RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467683.5

UBE2Q1-202, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

TSL 5

Gene UBE2Q1, Length 370 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1-202ENST00000467683 NEUROD6Q96NK8 337 aa14.2□□□□□ -0.14
UBE2Q1-202ENST00000467683 MTMR10Q9NXD2 777 aa14.2□□□□□ -0.14
UBE2Q1-202ENST00000467683 RAI14Q9P0K7 980 aa14.2□□□□□ -0.14
UBE2Q1-202ENST00000467683 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP14.2□□□□□ -0.14
UBE2Q1-202ENST00000467683 PFASO15067 1338 aa14.19□□□□□ -0.14
UBE2Q1-202ENST00000467683 BAG3O95817 575 aa14.19□□□□□ -0.14
UBE2Q1-202ENST00000467683 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa14.19□□□□□ -0.14
UBE2Q1-202ENST00000467683 COL6A1P12109 1028 aa14.19□□□□□ -0.14
UBE2Q1-202ENST00000467683 RGS2P41220 211 aa14.19□□□□□ -0.14
UBE2Q1-202ENST00000467683 HERVK_113P62684 666 aa14.19□□□□□ -0.14
UBE2Q1-202ENST00000467683 MEIS3Q99687 375 aa14.19□□□□□ -0.14
UBE2Q1-202ENST00000467683 LRP2BPQ9P2M1 347 aa14.19□□□□□ -0.14
UBE2Q1-202ENST00000467683 USP17L10C9JJH3 530 aa14.18□□□□□ -0.14
UBE2Q1-202ENST00000467683 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP14.18□□□□□ -0.14
UBE2Q1-202ENST00000467683 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP14.18□□□□□ -0.14
UBE2Q1-202ENST00000467683 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP14.18□□□□□ -0.14
UBE2Q1-202ENST00000467683 APBA2Q99767 749 aa14.18□□□□□ -0.14
UBE2Q1-202ENST00000467683 TRIM34Q9BYJ4 488 aa14.18□□□□□ -0.14
UBE2Q1-202ENST00000467683 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP14.18□□□□□ -0.14
UBE2Q1-202ENST00000467683 ERVK-9P63128 1117 aa14.17□□□□□ -0.14
UBE2Q1-202ENST00000467683 ERVK-24P63145 666 aa14.17□□□□□ -0.14
UBE2Q1-202ENST00000467683 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP14.17□□□□□ -0.14
UBE2Q1-202ENST00000467683 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP14.17□□□□□ -0.14
UBE2Q1-202ENST00000467683 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa14.17□□□□□ -0.14
UBE2Q1-202ENST00000467683 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa14.17□□□□□ -0.14
UBE2Q1-202ENST00000467683 Q7L0L9 218 aa14.17□□□□□ -0.14
UBE2Q1-202ENST00000467683 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP14.17□□□□□ -0.14
UBE2Q1-202ENST00000467683 USP6NLQ92738 828 aa14.17□□□□□ -0.14
UBE2Q1-202ENST00000467683 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP14.17□□□□□ -0.14
UBE2Q1-202ENST00000467683 TXNRD2Q9NNW7 524 aa14.17□□□□□ -0.14
UBE2Q1-202ENST00000467683 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP14.16□□□□□ -0.14
UBE2Q1-202ENST00000467683 CCNA1P78396 465 aa14.16□□□□□ -0.14
UBE2Q1-202ENST00000467683 MORN1Q5T089 497 aa14.16□□□□□ -0.14
UBE2Q1-202ENST00000467683 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP14.16□□□□□ -0.14
UBE2Q1-202ENST00000467683 PI16Q6UXB8 463 aa14.16□□□□□ -0.14
UBE2Q1-202ENST00000467683 GPR142Q7Z601 462 aa14.16□□□□□ -0.14
UBE2Q1-202ENST00000467683 PLEKHH3Q7Z736 793 aa14.16□□□□□ -0.14
UBE2Q1-202ENST00000467683 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP14.16□□□□□ -0.14
UBE2Q1-202ENST00000467683 ARHGAP45Q92619 1136 aa14.16□□□□□ -0.14
UBE2Q1-202ENST00000467683 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP14.16□□□□□ -0.14
UBE2Q1-202ENST00000467683 MSCO60682 206 aa14.15□□□□□ -0.14
UBE2Q1-202ENST00000467683 HLA-DOAP06340 250 aa14.15□□□□□ -0.14
UBE2Q1-202ENST00000467683 MCAMP43121 646 aa14.15□□□□□ -0.14
UBE2Q1-202ENST00000467683 PPP4CP60510 307 aa14.15□□□□□ -0.14
UBE2Q1-202ENST00000467683 LHX8Q68G74 356 aa14.15□□□□□ -0.14
UBE2Q1-202ENST00000467683 USP17L2Q6R6M4 530 aa14.15□□□□□ -0.14
UBE2Q1-202ENST00000467683 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP14.15□□□□□ -0.14
UBE2Q1-202ENST00000467683 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP14.15□□□□□ -0.14
UBE2Q1-202ENST00000467683 RBPJLQ9UBG7 517 aa14.15□□□□□ -0.14
UBE2Q1-202ENST00000467683 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa14.15□□□□□ -0.14
UBE2Q1-202ENST00000467683 VCANP13611 3396 aa14.15□□□□□ -0.14
UBE2Q1-202ENST00000467683 RLFQ13129 1914 aa14.15□□□□□ -0.14
UBE2Q1-202ENST00000467683 LTBP2Q14767 1821 aa14.15□□□□□ -0.14
UBE2Q1-202ENST00000467683 FLT1P17948 1338 aa14.15□□□□□ -0.15
UBE2Q1-202ENST00000467683 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP14.14□□□□□ -0.15
UBE2Q1-202ENST00000467683 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP14.14□□□□□ -0.15
UBE2Q1-202ENST00000467683 LRRC26Q2I0M4 334 aa14.14□□□□□ -0.15
UBE2Q1-202ENST00000467683 MFSD14CQ5VZR4 134 aa14.14□□□□□ -0.15
UBE2Q1-202ENST00000467683 CERS3Q8IU89 383 aa14.14□□□□□ -0.15
UBE2Q1-202ENST00000467683 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa14.14□□□□□ -0.15
UBE2Q1-202ENST00000467683 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP14.14□□□□□ -0.15
UBE2Q1-202ENST00000467683 PAGR1Q9BTK6 254 aa14.14□□□□□ -0.15
UBE2Q1-202ENST00000467683 PORCNQ9H237 461 aa14.14□□□□□ -0.15
UBE2Q1-202ENST00000467683 DNAJC18Q9H819 358 aa14.14□□□□□ -0.15
UBE2Q1-202ENST00000467683 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa14.14□□□□□ -0.15
UBE2Q1-202ENST00000467683 ZNF236Q9UL36 1845 aa14.13□□□□□ -0.15
UBE2Q1-202ENST00000467683 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP14.13□□□□□ -0.15
UBE2Q1-202ENST00000467683 MAP2K5Q13163 448 aa14.13□□□□□ -0.15
UBE2Q1-202ENST00000467683 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa14.13□□□□□ -0.15
UBE2Q1-202ENST00000467683 CDCA7LQ96GN5 454 aa14.13□□□□□ -0.15
UBE2Q1-202ENST00000467683 C12orf42Q96LP6 360 aa14.13□□□□□ -0.15
UBE2Q1-202ENST00000467683 MYH8P13535 1937 aa14.12□□□□□ -0.15
UBE2Q1-202ENST00000467683 GDF11O95390 407 aa14.12□□□□□ -0.15
UBE2Q1-202ENST00000467683 GNAI2P04899 355 aa14.12□□□□□ -0.15
UBE2Q1-202ENST00000467683 USP14P54578 494 aa14.12□□□□□ -0.15
UBE2Q1-202ENST00000467683 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP14.12□□□□□ -0.15
UBE2Q1-202ENST00000467683 CCL14Q16627 93 aa14.12□□□□□ -0.15
UBE2Q1-202ENST00000467683 Q3C1V9 767 aa14.12□□□□□ -0.15
UBE2Q1-202ENST00000467683 CCDC158Q5M9N0 1113 aa14.12□□□□□ -0.15
UBE2Q1-202ENST00000467683 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP14.12□□□□□ -0.15
UBE2Q1-202ENST00000467683 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP14.12□□□□□ -0.15
UBE2Q1-202ENST00000467683 GPR108Q9NPR9 543 aa14.12□□□□□ -0.15
UBE2Q1-202ENST00000467683 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa14.12□□□□□ -0.15
UBE2Q1-202ENST00000467683 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP14.12□□□□□ -0.15
UBE2Q1-202ENST00000467683 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa14.12□□□□□ -0.15
UBE2Q1-202ENST00000467683 SLC15A5A6NIM6 579 aa14.11□□□□□ -0.15
UBE2Q1-202ENST00000467683 USP17L15C9J2P7 530 aa14.11□□□□□ -0.15
UBE2Q1-202ENST00000467683 USP17L13C9JLJ4 530 aa14.11□□□□□ -0.15
UBE2Q1-202ENST00000467683 USP17L11C9JVI0 530 aa14.11□□□□□ -0.15
UBE2Q1-202ENST00000467683 USP17L18D6R9N7 530 aa14.11□□□□□ -0.15
UBE2Q1-202ENST00000467683 USP17L22D6RA61 530 aa14.11□□□□□ -0.15
UBE2Q1-202ENST00000467683 USP17L17D6RBQ6 530 aa14.11□□□□□ -0.15
UBE2Q1-202ENST00000467683 USP17L19D6RCP7 530 aa14.11□□□□□ -0.15
UBE2Q1-202ENST00000467683 USP17L20D6RJB6 530 aa14.11□□□□□ -0.15
UBE2Q1-202ENST00000467683 POTEB2H3BUK9 544 aa14.11□□□□□ -0.15
UBE2Q1-202ENST00000467683 HOXC6P09630 235 aa14.11□□□□□ -0.15
UBE2Q1-202ENST00000467683 JAG1P78504 1218 aa14.11□□□□□ -0.15
UBE2Q1-202ENST00000467683 USP17L24Q0WX57 530 aa14.11□□□□□ -0.15
UBE2Q1-202ENST00000467683 TTC39AQ5SRH9 613 aa14.11□□□□□ -0.15
UBE2Q1-202ENST00000467683 LBX2Q6XYB7 198 aa14.11□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.8 ms