RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464936.5

CEP170-209, Transcript of centrosomal protein 170, human

TSL 5

Gene CEP170, Length 741 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CEP170-209	ENST00000464936	MRPL18	Q9H0U6	180 aa	Known RBP	6.36	□□□□□ -1.39
CEP170-209	ENST00000464936	FAM13B	Q9NYF5	915 aa		6.36	□□□□□ -1.39
CEP170-209	ENST00000464936	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	6.36	□□□□□ -1.39
CEP170-209	ENST00000464936	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		6.36	□□□□□ -1.39
CEP170-209	ENST00000464936	ABCC6	O95255	1503 aa		6.35	□□□□□ -1.39
CEP170-209	ENST00000464936	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		6.35	□□□□□ -1.39
CEP170-209	ENST00000464936	HYAL3	O43820	417 aa	Predicted RBP	6.35	□□□□□ -1.39
CEP170-209	ENST00000464936	ICMT	O60725	284 aa		6.35	□□□□□ -1.39
CEP170-209	ENST00000464936	ATP11A	P98196	1134 aa		6.35	□□□□□ -1.39
CEP170-209	ENST00000464936	HYAL2	Q12891	473 aa		6.35	□□□□□ -1.39
CEP170-209	ENST00000464936	GTF3C2	Q8WUA4	911 aa	Predicted RBP	6.35	□□□□□ -1.39
CEP170-209	ENST00000464936	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		6.35	□□□□□ -1.39
CEP170-209	ENST00000464936	FNDC3A	Q9Y2H6	1198 aa	Known RBP	6.35	□□□□□ -1.39
CEP170-209	ENST00000464936	PPME1	Q9Y570	386 aa		6.35	□□□□□ -1.39
CEP170-209	ENST00000464936	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		6.35	□□□□□ -1.39
CEP170-209	ENST00000464936	PAPPA	Q13219	1627 aa		6.35	□□□□□ -1.39
CEP170-209	ENST00000464936	BTAF1	O14981	1849 aa		6.34	□□□□□ -1.39
CEP170-209	ENST00000464936	COL18A1	P39060	1754 aa		6.34	□□□□□ -1.39
CEP170-209	ENST00000464936	FAM177B	A6PVY3	158 aa		6.34	□□□□□ -1.39
CEP170-209	ENST00000464936	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	6.34	□□□□□ -1.39
CEP170-209	ENST00000464936	SOX18	P35713	384 aa		6.34	□□□□□ -1.39
CEP170-209	ENST00000464936	SETDB1	Q15047	1291 aa		6.34	□□□□□ -1.39
CEP170-209	ENST00000464936	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	6.34	□□□□□ -1.39
CEP170-209	ENST00000464936	PRR23C	Q6ZRP0	262 aa		6.34	□□□□□ -1.39
CEP170-209	ENST00000464936	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	6.34	□□□□□ -1.39
CEP170-209	ENST00000464936	GLYCTK	Q8IVS8	523 aa		6.34	□□□□□ -1.39
CEP170-209	ENST00000464936	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	6.34	□□□□□ -1.39
CEP170-209	ENST00000464936	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		6.34	□□□□□ -1.39
CEP170-209	ENST00000464936	SEPT3	Q9UH03	358 aa		6.34	□□□□□ -1.39
CEP170-209	ENST00000464936	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		6.34	□□□□□ -1.39
CEP170-209	ENST00000464936	ADCY9	O60503	1353 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CEP170-209	ENST00000464936	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	6.33	□□□□□ -1.4
CEP170-209	ENST00000464936	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CEP170-209	ENST00000464936	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CEP170-209	ENST00000464936	RBM47	A0AV96	593 aa	Known RBP	6.33	□□□□□ -1.4
CEP170-209	ENST00000464936		E9PSI1	815 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CEP170-209	ENST00000464936		F8W735	103 aa	Predicted RBP	6.33	□□□□□ -1.4
CEP170-209	ENST00000464936		H3BRB1	525 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CEP170-209	ENST00000464936	TNFRSF10B	O14763	440 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CEP170-209	ENST00000464936	SMNDC1	O75940	238 aa	Known RBP eCLIP	6.33	□□□□□ -1.4
CEP170-209	ENST00000464936	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	6.33	□□□□□ -1.4
CEP170-209	ENST00000464936	ZNF211	Q13398	564 aa	Predicted RBP	6.33	□□□□□ -1.4
CEP170-209	ENST00000464936	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	6.33	□□□□□ -1.4
CEP170-209	ENST00000464936	NCAPG2	Q86XI2	1143 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CEP170-209	ENST00000464936	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	6.33	□□□□□ -1.4
CEP170-209	ENST00000464936	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CEP170-209	ENST00000464936	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	6.33	□□□□□ -1.4
CEP170-209	ENST00000464936	TUT1	Q9H6E5	874 aa	Known RBP	6.33	□□□□□ -1.4
CEP170-209	ENST00000464936	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CEP170-209	ENST00000464936	STIM2	Q9P246	746 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CEP170-209	ENST00000464936	RGPD5	Q99666	1765 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CEP170-209	ENST00000464936	PIK3C2A	O00443	1686 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CEP170-209	ENST00000464936	USP47	Q96K76	1375 aa		6.32	□□□□□ -1.4
CEP170-209	ENST00000464936	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		6.32	□□□□□ -1.4
CEP170-209	ENST00000464936	ZBTB39	O15060	712 aa		6.32	□□□□□ -1.4
CEP170-209	ENST00000464936	TOMM70	O94826	608 aa		6.32	□□□□□ -1.4
CEP170-209	ENST00000464936	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	6.32	□□□□□ -1.4
CEP170-209	ENST00000464936	SSTR4	P31391	388 aa		6.32	□□□□□ -1.4
CEP170-209	ENST00000464936	ACAD11	Q709F0	780 aa		6.32	□□□□□ -1.4
CEP170-209	ENST00000464936	ATCAY	Q86WG3	371 aa		6.32	□□□□□ -1.4
CEP170-209	ENST00000464936	OR13H1	Q8NG92	308 aa		6.32	□□□□□ -1.4
CEP170-209	ENST00000464936	KRTAP4-8	Q9BYQ9	185 aa		6.32	□□□□□ -1.4
CEP170-209	ENST00000464936	RASSF4	Q9H2L5	321 aa		6.32	□□□□□ -1.4
CEP170-209	ENST00000464936	PCMTD2	Q9NV79	361 aa		6.32	□□□□□ -1.4
CEP170-209	ENST00000464936	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		6.31	□□□□□ -1.4
CEP170-209	ENST00000464936	NFAT5	O94916	1531 aa		6.31	□□□□□ -1.4
CEP170-209	ENST00000464936	FST	P19883	344 aa		6.31	□□□□□ -1.4
CEP170-209	ENST00000464936	CDC27	P30260	824 aa		6.31	□□□□□ -1.4
CEP170-209	ENST00000464936	ECM1	Q16610	540 aa		6.31	□□□□□ -1.4
CEP170-209	ENST00000464936	FAM117B	Q6P1L5	589 aa		6.31	□□□□□ -1.4
CEP170-209	ENST00000464936	MAP4K3	Q8IVH8	894 aa		6.31	□□□□□ -1.4
CEP170-209	ENST00000464936	GALNT11	Q8NCW6	608 aa		6.31	□□□□□ -1.4
CEP170-209	ENST00000464936	TTC16	Q8NEE8	873 aa		6.31	□□□□□ -1.4
CEP170-209	ENST00000464936	HELQ	Q8TDG4	1101 aa		6.31	□□□□□ -1.4
CEP170-209	ENST00000464936	MUC3B	Q9H195	1237 aa		6.31	□□□□□ -1.4
CEP170-209	ENST00000464936	ABI2	Q9NYB9	513 aa	Predicted RBP	6.31	□□□□□ -1.4
CEP170-209	ENST00000464936	KANSL3	Q9P2N6	904 aa		6.31	□□□□□ -1.4
CEP170-209	ENST00000464936	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CEP170-209	ENST00000464936	USP54	Q70EL1	1684 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CEP170-209	ENST00000464936	FAM13A	O94988	1023 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CEP170-209	ENST00000464936	NPR3	P17342	541 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CEP170-209	ENST00000464936	CD68	P34810	354 aa	Predicted RBP	6.3	□□□□□ -1.4
CEP170-209	ENST00000464936	PRELP	P51888	382 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CEP170-209	ENST00000464936	AAMP	Q13685	434 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CEP170-209	ENST00000464936	C8orf34	Q49A92	452 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CEP170-209	ENST00000464936	ZNF438	Q7Z4V0	828 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CEP170-209	ENST00000464936	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	6.3	□□□□□ -1.4
CEP170-209	ENST00000464936	NME9	Q86XW9	330 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CEP170-209	ENST00000464936	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	6.3	□□□□□ -1.4
CEP170-209	ENST00000464936	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CEP170-209	ENST00000464936	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	6.3	□□□□□ -1.4
CEP170-209	ENST00000464936	TMC1	Q8TDI8	760 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CEP170-209	ENST00000464936	SRA1	Q9HD15	236 aa	Known RBP	6.3	□□□□□ -1.4
CEP170-209	ENST00000464936	SH2B1	Q9NRF2	756 aa	Predicted RBP	6.3	□□□□□ -1.4
CEP170-209	ENST00000464936	RNF112	Q9ULX5	631 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CEP170-209	ENST00000464936	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CEP170-209	ENST00000464936	DDX3Y	O15523	660 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
CEP170-209	ENST00000464936	WISP1	O95388	367 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CEP170-209	ENST00000464936	AMPH	P49418	695 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CEP170-209	ENST00000464936	ARHGAP4	P98171	946 aa		6.29	□□□□□ -1.4

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