RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472491.1

NOM1-204, Transcript of nucleolar protein with MIF4G domain 1, humanhuman

TSL 3

Gene NOM1, Length 593 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOM1-204ENST00000472491 TNS4Q8IZW8 715 aa21.53■■□□□ 1.04
NOM1-204ENST00000472491 ZNF280CQ8ND82 737 aa21.53■■□□□ 1.04
NOM1-204ENST00000472491 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa21.53■■□□□ 1.04
NOM1-204ENST00000472491 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
NOM1-204ENST00000472491 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
NOM1-204ENST00000472491 GPR25O00155 361 aa21.52■■□□□ 1.04
NOM1-204ENST00000472491 CRHR2Q13324 411 aa21.52■■□□□ 1.04
NOM1-204ENST00000472491 GIMAP6Q6P9H5 292 aa21.52■■□□□ 1.04
NOM1-204ENST00000472491 GADL1Q6ZQY3 521 aa21.52■■□□□ 1.04
NOM1-204ENST00000472491 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
NOM1-204ENST00000472491 ANKRD23Q86SG2 305 aa21.52■■□□□ 1.04
NOM1-204ENST00000472491 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
NOM1-204ENST00000472491 CABP5Q9NP86 173 aa21.52■■□□□ 1.04
NOM1-204ENST00000472491 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
NOM1-204ENST00000472491 SWAP70Q9UH65 585 aa21.52■■□□□ 1.04
NOM1-204ENST00000472491 TAOK2Q9UL54 1235 aa21.52■■□□□ 1.04
NOM1-204ENST00000472491 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa21.52■■□□□ 1.04
NOM1-204ENST00000472491 PHIPQ8WWQ0 1821 aa21.51■■□□□ 1.03
NOM1-204ENST00000472491 GSG1L2A8MUP6 293 aa21.51■■□□□ 1.03
NOM1-204ENST00000472491 GH2P01242 217 aa21.51■■□□□ 1.03
NOM1-204ENST00000472491 TDO2P48775 406 aa21.51■■□□□ 1.03
NOM1-204ENST00000472491 GABPAQ06546 454 aa21.51■■□□□ 1.03
NOM1-204ENST00000472491 SPP2Q13103 211 aa21.51■■□□□ 1.03
NOM1-204ENST00000472491 ABCB5Q2M3G0 1257 aa21.51■■□□□ 1.03
NOM1-204ENST00000472491 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
NOM1-204ENST00000472491 C12orf60Q5U649 245 aa21.51■■□□□ 1.03
NOM1-204ENST00000472491 CTR9Q6PD62 1173 aa21.51■■□□□ 1.03
NOM1-204ENST00000472491 NACAP1Q9BZK3 213 aa21.51■■□□□ 1.03
NOM1-204ENST00000472491 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa21.51■■□□□ 1.03
NOM1-204ENST00000472491 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa21.5■■□□□ 1.03
NOM1-204ENST00000472491 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
NOM1-204ENST00000472491 FKTNO75072 461 aa21.5■■□□□ 1.03
NOM1-204ENST00000472491 PDE4AP27815 886 aa21.5■■□□□ 1.03
NOM1-204ENST00000472491 SHMT1P34896 483 aa21.5■■□□□ 1.03
NOM1-204ENST00000472491 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
NOM1-204ENST00000472491 DYNLL2Q96FJ2 89 aa21.5■■□□□ 1.03
NOM1-204ENST00000472491 HELLSQ9NRZ9 838 aa21.5■■□□□ 1.03
NOM1-204ENST00000472491 PDHXO00330 501 aa21.49■■□□□ 1.03
NOM1-204ENST00000472491 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
NOM1-204ENST00000472491 JAG1P78504 1218 aa21.49■■□□□ 1.03
NOM1-204ENST00000472491 EVX2Q03828 476 aa21.49■■□□□ 1.03
NOM1-204ENST00000472491 RAB3GAP1Q15042 981 aa21.49■■□□□ 1.03
NOM1-204ENST00000472491 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
NOM1-204ENST00000472491 WDR18Q9BV38 432 aa21.49■■□□□ 1.03
NOM1-204ENST00000472491 MINDY4BA8MYZ0 360 aa21.48■■□□□ 1.03
NOM1-204ENST00000472491 MOGSQ13724 837 aa21.48■■□□□ 1.03
NOM1-204ENST00000472491 SBK1Q52WX2 424 aa21.48■■□□□ 1.03
NOM1-204ENST00000472491 SLC44A5Q8NCS7 719 aa21.48■■□□□ 1.03
NOM1-204ENST00000472491 CDK8P49336 464 aa21.47■■□□□ 1.03
NOM1-204ENST00000472491 HMGCS2P54868 508 aa21.47■■□□□ 1.03
NOM1-204ENST00000472491 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa21.47■■□□□ 1.03
NOM1-204ENST00000472491 GPAT2Q6NUI2 795 aa21.47■■□□□ 1.03
NOM1-204ENST00000472491 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa21.47■■□□□ 1.03
NOM1-204ENST00000472491 C16orf86Q6ZW13 317 aa21.47■■□□□ 1.03
NOM1-204ENST00000472491 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
NOM1-204ENST00000472491 IFNL3Q8IZI9 196 aa21.47■■□□□ 1.03
NOM1-204ENST00000472491 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
NOM1-204ENST00000472491 TMOD4Q9NZQ9 345 aa21.47■■□□□ 1.03
NOM1-204ENST00000472491 PTPRFP10586 1907 aa21.47■■□□□ 1.03
NOM1-204ENST00000472491 USP17L10C9JJH3 530 aa21.46■■□□□ 1.03
NOM1-204ENST00000472491 HIP1O00291 1037 aa21.46■■□□□ 1.03
NOM1-204ENST00000472491 SDSP20132 328 aa21.46■■□□□ 1.03
NOM1-204ENST00000472491 BACE1P56817 501 aa21.46■■□□□ 1.03
NOM1-204ENST00000472491 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
NOM1-204ENST00000472491 MTMR2Q13614 643 aa21.46■■□□□ 1.03
NOM1-204ENST00000472491 FAM227BQ96M60 508 aa21.46■■□□□ 1.03
NOM1-204ENST00000472491 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
NOM1-204ENST00000472491 NAPBQ9H115 298 aa21.46■■□□□ 1.03
NOM1-204ENST00000472491 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
NOM1-204ENST00000472491 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa21.46■■□□□ 1.03
NOM1-204ENST00000472491 MYH8P13535 1937 aa21.46■■□□□ 1.03
NOM1-204ENST00000472491 A0A0D9SFI3 127 aa21.45■■□□□ 1.02
NOM1-204ENST00000472491 C19orf81C9J6K1 198 aa21.45■■□□□ 1.02
NOM1-204ENST00000472491 TLR2O60603 784 aa21.45■■□□□ 1.02
NOM1-204ENST00000472491 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP21.45■■□□□ 1.02
NOM1-204ENST00000472491 DGKZQ13574 1117 aa21.45■■□□□ 1.02
NOM1-204ENST00000472491 TTC22Q5TAA0 569 aa21.45■■□□□ 1.02
NOM1-204ENST00000472491 CCDC17Q96LX7 622 aa21.45■■□□□ 1.02
NOM1-204ENST00000472491 FEZ1Q99689 392 aa21.45■■□□□ 1.02
NOM1-204ENST00000472491 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa21.45■■□□□ 1.02
NOM1-204ENST00000472491 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa21.45■■□□□ 1.02
NOM1-204ENST00000472491 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
NOM1-204ENST00000472491 SP3Q02447 781 aa21.44■■□□□ 1.02
NOM1-204ENST00000472491 SH3D19Q5HYK7 790 aa21.44■■□□□ 1.02
NOM1-204ENST00000472491 TMEM179Q6ZVK1 233 aa21.44■■□□□ 1.02
NOM1-204ENST00000472491 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
NOM1-204ENST00000472491 STK11IPQ8N1F8 1099 aa21.44■■□□□ 1.02
NOM1-204ENST00000472491 ERO1AQ96HE7 468 aa21.44■■□□□ 1.02
NOM1-204ENST00000472491 MKNK2Q9HBH9 465 aa21.44■■□□□ 1.02
NOM1-204ENST00000472491 ZNF287Q9HBT7 754 aa21.44■■□□□ 1.02
NOM1-204ENST00000472491 SMIM22K7EJ46 135 aa21.43■■□□□ 1.02
NOM1-204ENST00000472491 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
NOM1-204ENST00000472491 SEPT2Q15019 361 aa21.43■■□□□ 1.02
NOM1-204ENST00000472491 CCDC136Q96JN2 1154 aa21.43■■□□□ 1.02
NOM1-204ENST00000472491 PNMA3Q9UL41 463 aa21.43■■□□□ 1.02
NOM1-204ENST00000472491 CYP2C8P10632 490 aa21.42■■□□□ 1.02
NOM1-204ENST00000472491 TREML2Q5T2D2 321 aa21.42■■□□□ 1.02
NOM1-204ENST00000472491 USP17L2Q6R6M4 530 aa21.42■■□□□ 1.02
NOM1-204ENST00000472491 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
NOM1-204ENST00000472491 LOC285556D6RIA3 1793 aa21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms