RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482333.5

USP13-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 13, humanhuman

TSL 5

Gene USP13, Length 1,966 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13-202ENST00000482333 TAOK2Q9UL54 1235 aa25.29■■□□□ 1.64
USP13-202ENST00000482333 FOCADQ5VW36 1801 aa25.28■■□□□ 1.64
USP13-202ENST00000482333 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa25.28■■□□□ 1.64
USP13-202ENST00000482333 G3V3G9 751 aa25.28■■□□□ 1.64
USP13-202ENST00000482333 DCAF8Q5TAQ9 597 aa25.28■■□□□ 1.64
USP13-202ENST00000482333 SLC44A5Q8NCS7 719 aa25.28■■□□□ 1.64
USP13-202ENST00000482333 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
USP13-202ENST00000482333 TFAP4Q01664 338 aa25.27■■□□□ 1.64
USP13-202ENST00000482333 PPP2R5BQ15173 497 aa25.27■■□□□ 1.64
USP13-202ENST00000482333 RCSD1Q6JBY9 416 aa25.27■■□□□ 1.64
USP13-202ENST00000482333 TRIM22Q8IYM9 498 aa25.27■■□□□ 1.64
USP13-202ENST00000482333 MYH1P12882 1939 aa25.27■■□□□ 1.64
USP13-202ENST00000482333 MYSM1Q5VVJ2 828 aa25.27■■□□□ 1.64
USP13-202ENST00000482333 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa25.26■■□□□ 1.63
USP13-202ENST00000482333 DDAH1O94760 285 aa25.26■■□□□ 1.63
USP13-202ENST00000482333 PODNQ7Z5L7 613 aa25.26■■□□□ 1.63
USP13-202ENST00000482333 WASF1Q92558 559 aa25.26■■□□□ 1.63
USP13-202ENST00000482333 MKNK2Q9HBH9 465 aa25.26■■□□□ 1.63
USP13-202ENST00000482333 IL17RBQ9NRM6 502 aa25.26■■□□□ 1.63
USP13-202ENST00000482333 RTEL1Q9NZ71 1219 aa25.26■■□□□ 1.63
USP13-202ENST00000482333 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
USP13-202ENST00000482333 SNED1Q8TER0 1413 aa25.26■■□□□ 1.63
USP13-202ENST00000482333 FUT2Q10981 343 aa25.25■■□□□ 1.63
USP13-202ENST00000482333 SCN9AQ15858 1988 aa25.25■■□□□ 1.63
USP13-202ENST00000482333 MYH6P13533 1939 aa25.25■■□□□ 1.63
USP13-202ENST00000482333 CALM1P0DP23 149 aa25.25■■□□□ 1.63
USP13-202ENST00000482333 CALM2P0DP24 149 aa25.25■■□□□ 1.63
USP13-202ENST00000482333 CALM3P0DP25 149 aa25.25■■□□□ 1.63
USP13-202ENST00000482333 TRIM29Q14134 588 aa25.25■■□□□ 1.63
USP13-202ENST00000482333 C10orf71Q711Q0 1435 aa25.25■■□□□ 1.63
USP13-202ENST00000482333 PLEKHA8P1O95397 391 aa25.24■■□□□ 1.63
USP13-202ENST00000482333 DEXIO95424 95 aa25.24■■□□□ 1.63
USP13-202ENST00000482333 NASPP49321 788 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
USP13-202ENST00000482333 NT5C2P49902 561 aa25.24■■□□□ 1.63
USP13-202ENST00000482333 SCNN1DP51172 638 aa25.24■■□□□ 1.63
USP13-202ENST00000482333 TSPY26PQ9H489 355 aa25.24■■□□□ 1.63
USP13-202ENST00000482333 CLIC4Q9Y696 253 aa25.24■■□□□ 1.63
USP13-202ENST00000482333 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
USP13-202ENST00000482333 RASA1P20936 1047 aa25.24■■□□□ 1.63
USP13-202ENST00000482333 BICD2Q8TD16 824 aa25.24■■□□□ 1.63
USP13-202ENST00000482333 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
USP13-202ENST00000482333 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
USP13-202ENST00000482333 C16orf86Q6ZW13 317 aa25.23■■□□□ 1.63
USP13-202ENST00000482333 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
USP13-202ENST00000482333 DACT1Q9NYF0 836 aa25.23■■□□□ 1.63
USP13-202ENST00000482333 USP17L3A6NCW0 530 aa25.22■■□□□ 1.63
USP13-202ENST00000482333 USP17L4A6NCW7 530 aa25.22■■□□□ 1.63
USP13-202ENST00000482333 ECE2O60344 883 aa25.22■■□□□ 1.63
USP13-202ENST00000482333 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP25.22■■□□□ 1.637e-8■□□□□ 11
USP13-202ENST00000482333 USP17L1Q7RTZ2 530 aa25.22■■□□□ 1.63
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USP13-202ENST00000482333 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
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USP13-202ENST00000482333 KCNJ14Q9UNX9 436 aa25.22■■□□□ 1.63
USP13-202ENST00000482333 NR1I2O75469 434 aa25.21■■□□□ 1.63
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USP13-202ENST00000482333 TSPY8P0CW00 308 aa25.21■■□□□ 1.63
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USP13-202ENST00000482333 PKN1Q16512 942 aa25.2■■□□□ 1.63
USP13-202ENST00000482333 AOC3Q16853 763 aa25.2■■□□□ 1.63
USP13-202ENST00000482333 HHIPL2Q6UWX4 724 aa25.2■■□□□ 1.63
USP13-202ENST00000482333 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.63
USP13-202ENST00000482333 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa25.2■■□□□ 1.63
USP13-202ENST00000482333 ME1P48163 572 aa25.2■■□□□ 1.62
USP13-202ENST00000482333 PICALMQ13492 652 aa25.2■■□□□ 1.62
USP13-202ENST00000482333 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
USP13-202ENST00000482333 DACT2Q5SW24 774 aa25.2■■□□□ 1.62
USP13-202ENST00000482333 STRIP1Q5VSL9 837 aa25.2■■□□□ 1.62
USP13-202ENST00000482333 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
USP13-202ENST00000482333 SHISA4Q96DD7 197 aa25.2■■□□□ 1.62
USP13-202ENST00000482333 USP40Q9NVE5 1235 aa25.2■■□□□ 1.62
USP13-202ENST00000482333 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa25.19■■□□□ 1.62
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USP13-202ENST00000482333 C21orf2O43822 256 aa25.19■■□□□ 1.62
USP13-202ENST00000482333 YEATS4O95619 227 aa25.19■■□□□ 1.62
USP13-202ENST00000482333 ANO1Q5XXA6 986 aa25.19■■□□□ 1.62
USP13-202ENST00000482333 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
USP13-202ENST00000482333 TEKT1Q969V4 418 aa25.19■■□□□ 1.62
USP13-202ENST00000482333 NUP62CLQ9H1M0 184 aa25.19■■□□□ 1.62
USP13-202ENST00000482333 KAT14Q9H8E8 782 aa25.19■■□□□ 1.62
USP13-202ENST00000482333 ZNF287Q9HBT7 754 aa25.19■■□□□ 1.62
USP13-202ENST00000482333 PCDHA7Q9UN72 937 aa25.19■■□□□ 1.62
USP13-202ENST00000482333 STK38Q15208 465 aa25.18■■□□□ 1.62
USP13-202ENST00000482333 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa25.18■■□□□ 1.62
USP13-202ENST00000482333 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa25.18■■□□□ 1.62
USP13-202ENST00000482333 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
USP13-202ENST00000482333 FUCA2Q9BTY2 467 aa25.18■■□□□ 1.62
USP13-202ENST00000482333 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa25.18■■□□□ 1.62
USP13-202ENST00000482333 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
USP13-202ENST00000482333 V9GY48 417 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
USP13-202ENST00000482333 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa25.18■■□□□ 1.62
USP13-202ENST00000482333 BTBD18B2RXH4 712 aa25.18■■□□□ 1.62
USP13-202ENST00000482333 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
USP13-202ENST00000482333 KIAA2012Q0VF49 1180 aa25.18■■□□□ 1.62
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