RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479566.5

PRKCZ-216, Transcript of protein kinase C zeta, humanhuman

TSL 3

Gene PRKCZ, Length 501 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCZ-216ENST00000479566 TAOK2Q9UL54 1235 aa20.6■□□□□ 0.89
PRKCZ-216ENST00000479566 H0YGN5 161 aa20.59■□□□□ 0.89
PRKCZ-216ENST00000479566 ASNSP08243 561 aa20.59■□□□□ 0.89
PRKCZ-216ENST00000479566 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP20.59■□□□□ 0.89
PRKCZ-216ENST00000479566 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa20.59■□□□□ 0.89
PRKCZ-216ENST00000479566 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
PRKCZ-216ENST00000479566 MIGA1Q8NAN2 632 aa20.59■□□□□ 0.89
PRKCZ-216ENST00000479566 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
PRKCZ-216ENST00000479566 TRIM34Q9BYJ4 488 aa20.59■□□□□ 0.89
PRKCZ-216ENST00000479566 FRMPD3Q5JV73 1810 aa20.59■□□□□ 0.89
PRKCZ-216ENST00000479566 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
PRKCZ-216ENST00000479566 AACSQ86V21 672 aa20.58■□□□□ 0.89
PRKCZ-216ENST00000479566 MAGEB6Q8N7X4 407 aa20.58■□□□□ 0.89
PRKCZ-216ENST00000479566 PXYLP1Q8TE99 480 aa20.58■□□□□ 0.89
PRKCZ-216ENST00000479566 COA7Q96BR5 231 aa20.58■□□□□ 0.89
PRKCZ-216ENST00000479566 WDR18Q9BV38 432 aa20.58■□□□□ 0.89
PRKCZ-216ENST00000479566 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa20.58■□□□□ 0.89
PRKCZ-216ENST00000479566 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
PRKCZ-216ENST00000479566 IGSF3O75054 1194 aa20.57■□□□□ 0.88
PRKCZ-216ENST00000479566 HLA-DOAP06340 250 aa20.57■□□□□ 0.88
PRKCZ-216ENST00000479566 BACE1P56817 501 aa20.57■□□□□ 0.88
PRKCZ-216ENST00000479566 ANTXR1Q9H6X2 564 aa20.57■□□□□ 0.88
PRKCZ-216ENST00000479566 DDX19BQ9UMR2 479 aa20.57■□□□□ 0.88
PRKCZ-216ENST00000479566 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
PRKCZ-216ENST00000479566 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
PRKCZ-216ENST00000479566 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
PRKCZ-216ENST00000479566 PDE3AQ14432 1141 aa20.56■□□□□ 0.88
PRKCZ-216ENST00000479566 ERC1Q8IUD2 1116 aa20.56■□□□□ 0.88
PRKCZ-216ENST00000479566 TMOD4Q9NZQ9 345 aa20.56■□□□□ 0.88
PRKCZ-216ENST00000479566 COG6Q9Y2V7 657 aa20.56■□□□□ 0.88
PRKCZ-216ENST00000479566 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP20.55■□□□□ 0.88
PRKCZ-216ENST00000479566 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
PRKCZ-216ENST00000479566 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa20.55■□□□□ 0.88
PRKCZ-216ENST00000479566 PEX10O60683 326 aa20.54■□□□□ 0.88
PRKCZ-216ENST00000479566 USP5P45974 858 aa20.54■□□□□ 0.88
PRKCZ-216ENST00000479566 DPF3Q92784 378 aa20.54■□□□□ 0.88
PRKCZ-216ENST00000479566 DEFB118Q96PH6 123 aa20.54■□□□□ 0.88
PRKCZ-216ENST00000479566 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
PRKCZ-216ENST00000479566 MORF4L1Q9UBU8 362 aa20.54■□□□□ 0.88
PRKCZ-216ENST00000479566 LAMA3Q16787 3333 aa20.54■□□□□ 0.88
PRKCZ-216ENST00000479566 USP17L10C9JJH3 530 aa20.53■□□□□ 0.88
PRKCZ-216ENST00000479566 SGPL1O95470 568 aa20.53■□□□□ 0.88
PRKCZ-216ENST00000479566 MAP3K12Q12852 859 aa20.53■□□□□ 0.88
PRKCZ-216ENST00000479566 C20orf194Q5TEA3 1177 aa20.53■□□□□ 0.88
PRKCZ-216ENST00000479566 HTATIP2Q9BUP3 242 aa20.53■□□□□ 0.88
PRKCZ-216ENST00000479566 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
PRKCZ-216ENST00000479566 GINM1Q9NU53 330 aa20.53■□□□□ 0.88
PRKCZ-216ENST00000479566 DNAH12Q6ZR08 3092 aa20.52■□□□□ 0.88
PRKCZ-216ENST00000479566 GH2P01242 217 aa20.52■□□□□ 0.88
PRKCZ-216ENST00000479566 HMGCRP04035 888 aa20.52■□□□□ 0.88
PRKCZ-216ENST00000479566 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
PRKCZ-216ENST00000479566 HERVK_113P62684 666 aa20.52■□□□□ 0.88
PRKCZ-216ENST00000479566 CERS3Q8IU89 383 aa20.52■□□□□ 0.88
PRKCZ-216ENST00000479566 TXNRD2Q9NNW7 524 aa20.52■□□□□ 0.88
PRKCZ-216ENST00000479566 PARP14Q460N5 1801 aa20.51■□□□□ 0.87
PRKCZ-216ENST00000479566 A0A0G2JMZ2 1700 aa20.51■□□□□ 0.87
PRKCZ-216ENST00000479566 C19orf81C9J6K1 198 aa20.51■□□□□ 0.87
PRKCZ-216ENST00000479566 CHRDL2Q6WN34 429 aa20.51■□□□□ 0.87
PRKCZ-216ENST00000479566 RHPN1Q8TCX5 695 aa20.51■□□□□ 0.87
PRKCZ-216ENST00000479566 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
PRKCZ-216ENST00000479566 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP20.51■□□□□ 0.87
PRKCZ-216ENST00000479566 EHD4Q9H223 541 aa20.51■□□□□ 0.87
PRKCZ-216ENST00000479566 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa20.51■□□□□ 0.87
PRKCZ-216ENST00000479566 SERPINB13Q9UIV8 391 aa20.51■□□□□ 0.87
PRKCZ-216ENST00000479566 APBB1O00213 710 aa20.5■□□□□ 0.87
PRKCZ-216ENST00000479566 FEZ1Q99689 392 aa20.5■□□□□ 0.87
PRKCZ-216ENST00000479566 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
PRKCZ-216ENST00000479566 EMILIN3Q9NT22 766 aa20.5■□□□□ 0.87
PRKCZ-216ENST00000479566 GJD2Q9UKL4 321 aa20.5■□□□□ 0.87
PRKCZ-216ENST00000479566 RLFQ13129 1914 aa20.5■□□□□ 0.87
PRKCZ-216ENST00000479566 RRP1P56182 461 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
PRKCZ-216ENST00000479566 TRIM32Q13049 653 aa20.49■□□□□ 0.87
PRKCZ-216ENST00000479566 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
PRKCZ-216ENST00000479566 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa20.49■□□□□ 0.87
PRKCZ-216ENST00000479566 TATDN1Q6P1N9 297 aa20.49■□□□□ 0.87
PRKCZ-216ENST00000479566 TRIB2Q92519 343 aa20.49■□□□□ 0.87
PRKCZ-216ENST00000479566 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa20.49■□□□□ 0.87
PRKCZ-216ENST00000479566 TFRCP02786 760 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
PRKCZ-216ENST00000479566 PDE6AP16499 860 aa20.48■□□□□ 0.87
PRKCZ-216ENST00000479566 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
PRKCZ-216ENST00000479566 USP17L2Q6R6M4 530 aa20.48■□□□□ 0.87
PRKCZ-216ENST00000479566 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
PRKCZ-216ENST00000479566 KIF1BPQ96EK5 621 aa20.48■□□□□ 0.87
PRKCZ-216ENST00000479566 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa20.47■□□□□ 0.87
PRKCZ-216ENST00000479566 ERVK-9P63128 1117 aa20.47■□□□□ 0.87
PRKCZ-216ENST00000479566 ERVK-24P63145 666 aa20.47■□□□□ 0.87
PRKCZ-216ENST00000479566 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
PRKCZ-216ENST00000479566 POTEEQ6S8J3 1075 aa20.47■□□□□ 0.87
PRKCZ-216ENST00000479566 SIRT2Q8IXJ6 389 aa20.47■□□□□ 0.87
PRKCZ-216ENST00000479566 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
PRKCZ-216ENST00000479566 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa20.47■□□□□ 0.87
PRKCZ-216ENST00000479566 SOCS4Q8WXH5 440 aa20.47■□□□□ 0.87
PRKCZ-216ENST00000479566 C12orf42Q96LP6 360 aa20.47■□□□□ 0.87
PRKCZ-216ENST00000479566 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
PRKCZ-216ENST00000479566 PAGR1Q9BTK6 254 aa20.47■□□□□ 0.87
PRKCZ-216ENST00000479566 PORCNQ9H237 461 aa20.47■□□□□ 0.87
PRKCZ-216ENST00000479566 RBPJLQ9UBG7 517 aa20.47■□□□□ 0.87
PRKCZ-216ENST00000479566 GOLIM4O00461 696 aa20.46■□□□□ 0.87
PRKCZ-216ENST00000479566 CYP2B6P20813 491 aa20.46■□□□□ 0.87
PRKCZ-216ENST00000479566 SHMT1P34896 483 aa20.46■□□□□ 0.87
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