RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493607.1

SERBP1-208, Transcript of SERPINE1 mRNA binding protein 1, human

TSL 2

Gene SERBP1, Length 615 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SERBP1-208	ENST00000493607	C19orf81	C9J6K1	198 aa		28.13	■■■□□ 2.09
SERBP1-208	ENST00000493607	BACE1	P56817	501 aa		28.13	■■■□□ 2.09
SERBP1-208	ENST00000493607	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	28.13	■■■□□ 2.09	2e-70	■■□□□ 13.6
SERBP1-208	ENST00000493607	CPA4	Q9UI42	421 aa		28.13	■■■□□ 2.09
SERBP1-208	ENST00000493607	ZSWIM8	A7E2V4	1837 aa		28.13	■■■□□ 2.09
SERBP1-208	ENST00000493607	RBBP6	Q7Z6E9	1792 aa	Known RBP	28.12	■■■□□ 2.09
SERBP1-208	ENST00000493607	ERC2	O15083	957 aa		28.12	■■■□□ 2.09
SERBP1-208	ENST00000493607	CYP2C8	P10632	490 aa		28.12	■■■□□ 2.09
SERBP1-208	ENST00000493607	PLCD1	P51178	756 aa		28.12	■■■□□ 2.09
SERBP1-208	ENST00000493607	JAG1	P78504	1218 aa		28.12	■■■□□ 2.09
SERBP1-208	ENST00000493607	ARMC5	Q96C12	935 aa		28.12	■■■□□ 2.09
SERBP1-208	ENST00000493607	MCM9	Q9NXL9	1143 aa		28.12	■■■□□ 2.09
SERBP1-208	ENST00000493607	MYH8	P13535	1937 aa		28.12	■■■□□ 2.09
SERBP1-208	ENST00000493607	BAZ2A	Q9UIF9	1905 aa	Known RBP	28.12	■■■□□ 2.09
SERBP1-208	ENST00000493607	MBD4	O95243	580 aa		28.11	■■■□□ 2.09
SERBP1-208	ENST00000493607	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	28.11	■■■□□ 2.09
SERBP1-208	ENST00000493607	ARMT1	Q9H993	441 aa		28.11	■■■□□ 2.09
SERBP1-208	ENST00000493607	GDF11	O95390	407 aa		28.1	■■■□□ 2.09
SERBP1-208	ENST00000493607	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	28.1	■■■□□ 2.09
SERBP1-208	ENST00000493607	HMGCS2	P54868	508 aa		28.1	■■■□□ 2.09
SERBP1-208	ENST00000493607	SDR42E1	Q8WUS8	393 aa		28.1	■■■□□ 2.09
SERBP1-208	ENST00000493607	USP17L10	C9JJH3	530 aa		28.09	■■■□□ 2.09
SERBP1-208	ENST00000493607	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	28.09	■■■□□ 2.09
SERBP1-208	ENST00000493607	SHMT1	P34896	483 aa		28.09	■■■□□ 2.09
SERBP1-208	ENST00000493607	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	28.09	■■■□□ 2.09
SERBP1-208	ENST00000493607	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	28.09	■■■□□ 2.09
SERBP1-208	ENST00000493607	TREML2	Q5T2D2	321 aa		28.09	■■■□□ 2.09
SERBP1-208	ENST00000493607	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		28.09	■■■□□ 2.09
SERBP1-208	ENST00000493607	HOXD10	P28358	340 aa		28.08	■■■□□ 2.09
SERBP1-208	ENST00000493607	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	28.08	■■■□□ 2.09
SERBP1-208	ENST00000493607	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	28.08	■■■□□ 2.09
SERBP1-208	ENST00000493607	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		28.08	■■■□□ 2.09
SERBP1-208	ENST00000493607	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		28.08	■■■□□ 2.09
SERBP1-208	ENST00000493607	SMCR8	Q8TEV9	937 aa	Predicted RBP	28.08	■■■□□ 2.09
SERBP1-208	ENST00000493607	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		28.08	■■■□□ 2.09
SERBP1-208	ENST00000493607	SWAP70	Q9UH65	585 aa		28.08	■■■□□ 2.09
SERBP1-208	ENST00000493607	GH2	P01242	217 aa		28.07	■■■□□ 2.08
SERBP1-208	ENST00000493607	PSMC4	P43686	418 aa		28.07	■■■□□ 2.08
SERBP1-208	ENST00000493607	GCLC	P48506	637 aa	Predicted RBP	28.07	■■■□□ 2.08
SERBP1-208	ENST00000493607	MTMR2	Q13614	643 aa		28.07	■■■□□ 2.08
SERBP1-208	ENST00000493607	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		28.07	■■■□□ 2.08
SERBP1-208	ENST00000493607	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	28.07	■■■□□ 2.08
SERBP1-208	ENST00000493607	TMOD4	Q9NZQ9	345 aa		28.07	■■■□□ 2.08
SERBP1-208	ENST00000493607	MX1	P20591	662 aa		28.06	■■■□□ 2.08
SERBP1-208	ENST00000493607	OSBP	P22059	807 aa		28.06	■■■□□ 2.08
SERBP1-208	ENST00000493607	CTGF	P29279	349 aa		28.06	■■■□□ 2.08
SERBP1-208	ENST00000493607	ABCB5	Q2M3G0	1257 aa		28.06	■■■□□ 2.08
SERBP1-208	ENST00000493607	APPBP2	Q92624	585 aa		28.06	■■■□□ 2.08
SERBP1-208	ENST00000493607	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		28.06	■■■□□ 2.08
SERBP1-208	ENST00000493607	TRIM47	Q96LD4	638 aa		28.06	■■■□□ 2.08
SERBP1-208	ENST00000493607	C12orf42	Q96LP6	360 aa		28.06	■■■□□ 2.08
SERBP1-208	ENST00000493607	CABP5	Q9NP86	173 aa		28.06	■■■□□ 2.08
SERBP1-208	ENST00000493607	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	28.06	■■■□□ 2.08
SERBP1-208	ENST00000493607	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		28.05	■■■□□ 2.08
SERBP1-208	ENST00000493607	SHROOM1	Q2M3G4	852 aa	Predicted RBP	28.05	■■■□□ 2.08
SERBP1-208	ENST00000493607	SRRD	Q9UH36	339 aa		28.05	■■■□□ 2.08
SERBP1-208	ENST00000493607	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		28.05	■■■□□ 2.08
SERBP1-208	ENST00000493607	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	28.04	■■■□□ 2.08
SERBP1-208	ENST00000493607	PRKAB2	O43741	272 aa		28.04	■■■□□ 2.08
SERBP1-208	ENST00000493607	CHGB	P05060	677 aa		28.04	■■■□□ 2.08
SERBP1-208	ENST00000493607	FCGRT	P55899	365 aa		28.04	■■■□□ 2.08
SERBP1-208	ENST00000493607	SOX10	P56693	466 aa		28.04	■■■□□ 2.08
SERBP1-208	ENST00000493607	C12orf60	Q5U649	245 aa		28.04	■■■□□ 2.08
SERBP1-208	ENST00000493607	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		28.04	■■■□□ 2.08
SERBP1-208	ENST00000493607	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		28.04	■■■□□ 2.08
SERBP1-208	ENST00000493607	NBPF11	Q86T75	865 aa		28.04	■■■□□ 2.08
SERBP1-208	ENST00000493607	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		28.04	■■■□□ 2.08
SERBP1-208	ENST00000493607	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	28.04	■■■□□ 2.08
SERBP1-208	ENST00000493607	CENPF	P49454	3210 aa		28.03	■■■□□ 2.08
SERBP1-208	ENST00000493607	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		28.03	■■■□□ 2.08
SERBP1-208	ENST00000493607	USP17L2	Q6R6M4	530 aa		28.03	■■■□□ 2.08
SERBP1-208	ENST00000493607	KIAA1683	Q9H0B3	1180 aa		28.03	■■■□□ 2.08
SERBP1-208	ENST00000493607	ASCC2	Q9H1I8	757 aa	Predicted RBP	28.03	■■■□□ 2.08
SERBP1-208	ENST00000493607	STAP2	Q9UGK3	403 aa		28.03	■■■□□ 2.08
SERBP1-208	ENST00000493607	SLC4A4	Q9Y6R1	1079 aa		28.03	■■■□□ 2.08
SERBP1-208	ENST00000493607	FMNL1	O95466	1100 aa	Predicted RBP	28.02	■■■□□ 2.08
SERBP1-208	ENST00000493607	USP14	P54578	494 aa		28.02	■■■□□ 2.08
SERBP1-208	ENST00000493607	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		28.02	■■■□□ 2.08
SERBP1-208	ENST00000493607	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	28.02	■■■□□ 2.08
SERBP1-208	ENST00000493607	ZNF333	Q96JL9	665 aa		28.02	■■■□□ 2.08
SERBP1-208	ENST00000493607	TICAM2	Q86XR7	235 aa		28.01	■■■□□ 2.07
SERBP1-208	ENST00000493607	SMC5	Q8IY18	1101 aa		28.01	■■■□□ 2.07
SERBP1-208	ENST00000493607	OSBP2	Q969R2	916 aa		28.01	■■■□□ 2.07
SERBP1-208	ENST00000493607	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	28.01	■■■□□ 2.07
SERBP1-208	ENST00000493607	EMILIN3	Q9NT22	766 aa		28.01	■■■□□ 2.07
SERBP1-208	ENST00000493607	ARPP21	Q9UBL0	812 aa	Predicted RBP	28.01	■■■□□ 2.07
SERBP1-208	ENST00000493607	USP17L12	C9JPN9	530 aa		28	■■■□□ 2.07
SERBP1-208	ENST00000493607	USP17L21	D6R901	530 aa		28	■■■□□ 2.07
SERBP1-208	ENST00000493607	GNAT2	P19087	354 aa		28	■■■□□ 2.07
SERBP1-208	ENST00000493607	GUCY1A2	P33402	732 aa		28	■■■□□ 2.07
SERBP1-208	ENST00000493607	SBK1	Q52WX2	424 aa		28	■■■□□ 2.07
SERBP1-208	ENST00000493607	GTF3C2	Q8WUA4	911 aa	Predicted RBP	28	■■■□□ 2.07
SERBP1-208	ENST00000493607	CCDC17	Q96LX7	622 aa		28	■■■□□ 2.07
SERBP1-208	ENST00000493607	MORF4L1	Q9UBU8	362 aa		28	■■■□□ 2.07
SERBP1-208	ENST00000493607	DOCK3	Q8IZD9	2030 aa		28	■■■□□ 2.07
SERBP1-208	ENST00000493607	KIAA0100	Q14667	2235 aa	Known RBP	28	■■■□□ 2.07
SERBP1-208	ENST00000493607	CYP2D6	P10635	497 aa		27.99	■■■□□ 2.07
SERBP1-208	ENST00000493607	IRX3	P78415	501 aa	Predicted RBP	27.99	■■■□□ 2.07
SERBP1-208	ENST00000493607	RAB3GAP1	Q15042	981 aa		27.99	■■■□□ 2.07
SERBP1-208	ENST00000493607	TMEM179	Q6ZVK1	233 aa		27.99	■■■□□ 2.07

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