RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478087.5

HPS1-211, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene HPS1, Length 971 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-211ENST00000478087 TSHZ3Q63HK5 1081 aa15.79■□□□□ 0.12
HPS1-211ENST00000478087 LCORLQ8N3X6 602 aa15.79■□□□□ 0.12
HPS1-211ENST00000478087 SDR42E1Q8WUS8 393 aa15.79■□□□□ 0.12
HPS1-211ENST00000478087 ZNF333Q96JL9 665 aa15.79■□□□□ 0.12
HPS1-211ENST00000478087 DCTPP1Q9H773 170 aa15.79■□□□□ 0.12
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HPS1-211ENST00000478087 PAG1Q9NWQ8 432 aa15.79■□□□□ 0.12
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HPS1-211ENST00000478087 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa15.78■□□□□ 0.12
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HPS1-211ENST00000478087 TXNRD2Q9NNW7 524 aa15.72■□□□□ 0.11
HPS1-211ENST00000478087 PNMA3Q9UL41 463 aa15.72■□□□□ 0.11
HPS1-211ENST00000478087 CEP290O15078 2479 aa15.71■□□□□ 0.11
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HPS1-211ENST00000478087 Q3C1V9 767 aa15.71■□□□□ 0.11
HPS1-211ENST00000478087 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP15.71■□□□□ 0.114e-6■■□□□ 13.6
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HPS1-211ENST00000478087 USP17L21D6R901 530 aa15.7■□□□□ 0.1
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HPS1-211ENST00000478087 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
HPS1-211ENST00000478087 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP15.7■□□□□ 0.1
HPS1-211ENST00000478087 UBE3CQ15386 1083 aa15.7■□□□□ 0.1
HPS1-211ENST00000478087 FAM110CQ1W6H9 321 aa15.7■□□□□ 0.1
HPS1-211ENST00000478087 USP17L2Q6R6M4 530 aa15.7■□□□□ 0.1
HPS1-211ENST00000478087 CLEC10AQ8IUN9 316 aa15.7■□□□□ 0.1
HPS1-211ENST00000478087 TAOK2Q9UL54 1235 aa15.7■□□□□ 0.1
HPS1-211ENST00000478087 RLFQ13129 1914 aa15.7■□□□□ 0.1
HPS1-211ENST00000478087 A0A1W2PRG0 241 aa15.69■□□□□ 0.1
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