RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482785.1

SHQ1-208, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 3

Gene SHQ1, Length 502 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-208ENST00000482785 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 LRRC37A2A6NM11 1700 aa5.26□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 HECTD1Q9ULT8 2610 aa5.25□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 SHTN1A0MZ66 631 aa5.25□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 TMEM229AB2RXF0 380 aa5.25□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 FZD6O60353 706 aa5.25□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 EGFRP00533 1210 aa5.25□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 CCL5P13501 91 aa5.25□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 MAPK8P45983 427 aa5.25□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 FANCCQ00597 558 aa5.25□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 SP3Q02447 781 aa5.25□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 SREBF2Q12772 1141 aa5.25□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 PSMD2Q13200 908 aa5.25□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 PLA2G2CQ5R387 149 aa5.25□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 ASCL5Q7RTU5 278 aa5.25□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 STAG2Q8N3U4 1231 aa5.25□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 FAM129BQ96TA1 746 aa5.25□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 TINF2Q9BSI4 451 aa5.25□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 CCSER2Q9H7U1 834 aa5.25□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 STIM2Q9P246 746 aa5.25□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 ASAP1Q9ULH1 1129 aa5.25□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 DMDP11532 3685 aa5.25□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 NBEAQ8NFP9 2946 aa5.25□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 CHD9Q3L8U1 2897 aa5.25□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 RGPD2P0DJD1 1756 aa5.24□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa5.24□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 NFAT5O94916 1531 aa5.24□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 RNF223E7ERA6 249 aa5.24□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 ALDH1A1P00352 501 aa5.24□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 IGHA2P01877 340 aa5.24□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 ZNF76P36508 570 aa5.24□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 EPHA4P54764 986 aa5.24□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 AAMPQ13685 434 aa5.24□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 PRKG1Q13976 671 aa5.24□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 GIMAP6Q6P9H5 292 aa5.24□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa5.24□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 CNKSR1Q969H4 720 aa5.24□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 RMDN1Q96DB5 314 aa5.24□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 SLC4A9Q96Q91 983 aa5.24□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 RNF208Q9H0X6 261 aa5.24□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 VTI1BQ9UEU0 232 aa5.24□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa5.24□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 UBE2Q2LH0YL09 131 aa5.23□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 ATP2B1P20020 1258 aa5.23□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 SCTRP47872 440 aa5.23□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP5.23□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 GDF10P55107 478 aa5.23□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 ERVK-9P63128 1117 aa5.23□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 TCF15Q12870 199 aa5.23□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 CRHR2Q13324 411 aa5.23□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 PDE3AQ14432 1141 aa5.23□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 AKNAD1Q5T1N1 836 aa5.23□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 USPL1Q5W0Q7 1092 aa5.23□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 ALG1LQ6GMV1 187 aa5.23□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 SAP130Q9H0E3 1048 aa5.23□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP5.23□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 NUP155O75694 1391 aa5.23□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa5.23□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 TEX15Q9BXT5 2789 aa5.23□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 CFAP46Q8IYW2 2715 aa5.23□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 TAF1P21675 1872 aa5.22□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 ANKRD62A6NC57 917 aa5.22□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP5.22□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 GPR182O15218 404 aa5.22□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP5.22□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 CAMTA2O94983 1202 aa5.22□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 SGPL1O95470 568 aa5.22□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 INHAP05111 366 aa5.22□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 USP5P45974 858 aa5.22□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa5.22□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 PPP1R18Q6NYC8 613 aa5.22□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 HFE2Q6ZVN8 426 aa5.22□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 KCNH5Q8NCM2 988 aa5.22□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 GMLQ99445 158 aa5.22□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 CAPN10Q9HC96 672 aa5.22□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa5.22□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 PIK3C2GO75747 1445 aa5.22□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 CHD7Q9P2D1 2997 aa5.22□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 BRWD1Q9NSI6 2320 aa5.22□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 COL4A3Q01955 1670 aa5.21□□□□□ -1.57
SHQ1-208ENST00000482785 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
SHQ1-208ENST00000482785 A0A1W2PRU2 124 aa5.21□□□□□ -1.58
SHQ1-208ENST00000482785 ERVH48-1M5A8F1 160 aa5.21□□□□□ -1.58
SHQ1-208ENST00000482785 TNFRSF10BO14763 440 aa5.21□□□□□ -1.58
SHQ1-208ENST00000482785 GNA15P30679 374 aa5.21□□□□□ -1.58
SHQ1-208ENST00000482785 PDE6BP35913 854 aa5.21□□□□□ -1.58
SHQ1-208ENST00000482785 SH3BP2P78314 561 aa5.21□□□□□ -1.58
SHQ1-208ENST00000482785 SHHQ15465 462 aa5.21□□□□□ -1.58
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