RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480420.5

CTPS1-209, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 750 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-209ENST00000480420 PPP4CP60510 307 aa9.8□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP9.8□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 RAB3GAP1Q15042 981 aa9.8□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 MTFR1Q15390 333 aa9.8□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa9.8□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF333Q96JL9 665 aa9.8□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 BOLA2Q9H3K6 86 aa9.8□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 PNMA3Q9UL41 463 aa9.8□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 GABRQQ9UN88 632 aa9.8□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa9.8□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 DOCK3Q8IZD9 2030 aa9.8□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 MYH8P13535 1937 aa9.8□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 SIPA1L1O43166 1804 aa9.79□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 SZT2Q5T011 3432 aa9.79□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 NAV1Q8NEY1 1877 aa9.79□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 ZBTB22O15209 634 aa9.79□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 ASNSP08243 561 aa9.79□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 ELNP15502 786 aa9.79□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 PRMT2P55345 433 aa9.79□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 MAP3K10Q02779 954 aa9.79□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 COA7Q96BR5 231 aa9.79□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 RNF208Q9H0X6 261 aa9.79□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa9.79□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF532Q9HCE3 1301 aa9.79□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 ADCY3O60266 1144 aa9.78□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 PEX10O60683 326 aa9.78□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 RAB11FIP3O75154 756 aa9.78□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 GH2P01242 217 aa9.78□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 BCRP11274 1271 aa9.78□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 PDE6AP16499 860 aa9.78□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 FLT3LGP49771 235 aa9.78□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 UBXN2AP68543 259 aa9.78□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 JAG1P78504 1218 aa9.78□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 WDR78Q5VTH9 848 aa9.78□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 TTC6Q86TZ1 520 aa9.78□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 SIRT2Q8IXJ6 389 aa9.78□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 PAGR1Q9BTK6 254 aa9.78□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 CABP5Q9NP86 173 aa9.78□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 MCM9Q9NXL9 1143 aa9.78□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa9.78□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 ADGRA2Q96PE1 1338 aa9.78□□□□□ -0.84
CTPS1-209ENST00000480420 USP17L10C9JJH3 530 aa9.77□□□□□ -0.85
CTPS1-209ENST00000480420 CCL5P13501 91 aa9.77□□□□□ -0.85
CTPS1-209ENST00000480420 BACE1P56817 501 aa9.77□□□□□ -0.85
CTPS1-209ENST00000480420 ABCB5Q2M3G0 1257 aa9.77□□□□□ -0.85
CTPS1-209ENST00000480420 SLFNL1Q499Z3 407 aa9.77□□□□□ -0.85
CTPS1-209ENST00000480420 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
CTPS1-209ENST00000480420 SDR42E1Q8WUS8 393 aa9.77□□□□□ -0.85
CTPS1-209ENST00000480420 DPF3Q92784 378 aa9.77□□□□□ -0.85
CTPS1-209ENST00000480420 LRRCC1Q9C099 1032 aa9.77□□□□□ -0.85
CTPS1-209ENST00000480420 DNAJC18Q9H819 358 aa9.77□□□□□ -0.85
CTPS1-209ENST00000480420 ARMT1Q9H993 441 aa9.77□□□□□ -0.85
CTPS1-209ENST00000480420 PAG1Q9NWQ8 432 aa9.77□□□□□ -0.85
CTPS1-209ENST00000480420 SERPINB13Q9UIV8 391 aa9.77□□□□□ -0.85
CTPS1-209ENST00000480420 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa9.77□□□□□ -0.85
CTPS1-209ENST00000480420 MYH7P12883 1935 aa9.77□□□□□ -0.85
CTPS1-209ENST00000480420 LOC285556D6RIA3 1793 aa9.77□□□□□ -0.85
CTPS1-209ENST00000480420 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
CTPS1-209ENST00000480420 RAD21O60216 631 aa9.76□□□□□ -0.85
CTPS1-209ENST00000480420 MBD4O95243 580 aa9.76□□□□□ -0.85
CTPS1-209ENST00000480420 TFRCP02786 760 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
CTPS1-209ENST00000480420 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
CTPS1-209ENST00000480420 PLCD1P51178 756 aa9.76□□□□□ -0.85
CTPS1-209ENST00000480420 CERS3Q8IU89 383 aa9.76□□□□□ -0.85
CTPS1-209ENST00000480420 STK11IPQ8N1F8 1099 aa9.76□□□□□ -0.85
CTPS1-209ENST00000480420 LCORLQ8N3X6 602 aa9.76□□□□□ -0.85
CTPS1-209ENST00000480420 SLAIN1Q8ND83 568 aa9.76□□□□□ -0.85
CTPS1-209ENST00000480420 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
CTPS1-209ENST00000480420 TBC1D2Q9BYX2 928 aa9.76□□□□□ -0.85
CTPS1-209ENST00000480420 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP9.76□□□□□ -0.854e-7■■■■□ 26.5
CTPS1-209ENST00000480420 UNC93B1Q9H1C4 597 aa9.76□□□□□ -0.85
CTPS1-209ENST00000480420 C19orf81C9J6K1 198 aa9.75□□□□□ -0.85
CTPS1-209ENST00000480420 PRKAB2O43741 272 aa9.75□□□□□ -0.85
CTPS1-209ENST00000480420 INHAP05111 366 aa9.75□□□□□ -0.85
CTPS1-209ENST00000480420 CYP2D6P10635 497 aa9.75□□□□□ -0.85
CTPS1-209ENST00000480420 CYP2B6P20813 491 aa9.75□□□□□ -0.85
CTPS1-209ENST00000480420 ATP2B2Q01814 1243 aa9.75□□□□□ -0.85
CTPS1-209ENST00000480420 FAM110CQ1W6H9 321 aa9.75□□□□□ -0.85
CTPS1-209ENST00000480420 TSHZ3Q63HK5 1081 aa9.75□□□□□ -0.85
CTPS1-209ENST00000480420 USP17L2Q6R6M4 530 aa9.75□□□□□ -0.85
CTPS1-209ENST00000480420 AMOTL1Q8IY63 956 aa9.75□□□□□ -0.85
CTPS1-209ENST00000480420 DDRGK1Q96HY6 314 aa9.75□□□□□ -0.85
CTPS1-209ENST00000480420 DEFB118Q96PH6 123 aa9.75□□□□□ -0.85
CTPS1-209ENST00000480420 WDR18Q9BV38 432 aa9.75□□□□□ -0.85
CTPS1-209ENST00000480420 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
CTPS1-209ENST00000480420 CHGBP05060 677 aa9.74□□□□□ -0.85
CTPS1-209ENST00000480420 HERVK_113P62684 666 aa9.74□□□□□ -0.85
CTPS1-209ENST00000480420 EVX2Q03828 476 aa9.74□□□□□ -0.85
CTPS1-209ENST00000480420 PDE3AQ14432 1141 aa9.74□□□□□ -0.85
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