RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492185.5

NELFE-211, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 2

Gene NELFE, Length 1,786 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-211ENST00000492185 OLFM4Q6UX06 510 aa23.16■■□□□ 1.3
NELFE-211ENST00000492185 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
NELFE-211ENST00000492185 KCNG4Q8TDN1 519 aa23.16■■□□□ 1.3
NELFE-211ENST00000492185 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa23.16■■□□□ 1.3
NELFE-211ENST00000492185 NUP133Q8WUM0 1156 aa23.16■■□□□ 1.3
NELFE-211ENST00000492185 CLIC4Q9Y696 253 aa23.16■■□□□ 1.3
NELFE-211ENST00000492185 GTF2IP78347 998 aa23.15■■□□□ 1.3
NELFE-211ENST00000492185 TRIM29Q14134 588 aa23.15■■□□□ 1.3
NELFE-211ENST00000492185 UVSSAQ2YD98 709 aa23.15■■□□□ 1.3
NELFE-211ENST00000492185 ENGASEQ8NFI3 743 aa23.15■■□□□ 1.3
NELFE-211ENST00000492185 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP23.15■■□□□ 1.3
NELFE-211ENST00000492185 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
NELFE-211ENST00000492185 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa23.15■■□□□ 1.3
NELFE-211ENST00000492185 MMP1P03956 469 aa23.14■■□□□ 1.3
NELFE-211ENST00000492185 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.3
NELFE-211ENST00000492185 ANO1Q5XXA6 986 aa23.14■■□□□ 1.3
NELFE-211ENST00000492185 ADALQ6DHV7 355 aa23.14■■□□□ 1.3
NELFE-211ENST00000492185 C2CD5Q86YS7 1000 aa23.14■■□□□ 1.3
NELFE-211ENST00000492185 PCDHA7Q9UN72 937 aa23.14■■□□□ 1.3
NELFE-211ENST00000492185 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
NELFE-211ENST00000492185 FAM47AQ5JRC9 791 aa23.14■■□□□ 1.29
NELFE-211ENST00000492185 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
NELFE-211ENST00000492185 AMOTL1Q8IY63 956 aa23.14■■□□□ 1.29
NELFE-211ENST00000492185 TEX11Q8IYF3 940 aa23.14■■□□□ 1.29
NELFE-211ENST00000492185 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
NELFE-211ENST00000492185 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa23.14■■□□□ 1.29
NELFE-211ENST00000492185 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa23.14■■□□□ 1.29
NELFE-211ENST00000492185 SNED1Q8TER0 1413 aa23.13■■□□□ 1.29
NELFE-211ENST00000492185 RIMBP2O15034 1052 aa23.13■■□□□ 1.29
NELFE-211ENST00000492185 NMT2O60551 498 aa23.13■■□□□ 1.29
NELFE-211ENST00000492185 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
NELFE-211ENST00000492185 CCDC178Q5BJE1 867 aa23.13■■□□□ 1.29
NELFE-211ENST00000492185 TMTC3Q6ZXV5 915 aa23.13■■□□□ 1.29
NELFE-211ENST00000492185 DGKHQ86XP1 1220 aa23.13■■□□□ 1.29
NELFE-211ENST00000492185 CERS5Q8N5B7 392 aa23.13■■□□□ 1.29
NELFE-211ENST00000492185 DYNLL2Q96FJ2 89 aa23.13■■□□□ 1.29
NELFE-211ENST00000492185 MAP3K14Q99558 947 aa23.13■■□□□ 1.29
NELFE-211ENST00000492185 TNMDQ9H2S6 317 aa23.13■■□□□ 1.29
NELFE-211ENST00000492185 FLT1P17948 1338 aa23.13■■□□□ 1.29
NELFE-211ENST00000492185 SPTLC2O15270 562 aa23.12■■□□□ 1.29
NELFE-211ENST00000492185 ME1P48163 572 aa23.12■■□□□ 1.29
NELFE-211ENST00000492185 SLC39A14Q15043 492 aa23.12■■□□□ 1.29
NELFE-211ENST00000492185 STK38Q15208 465 aa23.12■■□□□ 1.29
NELFE-211ENST00000492185 PKN1Q16512 942 aa23.12■■□□□ 1.29
NELFE-211ENST00000492185 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa23.12■■□□□ 1.29
NELFE-211ENST00000492185 EYA3Q99504 573 aa23.12■■□□□ 1.29
NELFE-211ENST00000492185 IL17RBQ9NRM6 502 aa23.12■■□□□ 1.29
NELFE-211ENST00000492185 STK32BQ9NY57 414 aa23.12■■□□□ 1.29
NELFE-211ENST00000492185 TSPY2A6NKD2 308 aa23.12■■□□□ 1.29
NELFE-211ENST00000492185 PLCD1P51178 756 aa23.12■■□□□ 1.29
NELFE-211ENST00000492185 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
NELFE-211ENST00000492185 C16orf86Q6ZW13 317 aa23.12■■□□□ 1.29
NELFE-211ENST00000492185 RNF214Q8ND24 703 aa23.12■■□□□ 1.29
NELFE-211ENST00000492185 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
NELFE-211ENST00000492185 H0YIN7 160 aa23.11■■□□□ 1.29
NELFE-211ENST00000492185 CCDC192P0DO97 292 aa23.11■■□□□ 1.29
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NELFE-211ENST00000492185 FAM160A1Q05DH4 1040 aa23.11■■□□□ 1.29
NELFE-211ENST00000492185 PTPAQ15257 358 aa23.11■■□□□ 1.29
NELFE-211ENST00000492185 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
NELFE-211ENST00000492185 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
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NELFE-211ENST00000492185 PLEKHA8P1O95397 391 aa23.1■■□□□ 1.29
NELFE-211ENST00000492185 RASA1P20936 1047 aa23.1■■□□□ 1.29
NELFE-211ENST00000492185 NOSTRINQ8IVI9 506 aa23.1■■□□□ 1.29
NELFE-211ENST00000492185 SHISA4Q96DD7 197 aa23.1■■□□□ 1.29
NELFE-211ENST00000492185 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
NELFE-211ENST00000492185 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa23.1■■□□□ 1.29
NELFE-211ENST00000492185 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa23.09■■□□□ 1.29
NELFE-211ENST00000492185 FSIP1Q8NA03 581 aa23.09■■□□□ 1.29
NELFE-211ENST00000492185 C7orf43Q8WVR3 580 aa23.09■■□□□ 1.29
NELFE-211ENST00000492185 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
NELFE-211ENST00000492185 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP23.09■■□□□ 1.295e-7■□□□□ 9.9
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NELFE-211ENST00000492185 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
NELFE-211ENST00000492185 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP23.09■■□□□ 1.29
NELFE-211ENST00000492185 CAMK4Q16566 473 aa23.09■■□□□ 1.29
NELFE-211ENST00000492185 PODNQ7Z5L7 613 aa23.09■■□□□ 1.29
NELFE-211ENST00000492185 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
NELFE-211ENST00000492185 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
NELFE-211ENST00000492185 ZNF287Q9HBT7 754 aa23.09■■□□□ 1.29
NELFE-211ENST00000492185 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa23.08■■□□□ 1.29
NELFE-211ENST00000492185 PPP6R2O75170 966 aa23.08■■□□□ 1.29
NELFE-211ENST00000492185 TYRO3Q06418 890 aa23.08■■□□□ 1.29
NELFE-211ENST00000492185 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
NELFE-211ENST00000492185 CNKSR1Q969H4 720 aa23.08■■□□□ 1.29
NELFE-211ENST00000492185 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
NELFE-211ENST00000492185 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
NELFE-211ENST00000492185 BTBD18B2RXH4 712 aa23.07■■□□□ 1.28
NELFE-211ENST00000492185 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
NELFE-211ENST00000492185 DOK7Q18PE1 504 aa23.07■■□□□ 1.28
NELFE-211ENST00000492185 HHIPL2Q6UWX4 724 aa23.07■■□□□ 1.28
NELFE-211ENST00000492185 CCDC82Q8N4S0 544 aa23.07■■□□□ 1.28
NELFE-211ENST00000492185 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
NELFE-211ENST00000492185 SLC44A5Q8NCS7 719 aa23.07■■□□□ 1.28
NELFE-211ENST00000492185 MKNK2Q9HBH9 465 aa23.07■■□□□ 1.28
NELFE-211ENST00000492185 KCNJ14Q9UNX9 436 aa23.07■■□□□ 1.28
NELFE-211ENST00000492185 MRVI1Q9Y6F6 885 aa23.07■■□□□ 1.28
NELFE-211ENST00000492185 CDK8P49336 464 aa23.06■■□□□ 1.28
NELFE-211ENST00000492185 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
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