RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473515.5

SCML4-209, Transcript of Scm polycomb group protein like 4, human

TSL 2

Gene SCML4, Length 4,297 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SCML4-209	ENST00000473515	TNIP1	Q15025	636 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SCML4-209	ENST00000473515	TTC38	Q5R3I4	469 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SCML4-209	ENST00000473515	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
SCML4-209	ENST00000473515	TRMT44	Q8IYL2	757 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
SCML4-209	ENST00000473515	TIGD1	Q96MW7	591 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SCML4-209	ENST00000473515	HNRNPUL1	Q9BUJ2	856 aa	Known RBP eCLIP	10.64	□□□□□ -0.71
SCML4-209	ENST00000473515	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SCML4-209	ENST00000473515	TECPR2	O15040	1411 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SCML4-209	ENST00000473515	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SCML4-209	ENST00000473515	FGFR1OP	O95684	399 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
SCML4-209	ENST00000473515	CCDC175	P0C221	793 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SCML4-209	ENST00000473515	PFKFB1	P16118	471 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SCML4-209	ENST00000473515	ZSCAN20	P17040	1043 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
SCML4-209	ENST00000473515	MATR3	P43243	847 aa	Known RBP eCLIP	10.63	□□□□□ -0.71
SCML4-209	ENST00000473515	PNOC	Q13519	176 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SCML4-209	ENST00000473515	LCORL	Q8N3X6	602 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SCML4-209	ENST00000473515	MRFAP1L1	Q96HT8	127 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SCML4-209	ENST00000473515	MMRN2	Q9H8L6	949 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SCML4-209	ENST00000473515	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
SCML4-209	ENST00000473515	CUTA	O60888	179 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SCML4-209	ENST00000473515	PHACTR2	O75167	634 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SCML4-209	ENST00000473515	IL17RA	Q96F46	866 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SCML4-209	ENST00000473515	KCNQ2	O43526	872 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SCML4-209	ENST00000473515	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
SCML4-209	ENST00000473515	DPCR1	Q3MIW9	517 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SCML4-209	ENST00000473515	KRT79	Q5XKE5	535 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SCML4-209	ENST00000473515	EYA3	Q99504	573 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SCML4-209	ENST00000473515	SRRT	Q9BXP5	876 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
SCML4-209	ENST00000473515	KCNF1	Q9H3M0	494 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SCML4-209	ENST00000473515	INCENP	Q9NQS7	918 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SCML4-209	ENST00000473515	NFE2L3	Q9Y4A8	694 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SCML4-209	ENST00000473515	MYO1B	O43795	1136 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SCML4-209	ENST00000473515	AKR1B10	O60218	316 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SCML4-209	ENST00000473515	UBE4A	Q14139	1066 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SCML4-209	ENST00000473515	SCARF1	Q14162	830 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SCML4-209	ENST00000473515	NAA30	Q147X3	362 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
SCML4-209	ENST00000473515	ZNF569	Q5MCW4	686 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SCML4-209	ENST00000473515	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SCML4-209	ENST00000473515	PGBD1	Q96JS3	809 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SCML4-209	ENST00000473515	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SCML4-209	ENST00000473515	RHOXF2B	P0C7M4	288 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SCML4-209	ENST00000473515	GOLGA8H	P0CJ92	632 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SCML4-209	ENST00000473515	CHMP4BP1	P59074	171 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SCML4-209	ENST00000473515	REST	Q13127	1097 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SCML4-209	ENST00000473515	ZNF827	Q17R98	1081 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SCML4-209	ENST00000473515	RHOXF2	Q9BQY4	288 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SCML4-209	ENST00000473515	TSPYL1	Q9H0U9	437 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SCML4-209	ENST00000473515	ZMYM6	O95789	1325 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SCML4-209	ENST00000473515	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SCML4-209	ENST00000473515	APBA3	O96018	575 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SCML4-209	ENST00000473515	ERCC3	P19447	782 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SCML4-209	ENST00000473515	SPAG1	Q07617	926 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SCML4-209	ENST00000473515	NOSTRIN	Q8IVI9	506 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SCML4-209	ENST00000473515	ZSCAN10	Q96SZ4	725 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
SCML4-209	ENST00000473515	PALLD	Q8WX93	1383 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SCML4-209	ENST00000473515	TXK	P42681	527 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SCML4-209	ENST00000473515	ZYX	Q15942	572 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
SCML4-209	ENST00000473515	FUCA2	Q9BTY2	467 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SCML4-209	ENST00000473515	VPS16	Q9H269	839 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SCML4-209	ENST00000473515	IMPACT	Q9P2X3	320 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SCML4-209	ENST00000473515	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SCML4-209	ENST00000473515	SPDYE3	A6NKU9	549 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SCML4-209	ENST00000473515	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
SCML4-209	ENST00000473515	SCNN1D	P51172	638 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SCML4-209	ENST00000473515	FOXO4	P98177	505 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SCML4-209	ENST00000473515	DOK7	Q18PE1	504 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SCML4-209	ENST00000473515	GOLGA1	Q92805	767 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SCML4-209	ENST00000473515	CTAGE1	Q96RT6	745 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SCML4-209	ENST00000473515	ZSWIM5	Q9P217	1185 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SCML4-209	ENST00000473515	SERTAD1	Q9UHV2	236 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SCML4-209	ENST00000473515	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SCML4-209	ENST00000473515	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
SCML4-209	ENST00000473515	KCNA4	P22459	653 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SCML4-209	ENST00000473515	GABPB1	Q06547	395 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
SCML4-209	ENST00000473515	GOLGA8F	Q08AF8	430 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SCML4-209	ENST00000473515	GOLGA8DP	Q0D2H9	430 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SCML4-209	ENST00000473515	TAF4B	Q92750	862 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SCML4-209	ENST00000473515	DRC1	Q96MC2	740 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SCML4-209	ENST00000473515	RCOR1	Q9UKL0	485 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SCML4-209	ENST00000473515	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SCML4-209	ENST00000473515	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
SCML4-209	ENST00000473515	CCNT1	O60563	726 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
SCML4-209	ENST00000473515	TRIM37	O94972	964 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SCML4-209	ENST00000473515	TUBB4A	P04350	444 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SCML4-209	ENST00000473515	USP8	P40818	1118 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SCML4-209	ENST00000473515	ADK	P55263	362 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
SCML4-209	ENST00000473515	FCHSD1	Q86WN1	690 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SCML4-209	ENST00000473515	PNMA1	Q8ND90	353 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SCML4-209	ENST00000473515	GPKOW	Q92917	476 aa	Predicted RBP eCLIP	10.61	□□□□□ -0.71
SCML4-209	ENST00000473515	JADE2	Q9NQC1	790 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SCML4-209	ENST00000473515	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
SCML4-209	ENST00000473515	CTAGE15	A4D2H0	777 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SCML4-209	ENST00000473515	USO1	O60763	962 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
SCML4-209	ENST00000473515	TBCA	O75347	108 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
SCML4-209	ENST00000473515	CTAGE8	P0CG41	777 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SCML4-209	ENST00000473515	ARID5A	Q03989	594 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SCML4-209	ENST00000473515	UBXN1	Q04323	297 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SCML4-209	ENST00000473515	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
SCML4-209	ENST00000473515	CTAGE6	Q86UF2	777 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SCML4-209	ENST00000473515	FAM114A1	Q8IWE2	563 aa		10.6	□□□□□ -0.71

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