RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 MYSM1Q5VVJ2 828 aa18.4■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 LRRC31Q6UY01 552 aa18.4■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 CAGE1Q8TC20 777 aa18.4■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa18.4■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 CUTAO60888 179 aa18.4■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 MAP2K2P36507 400 aa18.4■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 ANTXR2P58335 489 aa18.4■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 MAGEB6Q8N7X4 407 aa18.4■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa18.4■□□□□ 0.54
CCSAP-204ENST00000483092 COBLO75128 1261 aa18.39■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 FBXW10Q5XX13 1052 aa18.39■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 TBC1D10CQ8IV04 446 aa18.39■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 ARMT1Q9H993 441 aa18.39■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 RTEL1Q9NZ71 1219 aa18.39■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 MRC1P22897 1456 aa18.39■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa18.39■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 FOXN1O15353 648 aa18.39■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 SLC35F6Q8N357 371 aa18.39■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 ABCF2Q9UG63 623 aa18.39■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa18.39■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 DCCP43146 1447 aa18.38■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa18.38■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 PRKAB2O43741 272 aa18.38■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 CCDC24Q8N4L8 307 aa18.38■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 GBP3Q9H0R5 595 aa18.38■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 BRMS1Q9HCU9 246 aa18.38■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP18.38■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 EBAG9O00559 213 aa18.38■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 ATP6V1AP38606 617 aa18.38■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 NCAPH2Q6IBW4 605 aa18.38■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 CYB5R4Q7L1T6 521 aa18.38■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 CDC23Q9UJX2 597 aa18.38■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 SAMM50Q9Y512 469 aa18.38■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 PDE8BO95263 885 aa18.37■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 TADA2BQ86TJ2 420 aa18.37■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 POLD4Q9HCU8 107 aa18.37■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 UBN2Q6ZU65 1347 aa18.37■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 KCPQ6ZWJ8 1503 aa18.37■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 CSF1RP07333 972 aa18.37■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 BCAMP50895 628 aa18.37■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 KCND1Q9NSA2 647 aa18.37■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 GUCA1BQ9UMX6 200 aa18.37■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 MBD4O95243 580 aa18.37■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa18.37■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 PSD3Q9NYI0 1048 aa18.37■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 KIF28PB7ZC32 967 aa18.36■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 ENC1O14682 589 aa18.36■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 STX10O60499 249 aa18.36■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 PDE6AP16499 860 aa18.36■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 CORO7P57737 925 aa18.36■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 YY1AP1Q9H869 796 aa18.36■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP18.36■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa18.36■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 SUSD4Q5VX71 490 aa18.36■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa18.36■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 ACRBPQ8NEB7 543 aa18.36■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 FAM107BQ9H098 131 aa18.36■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa18.36■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 A0A1W2PQ27 194 aa18.36■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 A0A1W2PQ64 194 aa18.36■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 A0A1W2PQD8 194 aa18.36■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 POTEB2H3BUK9 544 aa18.36■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 ADD2P35612 726 aa18.36■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 MCTP2Q6DN12 878 aa18.36■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 JMYQ8N9B5 988 aa18.36■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 CCDC148Q8NFR7 591 aa18.36■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 NAPBQ9H115 298 aa18.36■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 HPS5Q9UPZ3 1129 aa18.36■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 KCNJ6P48051 423 aa18.35■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 IGSF22Q8N9C0 903 aa18.35■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 FAM71BQ8TC56 605 aa18.35■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 ALG1Q9BT22 464 aa18.35■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 IKBKBO14920 756 aa18.35■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 PDE8AO60658 829 aa18.35■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 PDE4BQ07343 736 aa18.35■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 TRIM29Q14134 588 aa18.35■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 NUP133Q8WUM0 1156 aa18.35■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 UBXN6Q9BZV1 441 aa18.35■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 RFX7Q2KHR2 1363 aa18.35■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 ATL3Q6DD88 541 aa18.35■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 MINDY4BA8MYZ0 360 aa18.34■□□□□ 0.53
CCSAP-204ENST00000483092 PPFIA4O75335 1185 aa18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms