RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486679.2

MYCBP2-208, Transcript of MYC binding protein 2, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 3

Gene MYCBP2, Length 545 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MYCBP2-208	ENST00000486679	OXCT1	P55809	520 aa		7.57	□□□□□ -1.2
MYCBP2-208	ENST00000486679	PDE4B	Q07343	736 aa		7.57	□□□□□ -1.2
MYCBP2-208	ENST00000486679	AOC3	Q16853	763 aa		7.57	□□□□□ -1.2
MYCBP2-208	ENST00000486679	PHC3	Q8NDX5	983 aa		7.57	□□□□□ -1.2
MYCBP2-208	ENST00000486679	HRASLS5	Q96KN8	279 aa		7.57	□□□□□ -1.2
MYCBP2-208	ENST00000486679	DPH2	Q9BQC3	489 aa	Predicted RBP	7.57	□□□□□ -1.2
MYCBP2-208	ENST00000486679		U3KQE9	123 aa		7.57	□□□□□ -1.2
MYCBP2-208	ENST00000486679	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		7.56	□□□□□ -1.2
MYCBP2-208	ENST00000486679	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	7.56	□□□□□ -1.2
MYCBP2-208	ENST00000486679	RPL6	Q02878	288 aa	Known RBP	7.56	□□□□□ -1.2
MYCBP2-208	ENST00000486679	SNAP47	Q5SQN1	464 aa		7.56	□□□□□ -1.2
MYCBP2-208	ENST00000486679	PRAMEF13	Q5VWM6	474 aa		7.56	□□□□□ -1.2
MYCBP2-208	ENST00000486679	HEXIM2	Q96MH2	286 aa	Known RBP	7.56	□□□□□ -1.2
MYCBP2-208	ENST00000486679	MKNK2	Q9HBH9	465 aa		7.56	□□□□□ -1.2
MYCBP2-208	ENST00000486679	PAK6	Q9NQU5	681 aa	Predicted RBP	7.56	□□□□□ -1.2
MYCBP2-208	ENST00000486679	PF4	P02776	101 aa		7.55	□□□□□ -1.2
MYCBP2-208	ENST00000486679	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	7.55	□□□□□ -1.2
MYCBP2-208	ENST00000486679	CD96	P40200	585 aa		7.55	□□□□□ -1.2
MYCBP2-208	ENST00000486679	PRKCQ	Q04759	706 aa		7.55	□□□□□ -1.2
MYCBP2-208	ENST00000486679	FAM160A1	Q05DH4	1040 aa		7.55	□□□□□ -1.2
MYCBP2-208	ENST00000486679	CAMK2G	Q13555	558 aa	Predicted RBP	7.55	□□□□□ -1.2
MYCBP2-208	ENST00000486679	PWP1	Q13610	501 aa		7.55	□□□□□ -1.2
MYCBP2-208	ENST00000486679	SLBP	Q14493	270 aa	Known RBP eCLIP	7.55	□□□□□ -1.2
MYCBP2-208	ENST00000486679	BNC2	Q6ZN30	1099 aa	Predicted RBP	7.55	□□□□□ -1.2
MYCBP2-208	ENST00000486679	SPRED2	Q7Z698	418 aa		7.55	□□□□□ -1.2
MYCBP2-208	ENST00000486679	MFSD2A	Q8NA29	543 aa		7.55	□□□□□ -1.2
MYCBP2-208	ENST00000486679	GFRA2	O00451	464 aa		7.54	□□□□□ -1.2
MYCBP2-208	ENST00000486679	PAX4	O43316	350 aa		7.54	□□□□□ -1.2
MYCBP2-208	ENST00000486679	SLITRK5	O94991	958 aa		7.54	□□□□□ -1.2
MYCBP2-208	ENST00000486679	LETMD1	Q6P1Q0	360 aa		7.54	□□□□□ -1.2
MYCBP2-208	ENST00000486679	TMEM74	Q96NL1	305 aa		7.54	□□□□□ -1.2
MYCBP2-208	ENST00000486679	ADGRE2	Q9UHX3	823 aa		7.54	□□□□□ -1.2
MYCBP2-208	ENST00000486679	VAV3	Q9UKW4	847 aa		7.54	□□□□□ -1.2
MYCBP2-208	ENST00000486679	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	7.54	□□□□□ -1.2
MYCBP2-208	ENST00000486679	RBM47	A0AV96	593 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
MYCBP2-208	ENST00000486679	IGF2BP3	O00425	579 aa	Known RBP eCLIP	7.53	□□□□□ -1.2
MYCBP2-208	ENST00000486679	CBX7	O95931	251 aa		7.53	□□□□□ -1.2
MYCBP2-208	ENST00000486679	EOMES	O95936	686 aa		7.53	□□□□□ -1.2
MYCBP2-208	ENST00000486679	CD8B	P10966	210 aa		7.53	□□□□□ -1.2
MYCBP2-208	ENST00000486679	PLCG1	P19174	1290 aa		7.53	□□□□□ -1.2
MYCBP2-208	ENST00000486679	SFRP5	Q5T4F7	317 aa		7.53	□□□□□ -1.2
MYCBP2-208	ENST00000486679	ZNF746	Q6NUN9	644 aa	Predicted RBP	7.53	□□□□□ -1.2
MYCBP2-208	ENST00000486679	NFXL1	Q6ZNB6	911 aa		7.53	□□□□□ -1.2
MYCBP2-208	ENST00000486679	TMEM87B	Q96K49	555 aa		7.53	□□□□□ -1.2
MYCBP2-208	ENST00000486679	PLAGL2	Q9UPG8	496 aa		7.53	□□□□□ -1.2
MYCBP2-208	ENST00000486679	MAPK8IP1	Q9UQF2	711 aa		7.53	□□□□□ -1.2
MYCBP2-208	ENST00000486679	F13A1	P00488	732 aa		7.52	□□□□□ -1.21
MYCBP2-208	ENST00000486679	CST3	P01034	146 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
MYCBP2-208	ENST00000486679	CYP7A1	P22680	504 aa		7.52	□□□□□ -1.21
MYCBP2-208	ENST00000486679	LMNB2	Q03252	620 aa		7.52	□□□□□ -1.21
MYCBP2-208	ENST00000486679	IKZF1	Q13422	519 aa		7.52	□□□□□ -1.21
MYCBP2-208	ENST00000486679	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.21
MYCBP2-208	ENST00000486679	CDKAL1	Q5VV42	579 aa		7.52	□□□□□ -1.21
MYCBP2-208	ENST00000486679	GOLM1	Q8NBJ4	401 aa		7.52	□□□□□ -1.21
MYCBP2-208	ENST00000486679	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		7.52	□□□□□ -1.21
MYCBP2-208	ENST00000486679	KBTBD4	Q9NVX7	518 aa		7.52	□□□□□ -1.21
MYCBP2-208	ENST00000486679	TJP2	Q9UDY2	1190 aa		7.52	□□□□□ -1.21
MYCBP2-208	ENST00000486679	TACC3	Q9Y6A5	838 aa		7.52	□□□□□ -1.21
MYCBP2-208	ENST00000486679	CDH24	Q86UP0	819 aa		7.51	□□□□□ -1.21
MYCBP2-208	ENST00000486679	CCDC84	Q86UT8	332 aa	Predicted RBP	7.51	□□□□□ -1.21
MYCBP2-208	ENST00000486679	MFSD4A	Q8N468	514 aa		7.51	□□□□□ -1.21
MYCBP2-208	ENST00000486679	FAM13C	Q8NE31	585 aa		7.51	□□□□□ -1.21
MYCBP2-208	ENST00000486679	RIN3	Q8TB24	985 aa		7.51	□□□□□ -1.21
MYCBP2-208	ENST00000486679	ASB11	Q8WXH4	323 aa		7.51	□□□□□ -1.21
MYCBP2-208	ENST00000486679	GATAD2B	Q8WXI9	593 aa		7.51	□□□□□ -1.21
MYCBP2-208	ENST00000486679	RSRP1	Q9BUV0	290 aa		7.51	□□□□□ -1.21
MYCBP2-208	ENST00000486679	GGT7	Q9UJ14	662 aa		7.51	□□□□□ -1.21
MYCBP2-208	ENST00000486679	CORIN	Q9Y5Q5	1042 aa		7.51	□□□□□ -1.21
MYCBP2-208	ENST00000486679	SNX11	Q9Y5W9	270 aa		7.51	□□□□□ -1.21
MYCBP2-208	ENST00000486679	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
MYCBP2-208	ENST00000486679	GRIN3B	O60391	1043 aa		7.5	□□□□□ -1.21
MYCBP2-208	ENST00000486679	CAP2	P40123	477 aa		7.5	□□□□□ -1.21
MYCBP2-208	ENST00000486679	ZNF792	Q3KQV3	632 aa		7.5	□□□□□ -1.21
MYCBP2-208	ENST00000486679	SLC6A19	Q695T7	634 aa		7.5	□□□□□ -1.21
MYCBP2-208	ENST00000486679	FAM214B	Q7L5A3	538 aa		7.5	□□□□□ -1.21
MYCBP2-208	ENST00000486679	SPACA3	Q8IXA5	215 aa		7.5	□□□□□ -1.21
MYCBP2-208	ENST00000486679	MRPL41	Q8IXM3	137 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
MYCBP2-208	ENST00000486679	KLHL3	Q9UH77	587 aa		7.5	□□□□□ -1.21
MYCBP2-208	ENST00000486679	PRR33	A8MZF0	331 aa		7.49	□□□□□ -1.21
MYCBP2-208	ENST00000486679	CILP	O75339	1184 aa		7.49	□□□□□ -1.21
MYCBP2-208	ENST00000486679	ETV3	P41162	512 aa		7.49	□□□□□ -1.21
MYCBP2-208	ENST00000486679	CLCN7	P51798	805 aa		7.49	□□□□□ -1.21
MYCBP2-208	ENST00000486679	YARS	P54577	528 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
MYCBP2-208	ENST00000486679	CHMP4BP1	P59074	171 aa		7.49	□□□□□ -1.21
MYCBP2-208	ENST00000486679	NKPD1	Q17RQ9	610 aa		7.49	□□□□□ -1.21
MYCBP2-208	ENST00000486679	HS2ST1	Q7LGA3	356 aa		7.49	□□□□□ -1.21
MYCBP2-208	ENST00000486679	ACSF2	Q96CM8	615 aa	Predicted RBP	7.49	□□□□□ -1.21
MYCBP2-208	ENST00000486679	RHOV	Q96L33	236 aa		7.49	□□□□□ -1.21
MYCBP2-208	ENST00000486679	RC3H2	Q9HBD1	1191 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
MYCBP2-208	ENST00000486679	COPRS	Q9NQ92	184 aa		7.49	□□□□□ -1.21
MYCBP2-208	ENST00000486679	USP35	Q9P2H5	1018 aa		7.49	□□□□□ -1.21
MYCBP2-208	ENST00000486679	ADAM30	Q9UKF2	790 aa		7.49	□□□□□ -1.21
MYCBP2-208	ENST00000486679	RNF114	Q9Y508	228 aa		7.49	□□□□□ -1.21
MYCBP2-208	ENST00000486679		H3BS24	57 aa		7.48	□□□□□ -1.21
MYCBP2-208	ENST00000486679	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
MYCBP2-208	ENST00000486679	FUT4	P22083	530 aa		7.48	□□□□□ -1.21
MYCBP2-208	ENST00000486679	TNNI2	P48788	182 aa		7.48	□□□□□ -1.21
MYCBP2-208	ENST00000486679	ZP2	Q05996	745 aa		7.48	□□□□□ -1.21
MYCBP2-208	ENST00000486679	MCAT	Q8IVS2	390 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
MYCBP2-208	ENST00000486679	TMEM87A	Q8NBN3	555 aa		7.48	□□□□□ -1.21

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms