENP6-211ENST00000493959 C12orf60Q5U649 245 aa27.29■■□□□ 1.96
SENP6-211ENST00000493959 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
SENP6-211ENST00000493959 FEZ1Q99689 392 aa27.29■■□□□ 1.96
SENP6-211ENST00000493959 RBPJLQ9UBG7 517 aa27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 101.5 ms