RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484135.1

PTPRC-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-211ENST00000484135 FAM181AQ8N9Y4 354 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRC-211ENST00000484135 DUSP23Q9BVJ7 150 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRC-211ENST00000484135 RNF19AQ9NV58 838 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRC-211ENST00000484135 AK5Q9Y6K8 562 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRC-211ENST00000484135 ARHGEF11O15085 1522 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRC-211ENST00000484135 NPAS4Q8IUM7 802 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRC-211ENST00000484135 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRC-211ENST00000484135 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRC-211ENST00000484135 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRC-211ENST00000484135 PLB1Q6P1J6 1458 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRC-211ENST00000484135 VPS8Q8N3P4 1428 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRC-211ENST00000484135 FANCGO15287 622 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRC-211ENST00000484135 C8AP07357 584 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRC-211ENST00000484135 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PTPRC-211ENST00000484135 PSMD2Q13200 908 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRC-211ENST00000484135 MAP3K11Q16584 847 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRC-211ENST00000484135 ZBTB37Q5TC79 503 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRC-211ENST00000484135 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PTPRC-211ENST00000484135 AGBL5Q8NDL9 886 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRC-211ENST00000484135 NETO1Q8TDF5 533 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRC-211ENST00000484135 PARP2Q9UGN5 583 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRC-211ENST00000484135 SLC5A6Q9Y289 635 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRC-211ENST00000484135 ITIH2P19823 946 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRC-211ENST00000484135 LRFN4Q6PJG9 635 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRC-211ENST00000484135 HDXQ7Z353 690 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRC-211ENST00000484135 UBE3DQ7Z6J8 389 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRC-211ENST00000484135 STK11IPQ8N1F8 1099 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRC-211ENST00000484135 POU5F2Q8N7G0 328 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRC-211ENST00000484135 KCT2Q8NC54 265 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRC-211ENST00000484135 GAL3ST3Q96A11 431 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRC-211ENST00000484135 PLPPR2Q96GM1 343 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRC-211ENST00000484135 FMN1Q68DA7 1419 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRC-211ENST00000484135 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
PTPRC-211ENST00000484135 CEACAM5P06731 702 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRC-211ENST00000484135 NTF4P34130 210 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRC-211ENST00000484135 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
PTPRC-211ENST00000484135 RING1Q06587 406 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRC-211ENST00000484135 INPP5AQ14642 412 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRC-211ENST00000484135 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
PTPRC-211ENST00000484135 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
PTPRC-211ENST00000484135 NFXL1Q6ZNB6 911 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRC-211ENST00000484135 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
PTPRC-211ENST00000484135 MISP3Q96FF7 219 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRC-211ENST00000484135 SEPT6Q14141 434 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRC-211ENST00000484135 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
PTPRC-211ENST00000484135 MEI1Q5TIA1 1274 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRC-211ENST00000484135 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF507Q8TCN5 953 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRC-211ENST00000484135 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
PTPRC-211ENST00000484135 PRDM10Q9NQV6 1147 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRC-211ENST00000484135 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRC-211ENST00000484135 U3KQE9 123 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRC-211ENST00000484135 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRC-211ENST00000484135 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRC-211ENST00000484135 LIG3P49916 1009 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRC-211ENST00000484135 ETF1P62495 437 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PTPRC-211ENST00000484135 RPS26P62854 115 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PTPRC-211ENST00000484135 DAB2P98082 770 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRC-211ENST00000484135 BNIP3Q12983 259 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRC-211ENST00000484135 PLCL1Q15111 1095 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRC-211ENST00000484135 CCDC27Q2M243 656 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRC-211ENST00000484135 ARMCX6Q7L4S7 300 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRC-211ENST00000484135 FAM161BQ96MY7 647 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRC-211ENST00000484135 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PTPRC-211ENST00000484135 MKNK2Q9HBH9 465 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRC-211ENST00000484135 UACAQ9BZF9 1416 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRC-211ENST00000484135 ABCA8O94911 1581 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRC-211ENST00000484135 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRC-211ENST00000484135 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PTPRC-211ENST00000484135 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
PTPRC-211ENST00000484135 LRIG2O94898 1065 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRC-211ENST00000484135 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
PTPRC-211ENST00000484135 OXCT1P55809 520 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRC-211ENST00000484135 CYFIP1Q7L576 1253 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRC-211ENST00000484135 HRASLS5Q96KN8 279 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRC-211ENST00000484135 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRC-211ENST00000484135 MRS2Q9HD23 443 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRC-211ENST00000484135 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRC-211ENST00000484135 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRC-211ENST00000484135 CDK8P49336 464 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRC-211ENST00000484135 PRKCQQ04759 706 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRC-211ENST00000484135 TMC4Q7Z404 712 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRC-211ENST00000484135 WNT10AQ9GZT5 417 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRC-211ENST00000484135 FBRSQ9HAH7 460 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRC-211ENST00000484135 PODXL2Q9NZ53 605 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRC-211ENST00000484135 ADCY10Q96PN6 1610 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRC-211ENST00000484135 ATP10BO94823 1461 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRC-211ENST00000484135 FYCO1Q9BQS8 1478 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRC-211ENST00000484135 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
PTPRC-211ENST00000484135 HECW1Q76N89 1606 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM265A0A087WTH1 108 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRC-211ENST00000484135 GNAT3A8MTJ3 354 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRC-211ENST00000484135 RLBP1P12271 317 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRC-211ENST00000484135 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
PTPRC-211ENST00000484135 AOC3Q16853 763 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRC-211ENST00000484135 AGMOQ6ZNB7 445 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRC-211ENST00000484135 SPRED2Q7Z698 418 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRC-211ENST00000484135 FBXO33Q7Z6M2 555 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRC-211ENST00000484135 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
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